More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3956 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3942  formate dehydrogenase  99.58 
 
 		 721 aa  1454    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2249  formate dehydrogenase  76.5 
 
 		 720 aa  1113    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.404887  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3956  formate dehydrogenase  100 
 
 		 721 aa  1457    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923262  decreased coverage  0.00564803 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4016  formate dehydrogenase  99.58 
 
 		 721 aa  1454    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4442  molydopterin dinucleotide-binding region  77.58 
 
 		 720 aa  1150    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1074  molybdopterin oxidoreductase  31.8 
 
 		 717 aa  370  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2187  molybdopterin oxidoreductase  37.03 
 
 		 725 aa  366  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000199348  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1613  putative oxidoreductase  34.98 
 
 		 702 aa  366  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2236  formate dehydrogenase  31.66 
 
 		 726 aa  365  1e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03498  Anaerobic dehydrogenase  31.64 
 
 		 729 aa  362  2e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1497  molydopterin dinucleotide-binding region  32.15 
 
 		 713 aa  361  2e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18640  putative oxidoreductase  35.07 
 
 		 702 aa  360  4e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0882727 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2925  molydopterin dinucleotide-binding region  33.1 
 
 		 691 aa  357  2.9999999999999997e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2055  formate dehydrogenase  36.26 
 
 		 733 aa  357  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3340  molydopterin dinucleotide-binding region  34.87 
 
 		 702 aa  355  1e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203215  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1990  molybdopterin oxidoreductase  35.96 
 
 		 743 aa  354  4e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3899  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  33.52 
 
 		 702 aa  353  5e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4525  molybdopterin oxidoreductase  33.52 
 
 		 701 aa  350  4e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0840542 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2009  formate dehydrogenase  36.15 
 
 		 715 aa  347  5e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1109  molydopterin dinucleotide-binding region  34.11 
 
 		 702 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4162  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  32.87 
 
 		 732 aa  344  4e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1080  molydopterin dinucleotide-binding region  33.52 
 
 		 702 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.753131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4332  molydopterin dinucleotide-binding region  33.56 
 
 		 702 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1121  molydopterin dinucleotide-binding region  33.51 
 
 		 702 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.103516  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3610  molybdopterin dinucleotide-binding region  36.04 
 
 		 733 aa  338  1.9999999999999998e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.992314  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2405  molydopterin dinucleotide-binding region  30.2 
 
 		 1299 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.598133  hitchhiker  0.00155962 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2947  molydopterin dinucleotide-binding region  35.99 
 
 		 731 aa  337  3.9999999999999995e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.975721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5376  molydopterin dinucleotide-binding region  34.54 
 
 		 739 aa  337  5e-91  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00550563 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2776  molydopterin dinucleotide-binding region  33.94 
 
 		 687 aa  336  1e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1413  molydopterin dinucleotide-binding region  34.63 
 
 		 739 aa  335  1e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.395603  normal  0.324246 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4810  molybdopterin dinucleotide-binding region  34.44 
 
 		 739 aa  332  2e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2565  molybdopterin oxidoreductase  34.76 
 
 		 747 aa  331  3e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0260966 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2059  molybdopterin oxidoreductase  30.01 
 
 		 704 aa  323  5e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0167  molydopterin dinucleotide-binding region  29.88 
 
 		 741 aa  319  1e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6518  molybdopterin dinucleotide-binding region  32.56 
 
 		 773 aa  315  1.9999999999999998e-84  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4342  molydopterin dinucleotide-binding region  31.58 
 
 		 727 aa  314  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.303774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0643  formate dehydrogenase  29.95 
 
 		 764 aa  307  4.0000000000000004e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2003  molybdopterin oxidoreductase  31.67 
 
 		 726 aa  303  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447732 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0816  molybdopterin dinucleotide-binding region  33.11 
 
 		 732 aa  301  2e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3848  molybdopterin oxidoreductase  32.43 
 
 		 738 aa  298  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0515  molybdopterin dinucleotide-binding region  33.2 
 
 		 721 aa  281  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1721  molydopterin dinucleotide-binding region  31.86 
 
 		 753 aa  278  3e-73  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4457  molydopterin dinucleotide-binding region  31.26 
 
 		 757 aa  263  1e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1612  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.61 
 
 		 773 aa  253  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.915489  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1387  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.61 
 
 		 804 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.397965  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3201  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.61 
 
 		 777 aa  253  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.938387  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2114  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.61 
 
 		 804 aa  252  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2639  molybdopterin oxidoreductase family protein  30.47 
 
 		 849 aa  249  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2551  molybdopterin oxidoreductase  30.47 
 
 		 777 aa  249  9e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.163664  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2497  molybdopterin oxidoreductase  30.47 
 
 		 804 aa  249  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.512402  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1621  nitrate reductase  29.45 
 
 		 746 aa  248  4e-64  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.161606  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1975  molybdopterin oxidoreductase family protein  29.5 
 
 		 769 aa  233  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.595995  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0588  molybdopterin oxidoreductase  30.47 
 
 		 671 aa  225  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1778  molydopterin dinucleotide-binding region  30.09 
 
 		 738 aa  224  4.9999999999999996e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2648  molybdopterin oxidoreductase  26.32 
 
 		 747 aa  223  7e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.104156  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  29.83 
 
 		 745 aa  209  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10199  oxidoreductase  26.84 
 
 		 749 aa  205  2e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.29998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3010  formate dehydrogenase  27.56 
 
 		 754 aa  206  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189553  normal  0.616096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5802  molybdopterin oxidoreductase  33.96 
 
 		 768 aa  204  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.203441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4198  formate dehydrogenase  29.77 
 
 		 679 aa  204  6e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.100839  normal  0.216188 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.33 
 
 		 668 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29050  putative molybdopterin oxidoreductase  27.63 
 
 		 769 aa  198  3e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000388245 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  26.69 
 
 		 692 aa  196  2e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.21 
 
 		 904 aa  193  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  27.2 
 
 		 722 aa  191  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  25 
 
 		 677 aa  190  5.999999999999999e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.41 
 
 		 689 aa  190  5.999999999999999e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  27.13 
 
 		 711 aa  190  8e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.74 
 
 		 688 aa  188  3e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.8 
 
 		 900 aa  187  4e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3288  formate dehydrogenase  26.03 
 
 		 753 aa  186  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.138891  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2751  formate dehydrogenase  26.59 
 
 		 752 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.215233  normal  0.0781523 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.51 
 
 		 893 aa  185  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0923  molybdopterin oxidoreductase  27.26 
 
 		 621 aa  185  3e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000000000228459 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2721  formate dehydrogenase  26.08 
 
 		 752 aa  183  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.94379  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4258  molybdopterin oxidoreductase  28.87 
 
 		 714 aa  182  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.650398  hitchhiker  0.00325802 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2765  formate dehydrogenase  26.08 
 
 		 752 aa  183  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  27.29 
 
 		 891 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  25.95 
 
 		 673 aa  181  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.91 
 
 		 920 aa  181  4.999999999999999e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  28.42 
 
 		 759 aa  180  5.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0413  molybdopterin oxidoreductase  29.86 
 
 		 762 aa  180  7e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.535153  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1289  molybdopterin oxidoreductase  25.53 
 
 		 758 aa  180  9e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  26.24 
 
 		 691 aa  179  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.51 
 
 		 674 aa  180  1e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  26.3 
 
 		 1143 aa  180  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.07 
 
 		 674 aa  178  3e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  26.52 
 
 		 691 aa  178  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0546  molybdopterin oxidoreductase  26.32 
 
 		 1409 aa  178  3e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1709  assimilatory nitrate reductase (NADH) alpha subunit apoprotein  28.31 
 
 		 874 aa  177  6e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.53 
 
 		 674 aa  177  7e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4582  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.35 
 
 		 989 aa  177  9e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.656955 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1567  molybdopterin oxidoreductase  27.18 
 
 		 803 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  26.57 
 
 		 698 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6171  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.94 
 
 		 989 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.796652 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  26.24 
 
 		 685 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  26.2 
 
 		 1139 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  25.57 
 
 		 691 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2797  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.99 
 
 		 961 aa  175  2.9999999999999996e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.265518  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5043  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.16 
 
 		 989 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.331865  normal  0.361747 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>