More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0923 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0923  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
621 aa  1239    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  decreased coverage  0.000000000228459 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.6 
 
 
686 aa  580  1e-164  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.84 
 
 
688 aa  561  1e-158  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  43.03 
 
 
695 aa  554  1e-156  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.38 
 
 
688 aa  549  1e-155  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.48 
 
 
688 aa  546  1e-154  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  43.83 
 
 
689 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.63 
 
 
687 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  43.41 
 
 
687 aa  531  1e-149  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.09 
 
 
674 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.97 
 
 
677 aa  514  1e-144  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.28 
 
 
676 aa  509  1e-143  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.65 
 
 
676 aa  508  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.97 
 
 
676 aa  506  9.999999999999999e-143  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.94 
 
 
674 aa  502  1e-141  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.62 
 
 
674 aa  499  1e-140  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.62 
 
 
674 aa  499  1e-140  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1833  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.6 
 
 
687 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00515495  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.49 
 
 
688 aa  490  1e-137  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.27 
 
 
689 aa  474  1e-132  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.91 
 
 
893 aa  454  1.0000000000000001e-126  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.09 
 
 
686 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.04 
 
 
917 aa  444  1e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.06 
 
 
685 aa  443  1e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.69 
 
 
904 aa  444  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.29 
 
 
879 aa  441  9.999999999999999e-123  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.34 
 
 
900 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  37.85 
 
 
899 aa  434  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.71 
 
 
893 aa  430  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  37.03 
 
 
745 aa  427  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.43 
 
 
893 aa  426  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.96 
 
 
898 aa  422  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.38 
 
 
920 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.75 
 
 
1428 aa  398  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.24 
 
 
900 aa  396  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.17 
 
 
1424 aa  392  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3198  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.27 
 
 
1432 aa  390  1e-107  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.554904 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.88 
 
 
1421 aa  392  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1238  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.12 
 
 
721 aa  389  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.768724  normal  0.0266527 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.95 
 
 
685 aa  392  1e-107  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.32 
 
 
901 aa  387  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.74 
 
 
1406 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.62 
 
 
668 aa  385  1e-106  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0641  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.26 
 
 
979 aa  385  1e-105  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.04 
 
 
906 aa  385  1e-105  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  35.75 
 
 
1387 aa  384  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.66 
 
 
1432 aa  383  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.24 
 
 
1425 aa  384  1e-105  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  36.04 
 
 
1412 aa  382  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0825  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.66 
 
 
1432 aa  381  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00541451 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03951  formate dehydrogenase-H, selenopolypeptide subunit  33.43 
 
 
715 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.803476  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.85 
 
 
911 aa  377  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  35.34 
 
 
1385 aa  377  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03911  hypothetical protein  33.43 
 
 
715 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.988265  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3948  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.59 
 
 
715 aa  376  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.73 
 
 
1425 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.73 
 
 
1425 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4324  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  33.59 
 
 
715 aa  376  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4542  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  33.59 
 
 
715 aa  376  1e-103  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.86 
 
 
1440 aa  378  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0464  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.06 
 
 
987 aa  378  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3913  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.28 
 
 
715 aa  373  1e-102  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3829  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.11 
 
 
715 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0729  formate dehydrogenase H  34.96 
 
 
715 aa  375  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.708724 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3682  anaerobic formate dehydrogenase, alpha subunit, -type  35.11 
 
 
715 aa  374  1e-102  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.13 
 
 
905 aa  373  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0843  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.12 
 
 
994 aa  372  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1268  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.74 
 
 
716 aa  372  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.424555  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2721  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.11 
 
 
716 aa  369  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0016187  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0324  formate dehydrogenase alpha subunit  33.9 
 
 
713 aa  369  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.48 
 
 
1410 aa  371  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1318  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.24 
 
 
973 aa  368  1e-100  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.1 
 
 
886 aa  368  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2424  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.23 
 
 
718 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.680227 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1753  formate dehydrogenase alpha subunit  34.84 
 
 
716 aa  367  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0179443  hitchhiker  0.000996092 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0685  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.49 
 
 
718 aa  365  1e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1339  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.74 
 
 
662 aa  365  1e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4746  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.13 
 
 
1111 aa  363  4e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.879601  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4578  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.69 
 
 
723 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1781  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.05 
 
 
716 aa  361  2e-98  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1341  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.18 
 
 
987 aa  360  5e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4642  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.42 
 
 
886 aa  355  2e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0800652  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3566  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.42 
 
 
886 aa  355  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0757584 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.33 
 
 
1440 aa  355  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0031  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.11 
 
 
1000 aa  355  2e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1383  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.59 
 
 
716 aa  353  5e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.627092  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.97 
 
 
724 aa  351  2e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3190  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.76 
 
 
924 aa  351  2e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.523924  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0255  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.38 
 
 
952 aa  348  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0971632  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2746  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.45 
 
 
1004 aa  348  2e-94  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.94455  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1038  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.98 
 
 
1130 aa  347  3e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.76 
 
 
925 aa  347  5e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5226  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.67 
 
 
988 aa  347  5e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2249  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.01 
 
 
903 aa  346  6e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.580662  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8358  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.67 
 
 
988 aa  346  6e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3281  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.02 
 
 
979 aa  346  8e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2964  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.38 
 
 
984 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3012  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  33.38 
 
 
984 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.467116  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1622  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.59 
 
 
984 aa  345  1e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.437101  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.21 
 
 
927 aa  345  2e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>