More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1581 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  45.25 
 
 		 711 aa  639    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  65.32 
 
 		 1139 aa  1514    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  100 
 
 		 1135 aa  2337    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  65.32 
 
 		 1143 aa  1483    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  53.76 
 
 		 398 aa  373  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  47.58 
 
 		 392 aa  369  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  49.46 
 
 		 396 aa  359  9.999999999999999e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  46.38 
 
 		 382 aa  359  1.9999999999999998e-97  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0764  aminotransferase, class V  48.78 
 
 		 414 aa  359  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561511  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  49.73 
 
 		 388 aa  359  1.9999999999999998e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  47.73 
 
 		 394 aa  358  5e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1914  aminotransferase, class V  47.8 
 
 		 399 aa  357  5e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  47.52 
 
 		 384 aa  356  1e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  47.44 
 
 		 394 aa  355  4e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  47.86 
 
 		 392 aa  355  4e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  48.39 
 
 		 400 aa  353  8e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  47.78 
 
 		 384 aa  353  1e-95  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  48.12 
 
 		 382 aa  353  1e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  47.79 
 
 		 400 aa  352  2e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  49.46 
 
 		 389 aa  350  9e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2753  molydopterin dinucleotide-binding region  33.69 
 
 		 749 aa  350  1e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.28964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  50.41 
 
 		 379 aa  350  1e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  47.67 
 
 		 389 aa  349  2e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  49.04 
 
 		 389 aa  348  4e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1932  cysteine desulfurase NifS  48.65 
 
 		 393 aa  346  2e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  48.53 
 
 		 400 aa  345  2e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  48.18 
 
 		 402 aa  345  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  47.87 
 
 		 394 aa  345  2.9999999999999997e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  47.14 
 
 		 391 aa  344  5.999999999999999e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  48.28 
 
 		 394 aa  344  5.999999999999999e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  46.56 
 
 		 398 aa  344  7e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  48.12 
 
 		 401 aa  342  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  48.12 
 
 		 401 aa  342  2e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  46.63 
 
 		 396 aa  342  2.9999999999999998e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1580  molybdopterin oxidoreductase  33.98 
 
 		 694 aa  342  2.9999999999999998e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  47.07 
 
 		 393 aa  340  5.9999999999999996e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  32.09 
 
 		 729 aa  340  7e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  48.51 
 
 		 400 aa  340  7e-92  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  48.51 
 
 		 398 aa  340  9.999999999999999e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2122  cysteine desulfurase NifS  48.39 
 
 		 401 aa  338  3.9999999999999995e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31758 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4262  aminotransferase class V  51.9 
 
 		 395 aa  337  5.999999999999999e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.907816 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  44.92 
 
 		 398 aa  337  9e-91  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  47.55 
 
 		 386 aa  336  1e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0168  aminotransferase, class V  47.67 
 
 		 409 aa  337  1e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.925051 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1006  molybdopterin oxidoreductase  32.23 
 
 		 761 aa  336  1e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.249803 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_70  aminotransferase, class V  46.61 
 
 		 383 aa  336  2e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1880  Formate dehydrogenase  31.97 
 
 		 744 aa  335  2e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  47.24 
 
 		 391 aa  336  2e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  45.41 
 
 		 398 aa  335  3e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  45.41 
 
 		 398 aa  335  3e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3079  cysteine desulfurase  46.97 
 
 		 396 aa  335  4e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0248  cysteine desulfurase  46.61 
 
 		 383 aa  334  7.000000000000001e-90  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0166722  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  45.9 
 
 		 402 aa  333  1e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  49.33 
 
 		 385 aa  332  2e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  45.21 
 
 		 402 aa  333  2e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  46.7 
 
 		 404 aa  332  3e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  47.61 
 
 		 384 aa  332  3e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  46.2 
 
 		 399 aa  332  3e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  44.96 
 
 		 391 aa  331  6e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  45.45 
 
 		 393 aa  331  6e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  46.58 
 
 		 388 aa  330  7e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  47.22 
 
 		 398 aa  330  1.0000000000000001e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1507  cysteine desulfurase  47.97 
 
 		 402 aa  330  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  44.12 
 
 		 404 aa  329  2.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  46.13 
 
 		 380 aa  329  2.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  44.5 
 
 		 396 aa  328  3e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0872  cysteine desulfurase  47.62 
 
 		 380 aa  327  5e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0149083 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2296  aminotransferase, class V  48.77 
 
 		 394 aa  327  7e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1225  cysteine desulfurase NifS  47.83 
 
 		 397 aa  327  1e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000944956 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  32.83 
 
 		 685 aa  326  2e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  48.33 
 
 		 388 aa  326  2e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  31.5 
 
 		 698 aa  324  5e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  47.43 
 
 		 403 aa  323  9.000000000000001e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  32.04 
 
 		 692 aa  323  9.000000000000001e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2431  aminotransferase, class V  46.9 
 
 		 390 aa  323  9.000000000000001e-87  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2182  aminotransferase, class V  49.73 
 
 		 388 aa  323  9.000000000000001e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.186921 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  46.3 
 
 		 400 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  45.78 
 
 		 404 aa  322  3e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  46.47 
 
 		 407 aa  321  6e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  47.44 
 
 		 392 aa  320  9e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0530  cysteine desulfurase  49.33 
 
 		 387 aa  320  1e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1257  aminotransferase, class V  49.05 
 
 		 387 aa  320  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  44.96 
 
 		 405 aa  320  1e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0108  aminotransferase class V  45.48 
 
 		 400 aa  319  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.702313 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1068  aminotransferase, class V  47.72 
 
 		 393 aa  318  5e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0344653  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2558  cysteine desulfurase NifS  48.51 
 
 		 388 aa  317  6e-85  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.947611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  45.87 
 
 		 386 aa  317  8e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  44.36 
 
 		 401 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  45.36 
 
 		 403 aa  315  2.9999999999999996e-84  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0504  cysteine desulfurase NifS  47.96 
 
 		 402 aa  315  3.9999999999999997e-84  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  46.47 
 
 		 381 aa  314  7.999999999999999e-84  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  42.13 
 
 		 388 aa  313  9e-84  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  48.22 
 
 		 383 aa  313  9e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3581  cysteine desulfurase NifS  46.35 
 
 		 404 aa  313  1e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.157563  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  44.47 
 
 		 397 aa  313  1e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2025  aminotransferase, class V  42.09 
 
 		 383 aa  313  1e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  44.81 
 
 		 417 aa  313  2e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2808  aminotransferase, class V  46.7 
 
 		 379 aa  313  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0907  aminotransferase, class V  47.86 
 
 		 383 aa  311  5e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000245321  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0899  Formate dehydrogenase  31.9 
 
 		 756 aa  310  6.999999999999999e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>