More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1457 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1999  formate dehydrogenase, alpha subunit  63.5 
 
 		 657 aa  876    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1457  formate dehydrogenase, alpha subunit  100 
 
 		 657 aa  1355    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.85 
 
 		 879 aa  414  1e-114  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.79 
 
 		 686 aa  409  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.2 
 
 		 689 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1339  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.3 
 
 		 662 aa  402  1e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.86 
 
 		 676 aa  399  1e-109  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.14 
 
 		 688 aa  398  1e-109  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.4 
 
 		 898 aa  399  1e-109  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.12 
 
 		 676 aa  390  1e-107  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.57 
 
 		 676 aa  392  1e-107  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.65 
 
 		 917 aa  389  1e-107  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.26 
 
 		 685 aa  387  1e-106  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.43 
 
 		 674 aa  389  1e-106  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.02 
 
 		 685 aa  386  1e-106  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.32 
 
 		 677 aa  385  1e-105  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  34.76 
 
 		 745 aa  382  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.48 
 
 		 674 aa  382  1e-105  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.08 
 
 		 674 aa  382  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.03 
 
 		 668 aa  380  1e-104  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.37 
 
 		 900 aa  376  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.18 
 
 		 724 aa  379  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  34.95 
 
 		 695 aa  372  1e-101  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.82 
 
 		 687 aa  366  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.47 
 
 		 901 aa  367  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.28 
 
 		 674 aa  369  1e-100  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.14 
 
 		 1440 aa  365  1e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0324  formate dehydrogenase alpha subunit  35.32 
 
 		 713 aa  363  6e-99  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03951  formate dehydrogenase-H, selenopolypeptide subunit  33.52 
 
 		 715 aa  362  2e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.803476  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4324  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  33.52 
 
 		 715 aa  362  2e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4542  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  33.52 
 
 		 715 aa  362  2e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03911  hypothetical protein  33.52 
 
 		 715 aa  362  2e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.988265  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3948  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.52 
 
 		 715 aa  362  2e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.19 
 
 		 688 aa  361  3e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  32.66 
 
 		 687 aa  360  5e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.24 
 
 		 925 aa  360  6e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.23 
 
 		 893 aa  359  7e-98  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3913  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.38 
 
 		 715 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4578  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.74 
 
 		 723 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1268  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.05 
 
 		 716 aa  356  6.999999999999999e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.424555  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  34.12 
 
 		 899 aa  356  7.999999999999999e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0843  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.84 
 
 		 994 aa  354  2.9999999999999997e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.48 
 
 		 920 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1753  formate dehydrogenase alpha subunit  33.29 
 
 		 716 aa  354  4e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0179443  hitchhiker  0.000996092 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.43 
 
 		 686 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1383  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.05 
 
 		 716 aa  353  5.9999999999999994e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.627092  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.47 
 
 		 904 aa  352  8e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.14 
 
 		 945 aa  352  1e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  32.8 
 
 		 689 aa  352  1e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1238  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.83 
 
 		 721 aa  352  1e-95  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.768724  normal  0.0266527 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0641  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.77 
 
 		 979 aa  350  3e-95  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2721  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.05 
 
 		 716 aa  348  1e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0016187  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2424  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.71 
 
 		 718 aa  348  2e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.680227 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.1 
 
 		 893 aa  348  2e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.75 
 
 		 937 aa  348  3e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.55 
 
 		 1440 aa  347  3e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0685  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.83 
 
 		 718 aa  347  5e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4746  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.04 
 
 		 1111 aa  345  1e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.879601  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1925  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.14 
 
 		 986 aa  345  2e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1781  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.48 
 
 		 716 aa  345  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1708  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.75 
 
 		 959 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0997  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.32 
 
 		 953 aa  344  2.9999999999999997e-93  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  34.37 
 
 		 1387 aa  343  4e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.63 
 
 		 688 aa  343  5.999999999999999e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.66 
 
 		 1410 aa  343  9e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4710  molybdopterin oxidoreductase family protein  32.99 
 
 		 978 aa  341  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  33.78 
 
 		 1385 aa  341  2e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.46 
 
 		 927 aa  342  2e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0501  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  33.43 
 
 		 978 aa  340  5.9999999999999996e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0464  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.35 
 
 		 987 aa  340  5.9999999999999996e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.06 
 
 		 688 aa  339  8e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.39 
 
 		 1406 aa  339  8e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0499  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  33.28 
 
 		 978 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3829  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.29 
 
 		 715 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.151921  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0627  molybdopterin oxidoreductase family protein  32.84 
 
 		 978 aa  338  9.999999999999999e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3682  anaerobic formate dehydrogenase, alpha subunit, -type  32.29 
 
 		 715 aa  339  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0729  formate dehydrogenase H  32.14 
 
 		 715 aa  338  1.9999999999999998e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.708724 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4633  molybdopterin oxidoreductase  32.86 
 
 		 1171 aa  338  1.9999999999999998e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571249  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.2 
 
 		 893 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1282  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.5 
 
 		 933 aa  338  2.9999999999999997e-91  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.402771 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0716  molybdopterin oxidoreductase family protein  33.14 
 
 		 978 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1809  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.65 
 
 		 960 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550904  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0655  molybdopterin oxidoreductase family protein  33.14 
 
 		 978 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0557  molybdopterin oxidoreductase family protein  33.14 
 
 		 978 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0589  molybdopterin oxidoreductase family protein  33.14 
 
 		 978 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1318  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.6 
 
 		 973 aa  337  3.9999999999999995e-91  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0645  molybdopterin oxidoreductase family protein  33.14 
 
 		 978 aa  337  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.293395 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1391  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.61 
 
 		 947 aa  337  5e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4523  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.77 
 
 		 886 aa  336  5.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.195662  normal  0.224956 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4391  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.77 
 
 		 886 aa  336  5.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.410335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.48 
 
 		 886 aa  336  7.999999999999999e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4642  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.73 
 
 		 886 aa  336  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0800652  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3566  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.73 
 
 		 886 aa  336  1e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0757584 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  31.65 
 
 		 900 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3552  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.65 
 
 		 960 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2249  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.75 
 
 		 903 aa  335  1e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.580662  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2185  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.65 
 
 		 960 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.602321  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1038  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.04 
 
 		 1130 aa  335  2e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0505  formate dehydrogenase, alpha subunit  32.39 
 
 		 980 aa  335  2e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4119  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.19 
 
 		 754 aa  334  3e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>