More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0313 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 698 aa  1442    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  39.45 
 
 		 729 aa  473  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1484  Nitrate reductase  34.71 
 
 		 739 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  33.7 
 
 		 745 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  33.97 
 
 		 747 aa  389  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  35.07 
 
 		 700 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2375  molybdopterin oxidoreductase  32 
 
 		 747 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1880  Formate dehydrogenase  32.78 
 
 		 744 aa  354  2.9999999999999997e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  32.72 
 
 		 692 aa  352  1e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2365  molybdopterin oxidoreductase  32.38 
 
 		 777 aa  352  1e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1580  molybdopterin oxidoreductase  33.61 
 
 		 694 aa  348  2e-94  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2013  molybdopterin oxidoreductase  31.01 
 
 		 1055 aa  347  4e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  33.56 
 
 		 711 aa  347  6e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2511  molybdopterin oxidoreductase  31.12 
 
 		 776 aa  343  5.999999999999999e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  32.93 
 
 		 891 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1907  molybdopterin oxidoreductase  31.28 
 
 		 794 aa  339  9.999999999999999e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  32.79 
 
 		 726 aa  336  9e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0930  molybdopterin oxidoreductase  34.25 
 
 		 731 aa  335  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.99852  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0541  molybdopterin oxidoreductase  32.06 
 
 		 755 aa  332  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0899  Formate dehydrogenase  31.82 
 
 		 756 aa  332  2e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  31.73 
 
 		 1139 aa  330  8e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  31.95 
 
 		 1143 aa  326  7e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  31.36 
 
 		 1135 aa  320  3.9999999999999996e-86  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2753  molydopterin dinucleotide-binding region  31.72 
 
 		 749 aa  317  5e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.28964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  32.06 
 
 		 685 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1904  molydopterin dinucleotide-binding region  29.74 
 
 		 753 aa  316  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3092  molybdopterin oxidoreductase  30.13 
 
 		 791 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2377  Formate dehydrogenase  29.48 
 
 		 791 aa  299  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  30.65 
 
 		 759 aa  282  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  29.58 
 
 		 695 aa  276  1.0000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  30.11 
 
 		 730 aa  275  3e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1006  molybdopterin oxidoreductase  28.29 
 
 		 761 aa  266  1e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.249803 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  30.35 
 
 		 722 aa  265  2e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  27.91 
 
 		 734 aa  259  9e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0620  twin-arginine translocation pathway signal  29.2 
 
 		 741 aa  258  2e-67  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.390565  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  30.45 
 
 		 739 aa  256  1.0000000000000001e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2813  molybdopterin oxidoreductase  29.69 
 
 		 738 aa  255  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  28.65 
 
 		 688 aa  254  5.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  30.36 
 
 		 750 aa  253  8.000000000000001e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  29.48 
 
 		 703 aa  251  4e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  31.02 
 
 		 899 aa  250  5e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  29.59 
 
 		 698 aa  249  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2562  formate dehydrogenase  28.05 
 
 		 720 aa  249  1e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  29.71 
 
 		 697 aa  247  6.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.9 
 
 		 685 aa  246  9e-64  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2718  molybdopterin oxidoreductase  30 
 
 		 737 aa  244  3e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  28.53 
 
 		 731 aa  243  6e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2632  molybdopterin oxidoreductase  31.42 
 
 		 739 aa  243  7e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.348569  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  28.7 
 
 		 760 aa  243  7.999999999999999e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2400  molybdopterin oxidoreductase  28.07 
 
 		 738 aa  243  7.999999999999999e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0425196  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.46 
 
 		 688 aa  243  1e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0269  Nitrate reductase  26.9 
 
 		 754 aa  241  2.9999999999999997e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2768  molydopterin dinucleotide-binding region  27.58 
 
 		 898 aa  241  4e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.81742  normal  0.229258 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  27.72 
 
 		 764 aa  241  4e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0320  Formate dehydrogenase  29.09 
 
 		 700 aa  239  1e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0912  molybdopterin oxidoreductase  28.24 
 
 		 739 aa  238  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2919  molybdopterin oxidoreductase  27.61 
 
 		 733 aa  238  2e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2860  molybdopterin oxidoreductase  28.19 
 
 		 695 aa  238  2e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  26.78 
 
 		 760 aa  238  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  27.58 
 
 		 764 aa  238  3e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  30.79 
 
 		 744 aa  237  5.0000000000000005e-61  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  27.7 
 
 		 666 aa  237  6e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  28.49 
 
 		 701 aa  237  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1318  molybdopterin oxidoreductase  28.3 
 
 		 695 aa  236  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.952277  hitchhiker  0.000256409 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1914  thiosulfate reductase  27.03 
 
 		 761 aa  236  1.0000000000000001e-60  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.527644  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  28.74 
 
 		 684 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.94 
 
 		 893 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  27.43 
 
 		 764 aa  234  3e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.38 
 
 		 724 aa  233  7.000000000000001e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  27.49 
 
 		 703 aa  233  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  27.8 
 
 		 698 aa  233  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3772  molybdopterin oxidoreductase  29.93 
 
 		 708 aa  233  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.914443 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  27.8 
 
 		 698 aa  232  1e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0345  nitrate reductase  29.3 
 
 		 731 aa  231  2e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213856  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2386  molybdopterin oxidoreductase  28.2 
 
 		 747 aa  232  2e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  27.84 
 
 		 691 aa  231  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  27.49 
 
 		 692 aa  232  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  25.93 
 
 		 760 aa  231  2e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  27.19 
 
 		 760 aa  231  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2424  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.06 
 
 		 718 aa  231  3e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.680227 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  26.33 
 
 		 758 aa  230  8e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  26.88 
 
 		 673 aa  229  9e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  27.56 
 
 		 691 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  28.76 
 
 		 731 aa  229  2e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  27.56 
 
 		 691 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  27.56 
 
 		 691 aa  228  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2539  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.63 
 
 		 766 aa  227  6e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2338  molybdopterin oxidoreductase  26.83 
 
 		 729 aa  227  6e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  27.13 
 
 		 764 aa  226  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2794  molybdopterin oxidoreductase  28.31 
 
 		 698 aa  226  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1753  formate dehydrogenase alpha subunit  28.83 
 
 		 716 aa  226  2e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0179443  hitchhiker  0.000996092 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.48 
 
 		 900 aa  224  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  26.71 
 
 		 764 aa  225  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.92 
 
 		 689 aa  224  3e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  27.39 
 
 		 760 aa  224  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  28.71 
 
 		 745 aa  224  6e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  29.08 
 
 		 687 aa  223  6e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  27.43 
 
 		 691 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3948  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.71 
 
 		 715 aa  223  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4542  formate dehydrogenase H, alpha subunit, selenocysteine-containing  27.71 
 
 		 715 aa  223  9.999999999999999e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>