More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1166 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  53.82 
 
 
759 aa  812    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  100 
 
 
750 aa  1524    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  35.21 
 
 
730 aa  444  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  33.76 
 
 
731 aa  414  1e-114  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2813  molybdopterin oxidoreductase  35.04 
 
 
738 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  35.41 
 
 
695 aa  406  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2632  molybdopterin oxidoreductase  35.29 
 
 
739 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.348569  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  37.38 
 
 
722 aa  397  1e-109  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2718  molybdopterin oxidoreductase  34.79 
 
 
737 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  35.01 
 
 
744 aa  394  1e-108  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  33.24 
 
 
739 aa  382  1e-104  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2386  molybdopterin oxidoreductase  32.98 
 
 
747 aa  372  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0912  molybdopterin oxidoreductase  32.81 
 
 
739 aa  365  2e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0345  nitrate reductase  32.53 
 
 
731 aa  364  3e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213856  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2400  molybdopterin oxidoreductase  31.9 
 
 
738 aa  360  5e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0425196  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2562  formate dehydrogenase  31.97 
 
 
720 aa  360  6e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0620  twin-arginine translocation pathway signal  31.94 
 
 
741 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.390565  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  31.99 
 
 
760 aa  352  1e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  34.51 
 
 
731 aa  350  5e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  31.21 
 
 
764 aa  348  2e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  31.08 
 
 
764 aa  346  8e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  30.77 
 
 
764 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  30.64 
 
 
760 aa  344  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  30.95 
 
 
764 aa  344  4e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  30.9 
 
 
764 aa  342  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  30.5 
 
 
760 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  31.46 
 
 
758 aa  335  2e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  30.6 
 
 
760 aa  333  6e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  29.86 
 
 
760 aa  332  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  30.01 
 
 
758 aa  331  3e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  29.96 
 
 
760 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3188  molybdopterin oxidoreductase  32.75 
 
 
756 aa  330  5.0000000000000004e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2235  thiosulfate reductase  30.15 
 
 
758 aa  329  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209797  normal  0.286987 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  29.29 
 
 
758 aa  328  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  29.88 
 
 
758 aa  328  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  29.88 
 
 
758 aa  326  9e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0265  molybdopterin oxidoreductase  29.47 
 
 
764 aa  325  2e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.227459  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2794  molybdopterin oxidoreductase  32.25 
 
 
698 aa  324  5e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0389  response regulator receiver domain-containing protein  29.89 
 
 
757 aa  323  7e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.257769  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2860  molybdopterin oxidoreductase  30.83 
 
 
695 aa  318  3e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1318  molybdopterin oxidoreductase  32.96 
 
 
695 aa  313  4.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.952277  hitchhiker  0.000256409 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2338  molybdopterin oxidoreductase  32.38 
 
 
729 aa  306  7e-82  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1914  thiosulfate reductase  28.4 
 
 
761 aa  298  2e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.527644  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02090  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  30.34 
 
 
734 aa  297  6e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0320  Formate dehydrogenase  31.91 
 
 
700 aa  291  2e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0447  molybdopterin oxidoreductase  30.44 
 
 
731 aa  288  2e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0269  Nitrate reductase  28.37 
 
 
754 aa  281  3e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0442  molybdopterin oxidoreductase  30.73 
 
 
731 aa  281  3e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2919  molybdopterin oxidoreductase  30.56 
 
 
733 aa  280  8e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1667  Formate dehydrogenase  30.68 
 
 
704 aa  259  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.982617  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1076  thiosulfate reductase, putative  30.16 
 
 
708 aa  256  9e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  30.51 
 
 
698 aa  253  1e-65  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1509  Formate dehydrogenase  28.04 
 
 
732 aa  249  1e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1484  Nitrate reductase  30.32 
 
 
739 aa  249  1e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2276  molybdopterin oxidoreductase  30.12 
 
 
807 aa  243  1e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  29.59 
 
 
729 aa  238  4e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  27.41 
 
 
747 aa  229  1e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  28.09 
 
 
692 aa  226  2e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  29.4 
 
 
936 aa  225  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  27.79 
 
 
745 aa  223  8e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  29.06 
 
 
891 aa  218  4e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.57 
 
 
685 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2013  molybdopterin oxidoreductase  28.01 
 
 
1055 aa  213  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  29.24 
 
 
685 aa  210  6e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  28.51 
 
 
1135 aa  207  5e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0930  molybdopterin oxidoreductase  26.97 
 
 
731 aa  207  7e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.99852  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3092  molybdopterin oxidoreductase  26.53 
 
 
791 aa  205  2e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0353  formate dehydrogenase  28.28 
 
 
833 aa  205  3e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000992334  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1880  Formate dehydrogenase  29.07 
 
 
744 aa  203  9e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  27.27 
 
 
711 aa  203  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0895  Nitrate reductase  28.67 
 
 
711 aa  203  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.381214  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  27.49 
 
 
726 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  28.42 
 
 
688 aa  201  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  28.63 
 
 
1139 aa  200  7e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4875  molybdopterin oxidoreductase  29.53 
 
 
688 aa  200  7e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  28.91 
 
 
708 aa  199  1.0000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2753  molydopterin dinucleotide-binding region  27.06 
 
 
749 aa  198  2.0000000000000003e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.28964  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0216  molybdopterin oxidoreductase  28.23 
 
 
837 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  28.96 
 
 
690 aa  197  7e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  28.43 
 
 
1143 aa  195  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1074  molybdopterin oxidoreductase  26.34 
 
 
717 aa  194  4e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2682  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.21 
 
 
792 aa  194  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2788  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.21 
 
 
792 aa  194  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2725  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.21 
 
 
792 aa  194  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2900  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.21 
 
 
792 aa  194  6e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735186  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2563  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  25.66 
 
 
794 aa  192  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000909986  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2769  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.08 
 
 
792 aa  192  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0171  molybdopterin oxidoreductase  28.93 
 
 
709 aa  191  4e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.662613  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0387  molybdopterin oxidoreductase  26.26 
 
 
879 aa  191  5.999999999999999e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1580  molybdopterin oxidoreductase  26.22 
 
 
694 aa  188  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  29.04 
 
 
691 aa  187  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  28.79 
 
 
726 aa  188  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2605  twin-arginine translocation pathway signal  26.43 
 
 
879 aa  187  8e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  30.08 
 
 
688 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  28.8 
 
 
727 aa  186  2.0000000000000003e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  30.08 
 
 
688 aa  186  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  28.87 
 
 
691 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  28.29 
 
 
692 aa  185  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2059  molybdopterin oxidoreductase  28.9 
 
 
704 aa  185  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2777  nitrate reductase  27.72 
 
 
731 aa  185  3e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>