More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1350 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  44.57 
 
 		 1143 aa  636    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  45.25 
 
 		 1135 aa  639    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  44.21 
 
 		 1139 aa  639    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 711 aa  1448    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  33.56 
 
 		 698 aa  355  2e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2753  molydopterin dinucleotide-binding region  31.83 
 
 		 749 aa  338  1.9999999999999998e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.28964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1580  molybdopterin oxidoreductase  32.09 
 
 		 694 aa  330  7e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  31.23 
 
 		 729 aa  329  1.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2375  molybdopterin oxidoreductase  33.04 
 
 		 747 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2365  molybdopterin oxidoreductase  32.23 
 
 		 777 aa  323  5e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  30.81 
 
 		 692 aa  323  6e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  32.97 
 
 		 685 aa  318  2e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1484  Nitrate reductase  32.21 
 
 		 739 aa  314  4.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0899  Formate dehydrogenase  31.85 
 
 		 756 aa  312  1e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1006  molybdopterin oxidoreductase  29.95 
 
 		 761 aa  311  2e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.249803 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2511  molybdopterin oxidoreductase  31.09 
 
 		 776 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1880  Formate dehydrogenase  31.35 
 
 		 744 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  31.67 
 
 		 700 aa  307  4.0000000000000004e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  31.57 
 
 		 747 aa  304  4.0000000000000003e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1904  molydopterin dinucleotide-binding region  29.33 
 
 		 753 aa  296  7e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  32.89 
 
 		 691 aa  294  4e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0541  molybdopterin oxidoreductase  31.87 
 
 		 755 aa  292  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1567  molybdopterin oxidoreductase  31.06 
 
 		 803 aa  287  4e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  29.09 
 
 		 745 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  33.72 
 
 		 688 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  29.86 
 
 		 891 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  32.28 
 
 		 691 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  32.28 
 
 		 691 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  32.28 
 
 		 691 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  31.07 
 
 		 691 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2377  Formate dehydrogenase  30.04 
 
 		 791 aa  281  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0930  molybdopterin oxidoreductase  29.8 
 
 		 731 aa  282  2e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.99852  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4542  molybdopterin oxidoreductase  33.29 
 
 		 703 aa  281  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.1046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  31.02 
 
 		 691 aa  280  5e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  30.96 
 
 		 691 aa  279  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  33.33 
 
 		 697 aa  278  3e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  30.16 
 
 		 691 aa  278  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  30.13 
 
 		 691 aa  276  8e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  30.13 
 
 		 691 aa  276  8e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2013  molybdopterin oxidoreductase  29.73 
 
 		 1055 aa  272  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  31.5 
 
 		 670 aa  272  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  30.99 
 
 		 684 aa  271  4e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  30.54 
 
 		 726 aa  270  7e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2304  molybdopterin oxidoreductase  31.13 
 
 		 803 aa  270  8e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1907  molybdopterin oxidoreductase  29.11 
 
 		 794 aa  270  8.999999999999999e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  29.69 
 
 		 698 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  29.69 
 
 		 698 aa  269  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  30.57 
 
 		 673 aa  267  5e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  30.75 
 
 		 703 aa  266  8.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  33.08 
 
 		 692 aa  266  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  29.54 
 
 		 698 aa  265  2e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  30.43 
 
 		 701 aa  265  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  30.21 
 
 		 692 aa  263  8.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  29.71 
 
 		 692 aa  261  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.55 
 
 		 685 aa  261  3e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  30.01 
 
 		 695 aa  261  4e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.06 
 
 		 893 aa  259  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  29.06 
 
 		 692 aa  258  4e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  30.5 
 
 		 690 aa  256  7e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2813  molybdopterin oxidoreductase  29.88 
 
 		 738 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  31.06 
 
 		 666 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0422  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  29.12 
 
 		 806 aa  253  7e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0580651  decreased coverage  0.000000000595111 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  29.76 
 
 		 694 aa  249  8e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  28.9 
 
 		 677 aa  249  1e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1612  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  29.57 
 
 		 820 aa  249  2e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  30.03 
 
 		 688 aa  248  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2718  molybdopterin oxidoreductase  29.96 
 
 		 737 aa  248  4e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2953  Formate dehydrogenase  30.86 
 
 		 710 aa  246  9.999999999999999e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  30.03 
 
 		 688 aa  246  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4875  molybdopterin oxidoreductase  30.3 
 
 		 688 aa  246  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.704789  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  30.39 
 
 		 718 aa  246  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  29.25 
 
 		 708 aa  246  1.9999999999999999e-63  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  30.56 
 
 		 728 aa  245  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  29.87 
 
 		 724 aa  245  1.9999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1914  thiosulfate reductase  28.37 
 
 		 761 aa  244  3.9999999999999997e-63  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.527644  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  30.33 
 
 		 720 aa  244  5e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2632  molybdopterin oxidoreductase  29.9 
 
 		 739 aa  244  5e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.348569  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  30.26 
 
 		 718 aa  243  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  30.26 
 
 		 718 aa  243  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  28.13 
 
 		 739 aa  243  1e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2922  molybdopterin oxidoreductase  27.22 
 
 		 777 aa  242  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.811962  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00898  dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit A  30.41 
 
 		 814 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0778088  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2749  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  30.41 
 
 		 814 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00905  hypothetical protein  30.41 
 
 		 814 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0839348  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0999  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  30.41 
 
 		 814 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2702  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  30.41 
 
 		 814 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.98868 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  28.9 
 
 		 673 aa  241  4e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1056  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  30.41 
 
 		 814 aa  240  5e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  30.41 
 
 		 814 aa  240  5e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  30.18 
 
 		 712 aa  241  5e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  30.35 
 
 		 687 aa  240  5.999999999999999e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2226  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  30.18 
 
 		 814 aa  240  5.999999999999999e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.982689 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2725  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  30.12 
 
 		 792 aa  240  8e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2769  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  30.49 
 
 		 792 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  28.42 
 
 		 734 aa  239  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2900  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  30.08 
 
 		 792 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2788  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  30.08 
 
 		 792 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  30.45 
 
 		 676 aa  239  1e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  28.98 
 
 		 745 aa  238  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  28.44 
 
 		 899 aa  238  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>