More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0541 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2375  molybdopterin oxidoreductase  46.93 
 
 
747 aa  687    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0899  Formate dehydrogenase  48.45 
 
 
756 aa  718    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1880  Formate dehydrogenase  50.14 
 
 
744 aa  756    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0541  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
755 aa  1579    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2377  Formate dehydrogenase  43.87 
 
 
791 aa  633  1e-180  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1904  molydopterin dinucleotide-binding region  42.63 
 
 
753 aa  569  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2365  molybdopterin oxidoreductase  41.07 
 
 
777 aa  550  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1907  molybdopterin oxidoreductase  38.81 
 
 
794 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2511  molybdopterin oxidoreductase  39.28 
 
 
776 aa  508  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1484  Nitrate reductase  33.72 
 
 
739 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  32.06 
 
 
698 aa  341  2.9999999999999998e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  31.79 
 
 
745 aa  328  2.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  30.39 
 
 
729 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  32.49 
 
 
747 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  31.47 
 
 
726 aa  296  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  31.87 
 
 
711 aa  292  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  30.69 
 
 
700 aa  291  4e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  28.15 
 
 
1139 aa  285  3.0000000000000004e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0930  molybdopterin oxidoreductase  30.54 
 
 
731 aa  281  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.99852  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  28.42 
 
 
1143 aa  278  4e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  30.64 
 
 
891 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2013  molybdopterin oxidoreductase  30.38 
 
 
1055 aa  273  1e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2753  molydopterin dinucleotide-binding region  30.29 
 
 
749 aa  271  2.9999999999999997e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.28964  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  27.47 
 
 
1135 aa  270  1e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3092  molybdopterin oxidoreductase  28.12 
 
 
791 aa  267  5e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1006  molybdopterin oxidoreductase  28.31 
 
 
761 aa  240  5.999999999999999e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.249803 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  27.91 
 
 
698 aa  222  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  28.05 
 
 
698 aa  220  7e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3000  molybdopterin oxidoreductase  28.24 
 
 
703 aa  217  5e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1580  molybdopterin oxidoreductase  26.88 
 
 
694 aa  214  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  27.18 
 
 
698 aa  212  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6804  molybdopterin oxidoreductase  26.54 
 
 
720 aa  212  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.981132 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  27.08 
 
 
728 aa  209  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  27.01 
 
 
718 aa  209  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  27.01 
 
 
718 aa  209  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  27.16 
 
 
718 aa  209  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  27.16 
 
 
708 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3814  molybdopterin oxidoreductase  26.13 
 
 
712 aa  205  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2682  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.27 
 
 
792 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2900  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.14 
 
 
792 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735186  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  26.53 
 
 
701 aa  201  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  27.19 
 
 
759 aa  202  3e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2788  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.14 
 
 
792 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  26.42 
 
 
690 aa  200  7.999999999999999e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2769  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.54 
 
 
792 aa  200  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2725  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.01 
 
 
792 aa  198  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  26.62 
 
 
666 aa  198  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  28.15 
 
 
688 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0389  response regulator receiver domain-containing protein  26.01 
 
 
757 aa  197  5.000000000000001e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.257769  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1914  thiosulfate reductase  25.52 
 
 
761 aa  197  7e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.527644  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  27.07 
 
 
730 aa  196  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1921  molybdopterin oxidoreductase  26.86 
 
 
669 aa  195  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  25.92 
 
 
691 aa  194  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  26.65 
 
 
764 aa  194  4e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  26.28 
 
 
726 aa  194  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  25.46 
 
 
691 aa  194  5e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  26.16 
 
 
691 aa  194  5e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  26.47 
 
 
764 aa  194  5e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  25.87 
 
 
691 aa  193  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  25.87 
 
 
691 aa  193  9e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  25.87 
 
 
691 aa  193  9e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  27.47 
 
 
695 aa  193  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  25.74 
 
 
734 aa  193  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  24.15 
 
 
685 aa  192  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  26.5 
 
 
764 aa  192  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  26.35 
 
 
708 aa  192  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  26.76 
 
 
731 aa  191  4e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3153  molybdopterin oxidoreductase  28.12 
 
 
689 aa  191  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  27.73 
 
 
731 aa  191  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0422  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  27.9 
 
 
806 aa  191  5.999999999999999e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0580651  decreased coverage  0.000000000595111 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3747  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  24.74 
 
 
793 aa  190  1e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0127  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  26.05 
 
 
799 aa  190  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0090  molybdopterin oxidoreductase  27.46 
 
 
697 aa  189  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0958221 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  25.36 
 
 
691 aa  189  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  24.82 
 
 
692 aa  188  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1386  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE  28.53 
 
 
799 aa  188  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  25.13 
 
 
760 aa  187  5e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  25.48 
 
 
691 aa  187  8e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  25.48 
 
 
691 aa  187  8e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4573  molybdopterin oxidoreductase  26.96 
 
 
677 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  26.36 
 
 
760 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  25.66 
 
 
691 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1687  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  25.85 
 
 
817 aa  186  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914371  normal  0.111557 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  27.22 
 
 
692 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  25.21 
 
 
670 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3324  molybdopterin oxidoreductase  26.54 
 
 
673 aa  184  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.54473 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27350  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  28.65 
 
 
1023 aa  184  7e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  29.78 
 
 
764 aa  184  7e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  30 
 
 
764 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0563  molybdopterin oxidoreductase  25.07 
 
 
709 aa  183  9.000000000000001e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.63173 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0664  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  26.2 
 
 
759 aa  183  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  27.54 
 
 
750 aa  182  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  25.82 
 
 
760 aa  182  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  25.85 
 
 
726 aa  182  2e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0769  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  26.35 
 
 
759 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447962  normal  0.969632 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0650  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  25.82 
 
 
759 aa  182  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  27.22 
 
 
722 aa  182  2.9999999999999997e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0723  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  26.06 
 
 
759 aa  182  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  26.24 
 
 
760 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2953  Formate dehydrogenase  26.86 
 
 
710 aa  180  7e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>