More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2338 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  59.56 
 
 		 731 aa  890    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2338  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 729 aa  1521    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  34.77 
 
 		 722 aa  390  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  33.02 
 
 		 759 aa  379  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  33.42 
 
 		 730 aa  372  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2276  molybdopterin oxidoreductase  38.1 
 
 		 807 aa  367  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  31.9 
 
 		 760 aa  363  6e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0265  molybdopterin oxidoreductase  31.01 
 
 		 764 aa  359  8e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.227459  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  31.42 
 
 		 764 aa  359  9e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  31.42 
 
 		 764 aa  359  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1914  thiosulfate reductase  30.45 
 
 		 761 aa  358  9.999999999999999e-98  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.527644  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  31.89 
 
 		 760 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  31.56 
 
 		 764 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  33.29 
 
 		 695 aa  357  3.9999999999999996e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  31.11 
 
 		 760 aa  357  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  31.07 
 
 		 760 aa  353  5e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  30.85 
 
 		 764 aa  353  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  31.25 
 
 		 764 aa  353  8e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2813  molybdopterin oxidoreductase  33.82 
 
 		 738 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  33.25 
 
 		 760 aa  352  1e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  31.47 
 
 		 731 aa  345  2e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2718  molybdopterin oxidoreductase  33.96 
 
 		 737 aa  342  1e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2632  molybdopterin oxidoreductase  33.96 
 
 		 739 aa  342  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.348569  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  31.5 
 
 		 760 aa  341  2e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  31.23 
 
 		 758 aa  342  2e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0389  response regulator receiver domain-containing protein  29.66 
 
 		 757 aa  341  2.9999999999999998e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.257769  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1318  molybdopterin oxidoreductase  33.05 
 
 		 695 aa  338  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.952277  hitchhiker  0.000256409 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  31.98 
 
 		 750 aa  335  2e-90  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  30.23 
 
 		 758 aa  326  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  29.84 
 
 		 758 aa  326  9e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2235  thiosulfate reductase  29.72 
 
 		 758 aa  324  4e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209797  normal  0.286987 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  29.51 
 
 		 739 aa  323  7e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  29.72 
 
 		 758 aa  322  9.999999999999999e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  29.72 
 
 		 758 aa  322  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2386  molybdopterin oxidoreductase  30.32 
 
 		 747 aa  320  7e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2794  molybdopterin oxidoreductase  32.25 
 
 		 698 aa  319  9e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  32.29 
 
 		 744 aa  317  4e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3188  molybdopterin oxidoreductase  30.12 
 
 		 756 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0269  Nitrate reductase  29.2 
 
 		 754 aa  313  6.999999999999999e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2860  molybdopterin oxidoreductase  31.47 
 
 		 695 aa  313  1e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2919  molybdopterin oxidoreductase  29.88 
 
 		 733 aa  303  8.000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0345  nitrate reductase  31.34 
 
 		 731 aa  301  3e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213856  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0447  molybdopterin oxidoreductase  30.31 
 
 		 731 aa  299  1e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0320  Formate dehydrogenase  30.89 
 
 		 700 aa  296  9e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0620  twin-arginine translocation pathway signal  29.4 
 
 		 741 aa  295  1e-78  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.390565  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2400  molybdopterin oxidoreductase  28.85 
 
 		 738 aa  295  2e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0425196  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2562  formate dehydrogenase  29 
 
 		 720 aa  291  2e-77  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0912  molybdopterin oxidoreductase  28.69 
 
 		 739 aa  291  3e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1667  Formate dehydrogenase  31.79 
 
 		 704 aa  288  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.982617  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1509  Formate dehydrogenase  27.84 
 
 		 732 aa  278  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02090  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  29.76 
 
 		 734 aa  273  6e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0442  molybdopterin oxidoreductase  28.16 
 
 		 731 aa  263  6.999999999999999e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1076  thiosulfate reductase, putative  28.03 
 
 		 708 aa  259  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  27.64 
 
 		 729 aa  247  4.9999999999999997e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  28.93 
 
 		 747 aa  247  6.999999999999999e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  27.58 
 
 		 745 aa  246  8e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1484  Nitrate reductase  29.17 
 
 		 739 aa  242  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2605  twin-arginine translocation pathway signal  28.53 
 
 		 879 aa  242  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  27.36 
 
 		 698 aa  238  4e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  29.38 
 
 		 700 aa  227  5.0000000000000005e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  27.62 
 
 		 891 aa  223  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1612  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  27.08 
 
 		 820 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  27.91 
 
 		 711 aa  220  6e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  28.92 
 
 		 936 aa  219  1e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0387  molybdopterin oxidoreductase  27.19 
 
 		 879 aa  218  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1386  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE  27.07 
 
 		 799 aa  212  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2563  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  25.4 
 
 		 794 aa  212  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000909986  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0922  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain A  26.04 
 
 		 816 aa  211  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3261  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  26.27 
 
 		 816 aa  210  8e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2226  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  26.2 
 
 		 814 aa  209  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.982689 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0938  molybdopterin oxidoreductase  28.1 
 
 		 817 aa  209  1e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0255421  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00898  dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit A  25.75 
 
 		 814 aa  208  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0778088  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2749  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  25.75 
 
 		 814 aa  208  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1056  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  25.75 
 
 		 814 aa  207  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3394  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  25.68 
 
 		 816 aa  208  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0999  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  25.75 
 
 		 814 aa  208  4e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00905  hypothetical protein  25.75 
 
 		 814 aa  208  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0839348  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2702  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  25.75 
 
 		 814 aa  208  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.98868 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  25.75 
 
 		 814 aa  207  4e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2539  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.88 
 
 		 766 aa  206  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1063  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.01 
 
 		 814 aa  205  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0105709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0895  Nitrate reductase  27.65 
 
 		 711 aa  205  2e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.381214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.01 
 
 		 814 aa  205  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1078  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.01 
 
 		 814 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.965114 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1029  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  25.68 
 
 		 814 aa  204  5e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3092  molybdopterin oxidoreductase  25.03 
 
 		 791 aa  204  6e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1921  molybdopterin oxidoreductase  25.22 
 
 		 669 aa  204  6e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0998  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  25.26 
 
 		 814 aa  202  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.181006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  26.66 
 
 		 726 aa  202  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2013  molybdopterin oxidoreductase  26.62 
 
 		 1055 aa  201  5e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1418  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  24.44 
 
 		 814 aa  201  5e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  25.19 
 
 		 685 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0930  molybdopterin oxidoreductase  26.71 
 
 		 731 aa  198  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.99852  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  25.3 
 
 		 692 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2255  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  26.53 
 
 		 814 aa  198  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848686  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0166  Formate dehydrogenase  28.4 
 
 		 711 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149305 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0422  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  26.25 
 
 		 806 aa  196  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0580651  decreased coverage  0.000000000595111 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  25.98 
 
 		 666 aa  196  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  26.52 
 
 		 708 aa  195  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1880  Formate dehydrogenase  25.62 
 
 		 744 aa  195  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>