More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0320 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2860  molybdopterin oxidoreductase  73.38 
 
 		 695 aa  1082    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1076  thiosulfate reductase, putative  74.68 
 
 		 708 aa  1070    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1318  molybdopterin oxidoreductase  64.75 
 
 		 695 aa  935    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.952277  hitchhiker  0.000256409 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2794  molybdopterin oxidoreductase  73.68 
 
 		 698 aa  1082    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0320  Formate dehydrogenase  100 
 
 		 700 aa  1444    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1667  Formate dehydrogenase  57.89 
 
 		 704 aa  823    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.982617  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  44.13 
 
 		 695 aa  557  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  34.23 
 
 		 760 aa  382  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  33.85 
 
 		 760 aa  376  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  33.38 
 
 		 764 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  34 
 
 		 760 aa  375  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  33.24 
 
 		 764 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  33.1 
 
 		 764 aa  368  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  33.29 
 
 		 758 aa  365  2e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  33.14 
 
 		 730 aa  362  9e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  34.09 
 
 		 722 aa  361  2e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  33.05 
 
 		 764 aa  360  6e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  33.47 
 
 		 760 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  33.05 
 
 		 764 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  33.66 
 
 		 731 aa  353  5.9999999999999994e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  33.33 
 
 		 731 aa  351  2e-95  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  33.14 
 
 		 760 aa  351  3e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  32.34 
 
 		 760 aa  348  3e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  32.29 
 
 		 758 aa  343  5e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  33.58 
 
 		 759 aa  342  1e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2235  thiosulfate reductase  32.14 
 
 		 758 aa  341  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209797  normal  0.286987 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  32.14 
 
 		 758 aa  341  2.9999999999999998e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  32.14 
 
 		 758 aa  340  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  32.29 
 
 		 758 aa  340  4e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0269  Nitrate reductase  29.99 
 
 		 754 aa  336  7e-91  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0389  response regulator receiver domain-containing protein  33 
 
 		 757 aa  333  9e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.257769  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0265  molybdopterin oxidoreductase  31.1 
 
 		 764 aa  332  2e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.227459  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1914  thiosulfate reductase  32.59 
 
 		 761 aa  330  4e-89  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.527644  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2813  molybdopterin oxidoreductase  33.29 
 
 		 738 aa  314  3.9999999999999997e-84  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2718  molybdopterin oxidoreductase  33.33 
 
 		 737 aa  300  5e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2632  molybdopterin oxidoreductase  32.78 
 
 		 739 aa  298  3e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.348569  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0345  nitrate reductase  30.91 
 
 		 731 aa  297  4e-79  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213856  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3188  molybdopterin oxidoreductase  30.91 
 
 		 756 aa  297  5e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  31.52 
 
 		 744 aa  293  7e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  31.32 
 
 		 750 aa  292  2e-77  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2338  molybdopterin oxidoreductase  30.91 
 
 		 729 aa  289  1e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2562  formate dehydrogenase  27.96 
 
 		 720 aa  267  5e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0620  twin-arginine translocation pathway signal  28.88 
 
 		 741 aa  264  4e-69  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.390565  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1509  Formate dehydrogenase  29.19 
 
 		 732 aa  261  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0442  molybdopterin oxidoreductase  29.94 
 
 		 731 aa  260  5.0000000000000005e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2400  molybdopterin oxidoreductase  27.39 
 
 		 738 aa  259  1e-67  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0425196  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  29.47 
 
 		 739 aa  259  1e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0447  molybdopterin oxidoreductase  29.69 
 
 		 731 aa  255  2.0000000000000002e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2386  molybdopterin oxidoreductase  28.3 
 
 		 747 aa  251  5e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2276  molybdopterin oxidoreductase  31.85 
 
 		 807 aa  250  7e-65  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2919  molybdopterin oxidoreductase  28.75 
 
 		 733 aa  249  1e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0912  molybdopterin oxidoreductase  27.37 
 
 		 739 aa  246  9.999999999999999e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02090  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  28.47 
 
 		 734 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  29.09 
 
 		 698 aa  241  5e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  29.55 
 
 		 891 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  26.64 
 
 		 729 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1335  molybdopterin oxidoreductase  25.66 
 
 		 928 aa  212  2e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.374333  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  28.51 
 
 		 747 aa  212  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  27.91 
 
 		 745 aa  211  3e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1484  Nitrate reductase  27.06 
 
 		 739 aa  204  4e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  26.1 
 
 		 812 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  27.2 
 
 		 726 aa  195  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.88 
 
 		 685 aa  194  4e-48  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1880  Formate dehydrogenase  25.18 
 
 		 744 aa  193  9e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  27.69 
 
 		 1135 aa  189  1e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0171  molybdopterin oxidoreductase  27.82 
 
 		 709 aa  188  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.662613  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2738  molybdopterin oxidoreductase  28.09 
 
 		 671 aa  187  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  28.14 
 
 		 1143 aa  187  8e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  28.2 
 
 		 700 aa  185  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.23 
 
 		 893 aa  182  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0930  molybdopterin oxidoreductase  27.19 
 
 		 731 aa  182  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.99852  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  27.25 
 
 		 711 aa  180  9e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  27.06 
 
 		 1139 aa  180  9e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  26.38 
 
 		 936 aa  179  1e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3416  molybdopterin oxidoreductase  29.34 
 
 		 708 aa  179  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.928899  normal  0.530079 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1006  molybdopterin oxidoreductase  26.52 
 
 		 761 aa  178  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.249803 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  29.1 
 
 		 708 aa  178  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0126  formate dehydrogenase  25.97 
 
 		 685 aa  177  6e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  26.95 
 
 		 899 aa  176  9.999999999999999e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  26.08 
 
 		 692 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  27 
 
 		 745 aa  173  7.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0880  molybdopterin oxidoreductase family protein  27.73 
 
 		 671 aa  173  9e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.772127  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0895  Nitrate reductase  26.4 
 
 		 711 aa  172  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.381214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0899  Formate dehydrogenase  25.18 
 
 		 756 aa  173  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0643  formate dehydrogenase  28.51 
 
 		 764 aa  170  7e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  27.47 
 
 		 900 aa  170  9e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2013  molybdopterin oxidoreductase  24.96 
 
 		 1055 aa  169  1e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.84 
 
 		 905 aa  169  1e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2539  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.8 
 
 		 766 aa  169  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.3 
 
 		 893 aa  169  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0938  molybdopterin oxidoreductase  25.99 
 
 		 817 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0255421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.42 
 
 		 688 aa  168  4e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0541  molybdopterin oxidoreductase  26.32 
 
 		 755 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  24.9 
 
 		 732 aa  167  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2605  twin-arginine translocation pathway signal  24.35 
 
 		 879 aa  166  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4673  molybdopterin oxidoreductase  25.77 
 
 		 690 aa  166  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.120803  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  26.22 
 
 		 726 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  25.96 
 
 		 734 aa  165  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2426  molybdopterin oxidoreductase  29.2 
 
 		 826 aa  164  7e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242196 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2187  molybdopterin oxidoreductase  26.68 
 
 		 725 aa  162  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000199348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>