More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5194 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1942  molybdopterin oxidoreductase  53.97 
 
 
758 aa  639    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.838902 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3605  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  52.19 
 
 
756 aa  637    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0340  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  66.45 
 
 
776 aa  789    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.422952  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3742  molybdopterin oxidoreductase  46.78 
 
 
774 aa  672    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.922901  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5194  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
845 aa  1688    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.050154  normal  0.834363 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1389  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  55.39 
 
 
772 aa  626  1e-178  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0600897  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3611  molybdopterin oxidoreductase  41.68 
 
 
759 aa  608  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.507632  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1789  dimethylsulfoxide reductase  51.63 
 
 
756 aa  602  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.858784  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21940  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  54.5 
 
 
756 aa  601  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2539  molybdopterin oxidoreductase  52.37 
 
 
777 aa  597  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2769  molybdopterin oxidoreductase  54.43 
 
 
836 aa  593  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3958  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  52.96 
 
 
798 aa  592  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0664262  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3139  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  49.1 
 
 
789 aa  592  1e-167  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.167271  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2166  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  52.2 
 
 
762 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2212  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  52.2 
 
 
762 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.752976  normal  0.0546044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2155  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  52.37 
 
 
762 aa  583  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353685 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7853  molybdopterin oxidoreductase  47.5 
 
 
784 aa  581  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.710352  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2438  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  52.1 
 
 
775 aa  579  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156692  normal  0.122475 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5717  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  48.22 
 
 
768 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3648  molybdopterin oxidoreductase  42.09 
 
 
763 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.114285 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4344  molybdopterin oxidoreductase  49.6 
 
 
760 aa  561  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0116562  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3214  molybdopterin oxidoreductase  48.86 
 
 
783 aa  554  1e-156  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6311  molybdopterin oxidoreductase  39.03 
 
 
786 aa  548  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813095  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11470  molybdopterin oxidoreductase  49.43 
 
 
766 aa  546  1e-154  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000112103  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4801  molybdopterin oxidoreductase  46.53 
 
 
796 aa  546  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1492  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  47.06 
 
 
773 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3613  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  40.85 
 
 
760 aa  536  1e-151  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.908584  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3831  molybdopterin oxidoreductase  46.82 
 
 
752 aa  529  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3229  molybdopterin oxidoreductase  39.37 
 
 
753 aa  519  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1145  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  37.37 
 
 
825 aa  514  1e-144  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259974  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1026  molybdopterin oxidoreductase  45.02 
 
 
753 aa  509  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0974  molybdopterin oxidoreductase  44.86 
 
 
753 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3160  molybdopterin oxidoreductase  45.19 
 
 
752 aa  506  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3247  molybdopterin oxidoreductase  42.12 
 
 
751 aa  505  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000784055 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3382  molybdopterin oxidoreductase  44.73 
 
 
752 aa  494  9.999999999999999e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.471363  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0922  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  44.73 
 
 
752 aa  495  9.999999999999999e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433061  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3891  molybdopterin oxidoreductase  44.44 
 
 
770 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4593  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  41.06 
 
 
771 aa  492  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0871534  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2645  molybdopterin oxidoreductase  44.14 
 
 
771 aa  475  1e-132  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1877  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  34.98 
 
 
820 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0361  molybdopterin oxidoreductase  32.65 
 
 
841 aa  463  1e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4273  hypothetical protein  34 
 
 
827 aa  462  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1287  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  39.59 
 
 
823 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1751  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  40.32 
 
 
824 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3233  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  38.02 
 
 
826 aa  453  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000820415 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1314  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  38.39 
 
 
809 aa  449  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.887927 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3775  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  40.03 
 
 
822 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0227198  normal  0.692951 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01843  trimethylamine N-oxide reductase system III, catalytic subunit  38.39 
 
 
809 aa  449  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1768  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  38.39 
 
 
809 aa  449  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.876265  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1967  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  38.39 
 
 
815 aa  449  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3048  DMSO/TMAO-reductase  39.87 
 
 
822 aa  449  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180176  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0658  twin-arginine translocation pathway signal  34.23 
 
 
817 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1760  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  38.39 
 
 
809 aa  449  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2103  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  38.07 
 
 
815 aa  444  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1994  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  31.13 
 
 
830 aa  445  1e-123  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0339743  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1459  trimethylamine N-oxide reductase, catalytic subunit  31.93 
 
 
839 aa  443  1e-123  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.278851  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2165  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  38.07 
 
 
815 aa  445  1e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2608  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  37.91 
 
 
809 aa  444  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.022137 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0806  trimethylamine-N-oxide reductase 2, biotin sulfoxide reductase  37.34 
 
 
801 aa  440  9.999999999999999e-123  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1396  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.2 
 
 
835 aa  436  1e-121  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1514  trimethylamine-n-oxide reductase 2 (tmaoreductase 2) (trimethylamine oxidase 2)  36.34 
 
 
828 aa  437  1e-121  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0894241  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0291  biotin sulfoxide reductase  31.66 
 
 
838 aa  439  1e-121  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3526  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  31.36 
 
 
830 aa  434  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170885  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0392  trimethylamine-n-oxide reductase 2 (tmaoreductase 2) (trimethylamine oxidase 2)  31.42 
 
 
856 aa  433  1e-120  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0391  biotin sulfoxide reductase (BDS reductase) (bsoreductase)  31.18 
 
 
837 aa  424  1e-117  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0186908  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0738  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  34.8 
 
 
822 aa  421  1e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0394  biotin sulfoxide reductase (BDS reductase) (bsoreductase)  31.27 
 
 
839 aa  420  1e-116  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3967  biotin sulfoxide reductase  38.71 
 
 
777 aa  419  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4926  biotin sulfoxide reductase  38.14 
 
 
777 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3839  biotin sulfoxide reductase  38.46 
 
 
777 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3858  biotin sulfoxide reductase  38.62 
 
 
777 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3923  biotin sulfoxide reductase  38.56 
 
 
777 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.937494  normal  0.611984 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4027  biotin sulfoxide reductase  38.71 
 
 
777 aa  419  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633224  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0161  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  38.29 
 
 
777 aa  414  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0165  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  38.14 
 
 
777 aa  415  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000871  biotin sulfoxide reductase  36.38 
 
 
815 aa  414  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0214  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  30.77 
 
 
840 aa  414  1e-114  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3976  biotin sulfoxide reductase  37.75 
 
 
777 aa  414  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3871  biotin sulfoxide reductase  37.98 
 
 
777 aa  414  1e-114  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1538  biotin sulfoxide reductase  36.35 
 
 
815 aa  416  1e-114  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3752  biotin sulfoxide reductase  38.14 
 
 
777 aa  415  1e-114  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03352  hypothetical protein  39.06 
 
 
759 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03401  biotin sulfoxide reductase  39.06 
 
 
759 aa  410  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4045  biotin sulfoxide reductase  37.83 
 
 
777 aa  411  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2798  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  29.71 
 
 
828 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0178103 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0173  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  38.39 
 
 
775 aa  409  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0987  trimethylamine-N-oxide reductase  30.38 
 
 
829 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3343  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  30.06 
 
 
830 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.922902  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06846  hypothetical protein  35.01 
 
 
815 aa  399  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0772  trimethylamine-N-oxide reductase precursor  35.64 
 
 
820 aa  389  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0848  molybdopterin oxidoreductase domain-containing protein  35.28 
 
 
816 aa  387  1e-106  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4154  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  35.59 
 
 
850 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.208646  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4050  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  35.59 
 
 
850 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0661  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  37.42 
 
 
792 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4212  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  35.59 
 
 
850 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4033  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  35.59 
 
 
850 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4105  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  35.43 
 
 
850 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1395  radical SAM domain-containing protein  33.88 
 
 
855 aa  385  1e-105  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1673  trimethylamine-N-oxide reductase precursor  34.49 
 
 
822 aa  382  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3360  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  33.49 
 
 
830 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>