More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_0161 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_0165  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  98.84 
 
 		 777 aa  1604    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01843  trimethylamine N-oxide reductase system III, catalytic subunit  63.91 
 
 		 809 aa  1065    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03401  biotin sulfoxide reductase  98.55 
 
 		 759 aa  1561    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0161  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  100 
 
 		 777 aa  1618    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1768  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  63.65 
 
 		 809 aa  1060    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.876265  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1760  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  63.91 
 
 		 809 aa  1065    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3839  biotin sulfoxide reductase  85.59 
 
 		 777 aa  1405    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000871  biotin sulfoxide reductase  63.61 
 
 		 815 aa  1065    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3048  DMSO/TMAO-reductase  50.07 
 
 		 822 aa  759    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180176  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2103  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  63.91 
 
 		 815 aa  1063    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1287  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  45.98 
 
 		 823 aa  723    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3967  biotin sulfoxide reductase  85.71 
 
 		 777 aa  1407    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3923  biotin sulfoxide reductase  85.59 
 
 		 777 aa  1405    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.937494  normal  0.611984 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1751  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  46.86 
 
 		 824 aa  721    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1396  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  44.56 
 
 		 835 aa  719    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1145  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  47.01 
 
 		 825 aa  726    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1314  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  64.04 
 
 		 809 aa  1066    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.887927 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4027  biotin sulfoxide reductase  85.59 
 
 		 777 aa  1405    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633224  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03352  hypothetical protein  98.55 
 
 		 759 aa  1561    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0806  trimethylamine-N-oxide reductase 2, biotin sulfoxide reductase  53.17 
 
 		 801 aa  866    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06846  hypothetical protein  62.29 
 
 		 815 aa  1057    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3752  biotin sulfoxide reductase  98.84 
 
 		 777 aa  1604    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1967  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  63.91 
 
 		 815 aa  1065    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0738  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  42.7 
 
 		 822 aa  658    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1459  trimethylamine N-oxide reductase, catalytic subunit  46.17 
 
 		 839 aa  751    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.278851  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3871  biotin sulfoxide reductase  98.07 
 
 		 777 aa  1587    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2608  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  63.78 
 
 		 809 aa  1061    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.022137 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1395  radical SAM domain-containing protein  47.3 
 
 		 855 aa  746    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0291  biotin sulfoxide reductase  46.48 
 
 		 838 aa  746    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3775  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  50.2 
 
 		 822 aa  761    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0227198  normal  0.692951 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3976  biotin sulfoxide reductase  98.33 
 
 		 777 aa  1587    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4926  biotin sulfoxide reductase  98.71 
 
 		 777 aa  1600    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4045  biotin sulfoxide reductase  98.2 
 
 		 777 aa  1593    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4273  hypothetical protein  45.67 
 
 		 827 aa  701    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0173  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  83.2 
 
 		 775 aa  1375    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2165  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  64.17 
 
 		 815 aa  1068    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3233  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  49.03 
 
 		 826 aa  752    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000820415 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1538  biotin sulfoxide reductase  63.44 
 
 		 815 aa  1060    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3858  biotin sulfoxide reductase  85.71 
 
 		 777 aa  1406    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1514  trimethylamine-n-oxide reductase 2 (tmaoreductase 2) (trimethylamine oxidase 2)  48.21 
 
 		 828 aa  762    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0894241  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0391  biotin sulfoxide reductase (BDS reductase) (bsoreductase)  45.11 
 
 		 837 aa  734    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0186908  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0392  trimethylamine-n-oxide reductase 2 (tmaoreductase 2) (trimethylamine oxidase 2)  47.53 
 
 		 856 aa  782    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0394  biotin sulfoxide reductase (BDS reductase) (bsoreductase)  47.1 
 
 		 839 aa  753    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1877  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  42.25 
 
 		 820 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0361  molybdopterin oxidoreductase  40.8 
 
 		 841 aa  612  9.999999999999999e-175  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4033  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  43.27 
 
 		 850 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4050  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  43.14 
 
 		 850 aa  606  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4105  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  43.14 
 
 		 850 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4154  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  43.27 
 
 		 850 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.208646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4212  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  43.27 
 
 		 850 aa  607  9.999999999999999e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01000  trimethylamine N-oxide (TMAO) reductase I, catalytic subunit  42.66 
 
 		 848 aa  599  1e-170  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01007  hypothetical protein  42.66 
 
 		 848 aa  599  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0658  twin-arginine translocation pathway signal  44.27 
 
 		 817 aa  598  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1233  trimethylamine-N-oxide reductase  42.66 
 
 		 848 aa  599  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1114  trimethylamine-N-oxide reductase  42.66 
 
 		 848 aa  602  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2127  trimethylamine-N-oxide reductase  42.53 
 
 		 848 aa  598  1e-169  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.600325  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2645  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  42.66 
 
 		 848 aa  598  1e-169  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1108  trimethylamine-N-oxide reductase  42.53 
 
 		 848 aa  597  1e-169  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2598  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  42.66 
 
 		 848 aa  598  1e-169  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3360  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  39.25 
 
 		 830 aa  586  1e-166  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1232  trimethylamine-N-oxide reductase  40.2 
 
 		 829 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1154  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  39.62 
 
 		 829 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3352  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  39.75 
 
 		 829 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2798  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  41.42 
 
 		 828 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0178103 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3213  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  39.62 
 
 		 829 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1051  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  39.57 
 
 		 829 aa  581  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1116  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  39.57 
 
 		 829 aa  581  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.310041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1055  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  39.45 
 
 		 829 aa  580  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3526  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  40.89 
 
 		 830 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4218  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  42.95 
 
 		 837 aa  577  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.216901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1994  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  39.55 
 
 		 830 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0339743  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3343  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  40.6 
 
 		 830 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.922902  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0848  molybdopterin oxidoreductase domain-containing protein  38.85 
 
 		 816 aa  570  1e-161  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0987  trimethylamine-N-oxide reductase  38.41 
 
 		 829 aa  567  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0214  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  39.04 
 
 		 840 aa  568  1e-160  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2731  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  39.62 
 
 		 838 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1673  trimethylamine-N-oxide reductase precursor  38.28 
 
 		 822 aa  560  1e-158  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1833  trimethylamine-N-oxide reductase  38.39 
 
 		 830 aa  558  1e-157  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1389  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  42.18 
 
 		 772 aa  557  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0600897  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3605  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  39.04 
 
 		 756 aa  551  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0661  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  39.74 
 
 		 792 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3891  molybdopterin oxidoreductase  42.12 
 
 		 770 aa  551  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0772  trimethylamine-N-oxide reductase precursor  37.06 
 
 		 820 aa  547  1e-154  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003825  trimethylamine-N-oxide reductase  38.04 
 
 		 820 aa  544  1e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01857  hypothetical protein  38.04 
 
 		 820 aa  543  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1296  trimethylamine-N-oxide reductase  37.91 
 
 		 820 aa  541  9.999999999999999e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2539  molybdopterin oxidoreductase  40.03 
 
 		 777 aa  538  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2278  dimethyl sulfoxide reductase precursor  38.92 
 
 		 890 aa  538  1e-151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.630178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1942  molybdopterin oxidoreductase  39.66 
 
 		 758 aa  538  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.838902 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2769  molybdopterin oxidoreductase  42.05 
 
 		 836 aa  532  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0340  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  39.49 
 
 		 776 aa  532  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.422952  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1492  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  40.98 
 
 		 773 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2044  trimethylamine-n-oxide reductase 1 (tmaoreductase 1) (trimethylamine oxidase 1)  36.88 
 
 		 816 aa  530  1e-149  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5717  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  39.97 
 
 		 768 aa  526  1e-148  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0406  radical SAM domain-containing protein  35.97 
 
 		 817 aa  526  1e-148  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0430  biotin sulfoxide reductase  39.12 
 
 		 799 aa  526  1e-148  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.559575  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3648  molybdopterin oxidoreductase  42.04 
 
 		 763 aa  523  1e-147  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114285 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3831  molybdopterin oxidoreductase  40.26 
 
 		 752 aa  521  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1119  hypothetical protein  36.73 
 
 		 813 aa  519  1.0000000000000001e-145  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0685924  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3611  molybdopterin oxidoreductase  41.85 
 
 		 759 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.507632  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>