More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2798 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01000  trimethylamine N-oxide (TMAO) reductase I, catalytic subunit  52.34 
 
 		 848 aa  880    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0738  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  43.58 
 
 		 822 aa  716    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2645  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  52.34 
 
 		 848 aa  882    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1114  trimethylamine-N-oxide reductase  52.22 
 
 		 848 aa  878    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1833  trimethylamine-N-oxide reductase  80.68 
 
 		 830 aa  1458    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1232  trimethylamine-N-oxide reductase  84.89 
 
 		 829 aa  1508    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3343  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  85.89 
 
 		 830 aa  1538    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.922902  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1108  trimethylamine-N-oxide reductase  52.1 
 
 		 848 aa  879    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3048  DMSO/TMAO-reductase  46.31 
 
 		 822 aa  760    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180176  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1287  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  46.67 
 
 		 823 aa  754    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05452  trimethylamine-N-oxide reductase 1  42.89 
 
 		 808 aa  652    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4050  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  51.44 
 
 		 850 aa  874    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3526  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  86.58 
 
 		 830 aa  1524    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1233  trimethylamine-N-oxide reductase  52.1 
 
 		 848 aa  872    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01857  hypothetical protein  64.86 
 
 		 820 aa  1149    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0658  twin-arginine translocation pathway signal  43.49 
 
 		 817 aa  640    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1751  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  45.82 
 
 		 824 aa  744    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1877  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  40.82 
 
 		 820 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1145  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  44.47 
 
 		 825 aa  731    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4033  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  51.56 
 
 		 850 aa  874    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2598  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  52.34 
 
 		 848 aa  882    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0361  molybdopterin oxidoreductase  41.2 
 
 		 841 aa  653    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0806  trimethylamine-N-oxide reductase 2, biotin sulfoxide reductase  44.12 
 
 		 801 aa  667    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1673  trimethylamine-N-oxide reductase precursor  59.73 
 
 		 822 aa  1082    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1051  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  85.37 
 
 		 829 aa  1535    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3360  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  88.27 
 
 		 830 aa  1574    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1116  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  85.37 
 
 		 829 aa  1535    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.310041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1994  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  87.42 
 
 		 830 aa  1563    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0339743  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3352  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  85.25 
 
 		 829 aa  1532    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4105  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  51.44 
 
 		 850 aa  874    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1055  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  85.37 
 
 		 829 aa  1536    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01007  hypothetical protein  52.34 
 
 		 848 aa  880    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0987  trimethylamine-N-oxide reductase  81.38 
 
 		 829 aa  1467    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0772  trimethylamine-N-oxide reductase precursor  66.02 
 
 		 820 aa  1185    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3233  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  42.19 
 
 		 826 aa  649    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000820415 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3775  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  46.19 
 
 		 822 aa  757    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0227198  normal  0.692951 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2731  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  61.26 
 
 		 838 aa  1052    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4154  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  51.44 
 
 		 850 aa  873    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.208646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2798  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  100 
 
 		 828 aa  1734    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0178103 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003825  trimethylamine-N-oxide reductase  65.3 
 
 		 820 aa  1165    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4273  hypothetical protein  42.17 
 
 		 827 aa  701    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4218  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  51.21 
 
 		 837 aa  872    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.216901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1296  trimethylamine-N-oxide reductase  64.81 
 
 		 820 aa  1172    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0214  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  59.71 
 
 		 840 aa  1075    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1154  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  85.25 
 
 		 829 aa  1531    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4212  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  51.44 
 
 		 850 aa  873    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3213  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  85.25 
 
 		 829 aa  1529    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2127  trimethylamine-N-oxide reductase  52.34 
 
 		 848 aa  879    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.600325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000871  biotin sulfoxide reductase  40.53 
 
 		 815 aa  627  1e-178  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1514  trimethylamine-n-oxide reductase 2 (tmaoreductase 2) (trimethylamine oxidase 2)  40.69 
 
 		 828 aa  625  1e-178  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0894241  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01843  trimethylamine N-oxide reductase system III, catalytic subunit  40.33 
 
 		 809 aa  617  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1768  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  40.21 
 
 		 809 aa  615  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.876265  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1760  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  40.33 
 
 		 809 aa  617  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1314  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  40.45 
 
 		 809 aa  618  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.887927 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1396  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  39.95 
 
 		 835 aa  618  1e-175  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2608  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  40.1 
 
 		 809 aa  616  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.022137 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1967  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  40.33 
 
 		 815 aa  617  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2165  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  40.21 
 
 		 815 aa  614  9.999999999999999e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2103  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  40.21 
 
 		 815 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1459  trimethylamine N-oxide reductase, catalytic subunit  40.16 
 
 		 839 aa  614  9.999999999999999e-175  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.278851  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1538  biotin sulfoxide reductase  39.45 
 
 		 815 aa  613  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0291  biotin sulfoxide reductase  40 
 
 		 838 aa  608  9.999999999999999e-173  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0391  biotin sulfoxide reductase (BDS reductase) (bsoreductase)  40.5 
 
 		 837 aa  607  9.999999999999999e-173  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0186908  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0394  biotin sulfoxide reductase (BDS reductase) (bsoreductase)  39.9 
 
 		 839 aa  608  9.999999999999999e-173  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06846  hypothetical protein  39.81 
 
 		 815 aa  603  1.0000000000000001e-171  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0392  trimethylamine-n-oxide reductase 2 (tmaoreductase 2) (trimethylamine oxidase 2)  39.11 
 
 		 856 aa  597  1e-169  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4926  biotin sulfoxide reductase  41.56 
 
 		 777 aa  590  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3839  biotin sulfoxide reductase  40.75 
 
 		 777 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3871  biotin sulfoxide reductase  41.42 
 
 		 777 aa  588  1e-166  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3858  biotin sulfoxide reductase  40.88 
 
 		 777 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1395  radical SAM domain-containing protein  38.5 
 
 		 855 aa  587  1e-166  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3752  biotin sulfoxide reductase  41.42 
 
 		 777 aa  588  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3967  biotin sulfoxide reductase  42.05 
 
 		 777 aa  586  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0165  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  41.42 
 
 		 777 aa  588  1e-166  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0173  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  41.75 
 
 		 775 aa  586  1e-166  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03401  biotin sulfoxide reductase  41.42 
 
 		 759 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0161  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  41.42 
 
 		 777 aa  585  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03352  hypothetical protein  41.42 
 
 		 759 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4027  biotin sulfoxide reductase  41.92 
 
 		 777 aa  585  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633224  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4045  biotin sulfoxide reductase  41.03 
 
 		 777 aa  583  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3923  biotin sulfoxide reductase  40.62 
 
 		 777 aa  585  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.937494  normal  0.611984 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3976  biotin sulfoxide reductase  41.56 
 
 		 777 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0661  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  42.48 
 
 		 792 aa  581  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0848  molybdopterin oxidoreductase domain-containing protein  38.38 
 
 		 816 aa  572  1.0000000000000001e-162  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0430  biotin sulfoxide reductase  38.74 
 
 		 799 aa  536  1e-151  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.559575  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0406  radical SAM domain-containing protein  36.45 
 
 		 817 aa  536  1e-151  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2044  trimethylamine-n-oxide reductase 1 (tmaoreductase 1) (trimethylamine oxidase 1)  36.19 
 
 		 816 aa  535  1e-150  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3891  molybdopterin oxidoreductase  38.28 
 
 		 770 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3139  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  37.69 
 
 		 789 aa  524  1e-147  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.167271  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1119  hypothetical protein  36.27 
 
 		 813 aa  517  1.0000000000000001e-145  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0685924  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3742  molybdopterin oxidoreductase  36.69 
 
 		 774 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.922901  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2278  dimethyl sulfoxide reductase precursor  37.53 
 
 		 890 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.630178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3605  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  35.37 
 
 		 756 aa  511  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1389  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  38.21 
 
 		 772 aa  509  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0600897  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0340  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  36.35 
 
 		 776 aa  509  9.999999999999999e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.422952  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1942  molybdopterin oxidoreductase  37.22 
 
 		 758 aa  508  9.999999999999999e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.838902 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0429  trimethylamine-N-oxide reductase 2  38.18 
 
 		 793 aa  505  1e-141  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.160806  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21940  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  37.28 
 
 		 756 aa  503  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3611  molybdopterin oxidoreductase  38.39 
 
 		 759 aa  499  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.507632  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0974  molybdopterin oxidoreductase  36.45 
 
 		 753 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>