More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3139 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1789  dimethylsulfoxide reductase  52.32 
 
 		 756 aa  756    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.858784  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3605  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  51.92 
 
 		 756 aa  793    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0340  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  54.59 
 
 		 776 aa  765    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.422952  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5717  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  49.41 
 
 		 768 aa  707    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1492  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  48.76 
 
 		 773 aa  691    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3139  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  100 
 
 		 789 aa  1612    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.167271  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21940  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  53.72 
 
 		 756 aa  746    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0974  molybdopterin oxidoreductase  46.64 
 
 		 753 aa  643    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6311  molybdopterin oxidoreductase  47.5 
 
 		 786 aa  674    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2166  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  53 
 
 		 762 aa  744    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2539  molybdopterin oxidoreductase  49.93 
 
 		 777 aa  717    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2645  molybdopterin oxidoreductase  47.41 
 
 		 771 aa  636    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3611  molybdopterin oxidoreductase  48.5 
 
 		 759 aa  694    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.507632  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3742  molybdopterin oxidoreductase  56.21 
 
 		 774 aa  835    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.922901  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1942  molybdopterin oxidoreductase  52.99 
 
 		 758 aa  752    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.838902 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3247  molybdopterin oxidoreductase  46.51 
 
 		 751 aa  641    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000784055 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3831  molybdopterin oxidoreductase  47.57 
 
 		 752 aa  644    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3891  molybdopterin oxidoreductase  48.02 
 
 		 770 aa  677    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7853  molybdopterin oxidoreductase  61.99 
 
 		 784 aa  938    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.710352  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2769  molybdopterin oxidoreductase  57.14 
 
 		 836 aa  798    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4593  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  49.8 
 
 		 771 aa  647    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0871534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4801  molybdopterin oxidoreductase  49.93 
 
 		 796 aa  700    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2212  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  53 
 
 		 762 aa  744    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.752976  normal  0.0546044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2438  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  54.02 
 
 		 775 aa  739    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156692  normal  0.122475 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3214  molybdopterin oxidoreductase  64.43 
 
 		 783 aa  972    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3613  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  49.07 
 
 		 760 aa  649    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.908584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1389  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  60.21 
 
 		 772 aa  849    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0600897  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3648  molybdopterin oxidoreductase  48.22 
 
 		 763 aa  665    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114285 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2155  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  52.61 
 
 		 762 aa  740    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353685 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3958  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  54.02 
 
 		 798 aa  767    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0664262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1026  molybdopterin oxidoreductase  46.64 
 
 		 753 aa  643    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11470  molybdopterin oxidoreductase  52.67 
 
 		 766 aa  726    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000112103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4344  molybdopterin oxidoreductase  49.01 
 
 		 760 aa  684    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0116562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3160  molybdopterin oxidoreductase  46.71 
 
 		 752 aa  632  1e-180  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3229  molybdopterin oxidoreductase  46.17 
 
 		 753 aa  617  1e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0922  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  45.58 
 
 		 752 aa  609  1e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433061  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3048  DMSO/TMAO-reductase  42.25 
 
 		 822 aa  605  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180176  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3382  molybdopterin oxidoreductase  44.77 
 
 		 752 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.471363  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3775  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  42.25 
 
 		 822 aa  605  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0227198  normal  0.692951 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1145  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  43.75 
 
 		 825 aa  599  1e-170  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1287  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  41.96 
 
 		 823 aa  594  1e-168  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1751  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  42.31 
 
 		 824 aa  592  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4273  hypothetical protein  42.6 
 
 		 827 aa  580  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0806  trimethylamine-N-oxide reductase 2, biotin sulfoxide reductase  40.85 
 
 		 801 aa  569  1e-161  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0658  twin-arginine translocation pathway signal  41.94 
 
 		 817 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5194  molybdopterin oxidoreductase  49.1 
 
 		 845 aa  556  1e-157  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.050154  normal  0.834363 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1877  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  39.72 
 
 		 820 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3343  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  38.46 
 
 		 830 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.922902  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3233  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  38.28 
 
 		 826 aa  537  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000820415 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3360  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  38.35 
 
 		 830 aa  535  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2798  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  37.69 
 
 		 828 aa  533  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0178103 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01000  trimethylamine N-oxide (TMAO) reductase I, catalytic subunit  40.93 
 
 		 848 aa  530  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2645  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  40.93 
 
 		 848 aa  532  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2598  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  40.93 
 
 		 848 aa  532  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1108  trimethylamine-N-oxide reductase  40.67 
 
 		 848 aa  529  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0848  molybdopterin oxidoreductase domain-containing protein  37.93 
 
 		 816 aa  530  1e-149  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0738  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  37.29 
 
 		 822 aa  530  1e-149  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3858  biotin sulfoxide reductase  40.7 
 
 		 777 aa  529  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1114  trimethylamine-N-oxide reductase  40.8 
 
 		 848 aa  529  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01007  hypothetical protein  40.93 
 
 		 848 aa  530  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2127  trimethylamine-N-oxide reductase  40.93 
 
 		 848 aa  527  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.600325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3839  biotin sulfoxide reductase  40.44 
 
 		 777 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3967  biotin sulfoxide reductase  40.44 
 
 		 777 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0173  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  40.16 
 
 		 775 aa  526  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4212  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  40.49 
 
 		 850 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01843  trimethylamine N-oxide reductase system III, catalytic subunit  39.07 
 
 		 809 aa  524  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1768  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  39.2 
 
 		 809 aa  524  1e-147  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.876265  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1760  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  39.07 
 
 		 809 aa  524  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3526  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  37.72 
 
 		 830 aa  524  1e-147  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1967  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  39.07 
 
 		 815 aa  524  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4033  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  40.62 
 
 		 850 aa  524  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4050  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  40.62 
 
 		 850 aa  523  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1994  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  36.35 
 
 		 830 aa  523  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0339743  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1233  trimethylamine-N-oxide reductase  40.67 
 
 		 848 aa  524  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2608  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  38.94 
 
 		 809 aa  524  1e-147  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.022137 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3923  biotin sulfoxide reductase  40.31 
 
 		 777 aa  525  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.937494  normal  0.611984 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0772  trimethylamine-N-oxide reductase precursor  37.61 
 
 		 820 aa  525  1e-147  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0987  trimethylamine-N-oxide reductase  38.39 
 
 		 829 aa  524  1e-147  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4154  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  40.49 
 
 		 850 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.208646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4027  biotin sulfoxide reductase  40.31 
 
 		 777 aa  524  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0361  molybdopterin oxidoreductase  37.16 
 
 		 841 aa  525  1e-147  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3352  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  38.13 
 
 		 829 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4105  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  40.36 
 
 		 850 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2165  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  38.68 
 
 		 815 aa  519  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2103  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  38.94 
 
 		 815 aa  520  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1154  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  38.01 
 
 		 829 aa  519  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1314  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  39.07 
 
 		 809 aa  522  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.887927 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3213  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  38.01 
 
 		 829 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0165  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  39.69 
 
 		 777 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3871  biotin sulfoxide reductase  39.56 
 
 		 777 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4218  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  38.66 
 
 		 837 aa  518  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.216901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3752  biotin sulfoxide reductase  39.69 
 
 		 777 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1514  trimethylamine-n-oxide reductase 2 (tmaoreductase 2) (trimethylamine oxidase 2)  36.81 
 
 		 828 aa  518  1.0000000000000001e-145  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0894241  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03401  biotin sulfoxide reductase  40.95 
 
 		 759 aa  514  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4045  biotin sulfoxide reductase  39.43 
 
 		 777 aa  514  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1538  biotin sulfoxide reductase  38.51 
 
 		 815 aa  513  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03352  hypothetical protein  40.95 
 
 		 759 aa  514  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3976  biotin sulfoxide reductase  40.54 
 
 		 777 aa  510  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0161  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  39.69 
 
 		 777 aa  512  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4926  biotin sulfoxide reductase  39.43 
 
 		 777 aa  511  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>