More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1789 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3247  molybdopterin oxidoreductase  46.7 
 
 
751 aa  670    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000784055 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6311  molybdopterin oxidoreductase  52.44 
 
 
786 aa  791    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813095  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3160  molybdopterin oxidoreductase  48.45 
 
 
752 aa  685    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1789  dimethylsulfoxide reductase  100 
 
 
756 aa  1559    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.858784  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3605  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  91.14 
 
 
756 aa  1429    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0340  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  52.88 
 
 
776 aa  773    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.422952  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5717  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  49.61 
 
 
768 aa  742    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3048  DMSO/TMAO-reductase  43.57 
 
 
822 aa  649    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180176  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1287  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  44.32 
 
 
823 aa  672    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1026  molybdopterin oxidoreductase  46.97 
 
 
753 aa  679    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0922  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  46.5 
 
 
752 aa  644    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433061  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1492  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  53.95 
 
 
773 aa  805    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3139  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  52.32 
 
 
789 aa  785    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.167271  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1751  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  42.65 
 
 
824 aa  636    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1389  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  54.24 
 
 
772 aa  766    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0600897  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1942  molybdopterin oxidoreductase  51.85 
 
 
758 aa  756    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.838902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2166  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  50.53 
 
 
762 aa  712    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2539  molybdopterin oxidoreductase  53.74 
 
 
777 aa  807    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3611  molybdopterin oxidoreductase  54.08 
 
 
759 aa  806    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.507632  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3742  molybdopterin oxidoreductase  50.46 
 
 
774 aa  735    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.922901  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2769  molybdopterin oxidoreductase  53.65 
 
 
836 aa  733    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21940  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  71.58 
 
 
756 aa  1072    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0974  molybdopterin oxidoreductase  46.97 
 
 
753 aa  677    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3382  molybdopterin oxidoreductase  46.09 
 
 
752 aa  643    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.471363  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3229  molybdopterin oxidoreductase  46.63 
 
 
753 aa  649    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3831  molybdopterin oxidoreductase  48.44 
 
 
752 aa  687    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3891  molybdopterin oxidoreductase  50.2 
 
 
770 aa  733    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7853  molybdopterin oxidoreductase  49.14 
 
 
784 aa  737    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.710352  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4801  molybdopterin oxidoreductase  50.33 
 
 
796 aa  732    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2212  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  50.53 
 
 
762 aa  712    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.752976  normal  0.0546044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2438  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  50.39 
 
 
775 aa  705    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156692  normal  0.122475 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3214  molybdopterin oxidoreductase  47.48 
 
 
783 aa  696    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3613  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  47.77 
 
 
760 aa  639    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.908584  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3648  molybdopterin oxidoreductase  54.46 
 
 
763 aa  800    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.114285 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3775  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  43.5 
 
 
822 aa  646    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0227198  normal  0.692951 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2155  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  50.53 
 
 
762 aa  715    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353685 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3958  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  50.39 
 
 
798 aa  715    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0664262  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11470  molybdopterin oxidoreductase  49.54 
 
 
766 aa  701    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000112103  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4344  molybdopterin oxidoreductase  47.81 
 
 
760 aa  674    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0116562  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1145  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  42.95 
 
 
825 aa  629  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259974  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4593  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  47.36 
 
 
771 aa  627  1e-178  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0871534  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3233  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  41.09 
 
 
826 aa  614  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000820415 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2645  molybdopterin oxidoreductase  45.5 
 
 
771 aa  614  9.999999999999999e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4273  hypothetical protein  41.96 
 
 
827 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0806  trimethylamine-N-oxide reductase 2, biotin sulfoxide reductase  40.72 
 
 
801 aa  599  1e-170  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5194  molybdopterin oxidoreductase  51.63 
 
 
845 aa  597  1e-169  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.050154  normal  0.834363 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0738  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  38.51 
 
 
822 aa  595  1e-168  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1877  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  40.83 
 
 
820 aa  585  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0658  twin-arginine translocation pathway signal  41.53 
 
 
817 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3858  biotin sulfoxide reductase  41.71 
 
 
777 aa  576  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3967  biotin sulfoxide reductase  41.71 
 
 
777 aa  575  1.0000000000000001e-163  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3839  biotin sulfoxide reductase  41.58 
 
 
777 aa  573  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1768  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  38.4 
 
 
809 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.876265  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3923  biotin sulfoxide reductase  41.58 
 
 
777 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.937494  normal  0.611984 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0848  molybdopterin oxidoreductase domain-containing protein  38.81 
 
 
816 aa  575  1.0000000000000001e-162  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4027  biotin sulfoxide reductase  41.58 
 
 
777 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633224  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01843  trimethylamine N-oxide reductase system III, catalytic subunit  38.27 
 
 
809 aa  571  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1760  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  38.27 
 
 
809 aa  571  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2165  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  38.61 
 
 
815 aa  571  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1314  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  38.27 
 
 
809 aa  570  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.887927 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1967  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  38.27 
 
 
815 aa  571  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2608  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  38.14 
 
 
809 aa  570  1e-161  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.022137 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0361  molybdopterin oxidoreductase  37.77 
 
 
841 aa  569  1e-161  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2103  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  38.35 
 
 
815 aa  568  1e-160  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3871  biotin sulfoxide reductase  39.48 
 
 
777 aa  553  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0165  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  39.35 
 
 
777 aa  549  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4926  biotin sulfoxide reductase  39.48 
 
 
777 aa  549  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3752  biotin sulfoxide reductase  39.35 
 
 
777 aa  549  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4045  biotin sulfoxide reductase  39.35 
 
 
777 aa  550  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0161  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  39.48 
 
 
777 aa  548  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1459  trimethylamine N-oxide reductase, catalytic subunit  37.53 
 
 
839 aa  547  1e-154  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.278851  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0173  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  39.56 
 
 
775 aa  545  1e-154  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03401  biotin sulfoxide reductase  40.54 
 
 
759 aa  542  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3976  biotin sulfoxide reductase  39.09 
 
 
777 aa  543  1e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0291  biotin sulfoxide reductase  37.83 
 
 
838 aa  542  1e-153  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03352  hypothetical protein  40.54 
 
 
759 aa  542  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2044  trimethylamine-n-oxide reductase 1 (tmaoreductase 1) (trimethylamine oxidase 1)  37.04 
 
 
816 aa  541  9.999999999999999e-153  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1514  trimethylamine-n-oxide reductase 2 (tmaoreductase 2) (trimethylamine oxidase 2)  36.56 
 
 
828 aa  540  9.999999999999999e-153  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0894241  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2127  trimethylamine-N-oxide reductase  40.2 
 
 
848 aa  536  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.600325  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1114  trimethylamine-N-oxide reductase  40.41 
 
 
848 aa  537  1e-151  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06846  hypothetical protein  36.54 
 
 
815 aa  536  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1296  trimethylamine-N-oxide reductase  36.86 
 
 
820 aa  536  1e-151  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1538  biotin sulfoxide reductase  37.06 
 
 
815 aa  536  1e-151  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0392  trimethylamine-n-oxide reductase 2 (tmaoreductase 2) (trimethylamine oxidase 2)  36.2 
 
 
856 aa  533  1e-150  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000871  biotin sulfoxide reductase  36.54 
 
 
815 aa  535  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01000  trimethylamine N-oxide (TMAO) reductase I, catalytic subunit  40.15 
 
 
848 aa  530  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2645  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  40.15 
 
 
848 aa  530  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2598  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  40.15 
 
 
848 aa  530  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1233  trimethylamine-N-oxide reductase  40.28 
 
 
848 aa  531  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01007  hypothetical protein  40.15 
 
 
848 aa  530  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0772  trimethylamine-N-oxide reductase precursor  36.54 
 
 
820 aa  531  1e-149  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0391  biotin sulfoxide reductase (BDS reductase) (bsoreductase)  36.16 
 
 
837 aa  530  1e-149  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0186908  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1108  trimethylamine-N-oxide reductase  40.28 
 
 
848 aa  530  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1119  hypothetical protein  36.11 
 
 
813 aa  522  1e-147  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0685924  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4033  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  39.69 
 
 
850 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3360  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  35.83 
 
 
830 aa  522  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4212  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  39.69 
 
 
850 aa  522  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4154  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  39.69 
 
 
850 aa  521  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.208646  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4218  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  39.15 
 
 
837 aa  520  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.216901  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4050  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  39.69 
 
 
850 aa  522  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>