More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3229 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_0922  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  82.29 
 
 
752 aa  1260    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433061  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3605  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  46.9 
 
 
756 aa  687    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0340  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  47.94 
 
 
776 aa  638    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.422952  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5717  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  47.57 
 
 
768 aa  665    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3831  molybdopterin oxidoreductase  76.03 
 
 
752 aa  1142    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1026  molybdopterin oxidoreductase  74.97 
 
 
753 aa  1138    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1492  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  47.38 
 
 
773 aa  649    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0974  molybdopterin oxidoreductase  74.7 
 
 
753 aa  1132    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21940  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  48.72 
 
 
756 aa  645    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2539  molybdopterin oxidoreductase  47.23 
 
 
777 aa  664    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3611  molybdopterin oxidoreductase  48.52 
 
 
759 aa  678    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.507632  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3742  molybdopterin oxidoreductase  47.54 
 
 
774 aa  662    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.922901  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3382  molybdopterin oxidoreductase  80.96 
 
 
752 aa  1242    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.471363  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3247  molybdopterin oxidoreductase  74.43 
 
 
751 aa  1125    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000784055 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3613  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  48.4 
 
 
760 aa  637    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.908584  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3160  molybdopterin oxidoreductase  86.84 
 
 
752 aa  1341    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3648  molybdopterin oxidoreductase  48.32 
 
 
763 aa  679    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.114285 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3229  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
753 aa  1553    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1942  molybdopterin oxidoreductase  45.43 
 
 
758 aa  633  1e-180  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.838902 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1789  dimethylsulfoxide reductase  46.63 
 
 
756 aa  631  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.858784  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3139  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  46.17 
 
 
789 aa  619  1e-176  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.167271  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3891  molybdopterin oxidoreductase  45.55 
 
 
770 aa  621  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1389  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  47.72 
 
 
772 aa  619  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0600897  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4593  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  47.54 
 
 
771 aa  617  1e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0871534  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2645  molybdopterin oxidoreductase  47.19 
 
 
771 aa  607  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6311  molybdopterin oxidoreductase  43.73 
 
 
786 aa  598  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813095  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3048  DMSO/TMAO-reductase  41.95 
 
 
822 aa  602  1e-170  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180176  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3775  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  41.95 
 
 
822 aa  601  1e-170  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0227198  normal  0.692951 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3958  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  45.5 
 
 
798 aa  600  1e-170  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0664262  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2166  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  45.64 
 
 
762 aa  591  1e-167  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2212  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  45.64 
 
 
762 aa  591  1e-167  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.752976  normal  0.0546044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2155  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  45.5 
 
 
762 aa  591  1e-167  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353685 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3214  molybdopterin oxidoreductase  44.55 
 
 
783 aa  586  1e-166  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2769  molybdopterin oxidoreductase  47.11 
 
 
836 aa  586  1e-166  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4801  molybdopterin oxidoreductase  43.01 
 
 
796 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1751  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  41.84 
 
 
824 aa  581  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7853  molybdopterin oxidoreductase  43.57 
 
 
784 aa  582  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.710352  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2438  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  45.49 
 
 
775 aa  581  1e-164  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156692  normal  0.122475 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3233  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  40.59 
 
 
826 aa  568  1e-161  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000820415 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1145  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  40.92 
 
 
825 aa  567  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259974  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1287  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  40.63 
 
 
823 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0806  trimethylamine-N-oxide reductase 2, biotin sulfoxide reductase  40.45 
 
 
801 aa  564  1.0000000000000001e-159  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4273  hypothetical protein  40.55 
 
 
827 aa  550  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11470  molybdopterin oxidoreductase  43.16 
 
 
766 aa  551  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000112103  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4344  molybdopterin oxidoreductase  43.39 
 
 
760 aa  549  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0116562  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0658  twin-arginine translocation pathway signal  40.03 
 
 
817 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1877  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  39.53 
 
 
820 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0361  molybdopterin oxidoreductase  37.53 
 
 
841 aa  533  1e-150  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0738  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  37.01 
 
 
822 aa  528  1e-148  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1514  trimethylamine-n-oxide reductase 2 (tmaoreductase 2) (trimethylamine oxidase 2)  36.95 
 
 
828 aa  526  1e-148  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0894241  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0848  molybdopterin oxidoreductase domain-containing protein  37 
 
 
816 aa  513  1e-144  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4105  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  39.61 
 
 
850 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4033  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  39.74 
 
 
850 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2127  trimethylamine-N-oxide reductase  40.05 
 
 
848 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.600325  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4050  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  39.61 
 
 
850 aa  507  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4212  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  39.74 
 
 
850 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0291  biotin sulfoxide reductase  35.76 
 
 
838 aa  507  9.999999999999999e-143  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4154  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  39.74 
 
 
850 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.208646  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1114  trimethylamine-N-oxide reductase  40.05 
 
 
848 aa  504  1e-141  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01000  trimethylamine N-oxide (TMAO) reductase I, catalytic subunit  39.79 
 
 
848 aa  499  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1233  trimethylamine-N-oxide reductase  39.71 
 
 
848 aa  499  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3360  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  36.67 
 
 
830 aa  499  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01007  hypothetical protein  39.79 
 
 
848 aa  499  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01843  trimethylamine N-oxide reductase system III, catalytic subunit  36.81 
 
 
809 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1760  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  36.81 
 
 
809 aa  496  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2598  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  39.79 
 
 
848 aa  498  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.514456 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2645  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  39.79 
 
 
848 aa  498  1e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1967  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  36.81 
 
 
815 aa  496  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0661  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  37.61 
 
 
792 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1459  trimethylamine N-oxide reductase, catalytic subunit  34.66 
 
 
839 aa  496  1e-139  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.278851  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2608  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  36.81 
 
 
809 aa  497  1e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.022137 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0987  trimethylamine-N-oxide reductase  37.63 
 
 
829 aa  497  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1108  trimethylamine-N-oxide reductase  39.66 
 
 
848 aa  498  1e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1314  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  36.81 
 
 
809 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.887927 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0165  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  39.82 
 
 
777 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1768  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  36.68 
 
 
809 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.876265  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4926  biotin sulfoxide reductase  39.47 
 
 
777 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2165  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  36.54 
 
 
815 aa  493  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3343  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  36.98 
 
 
830 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.922902  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4218  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  38.24 
 
 
837 aa  495  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.216901  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2103  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  36.68 
 
 
815 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3752  biotin sulfoxide reductase  39.82 
 
 
777 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3976  biotin sulfoxide reductase  39.08 
 
 
777 aa  494  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0430  biotin sulfoxide reductase  37.5 
 
 
799 aa  491  1e-137  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.559575  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1994  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  36.93 
 
 
830 aa  491  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0339743  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0772  trimethylamine-N-oxide reductase precursor  37.09 
 
 
820 aa  489  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3871  biotin sulfoxide reductase  39.21 
 
 
777 aa  491  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03401  biotin sulfoxide reductase  40.36 
 
 
759 aa  489  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0161  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  39.42 
 
 
777 aa  487  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1833  trimethylamine-N-oxide reductase  36.72 
 
 
830 aa  486  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4045  biotin sulfoxide reductase  39.29 
 
 
777 aa  487  1e-136  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3839  biotin sulfoxide reductase  38.94 
 
 
777 aa  488  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3858  biotin sulfoxide reductase  38.94 
 
 
777 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0392  trimethylamine-n-oxide reductase 2 (tmaoreductase 2) (trimethylamine oxidase 2)  36.22 
 
 
856 aa  487  1e-136  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2731  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  37.83 
 
 
838 aa  487  1e-136  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000871  biotin sulfoxide reductase  36.22 
 
 
815 aa  486  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2798  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  36.59 
 
 
828 aa  488  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0178103 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3967  biotin sulfoxide reductase  38.94 
 
 
777 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03352  hypothetical protein  40.36 
 
 
759 aa  489  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0214  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  36.99 
 
 
840 aa  489  1e-136  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>