More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5717 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_1026  molybdopterin oxidoreductase  46.51 
 
 
753 aa  670    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7853  molybdopterin oxidoreductase  45.06 
 
 
784 aa  652    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.710352  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1789  dimethylsulfoxide reductase  49.61 
 
 
756 aa  724    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.858784  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3605  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  49.67 
 
 
756 aa  762    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0340  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  49.22 
 
 
776 aa  706    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.422952  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5717  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 
768 aa  1593    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1492  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  47.97 
 
 
773 aa  704    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3139  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  49.41 
 
 
789 aa  711    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.167271  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3831  molybdopterin oxidoreductase  47.64 
 
 
752 aa  681    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21940  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  52.62 
 
 
756 aa  746    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2166  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  50.93 
 
 
762 aa  739    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2539  molybdopterin oxidoreductase  52.1 
 
 
777 aa  794    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3611  molybdopterin oxidoreductase  48.11 
 
 
759 aa  705    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.507632  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3742  molybdopterin oxidoreductase  49.8 
 
 
774 aa  740    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.922901  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1942  molybdopterin oxidoreductase  49.93 
 
 
758 aa  756    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.838902 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3229  molybdopterin oxidoreductase  47.57 
 
 
753 aa  662    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3891  molybdopterin oxidoreductase  46.13 
 
 
770 aa  680    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4801  molybdopterin oxidoreductase  47.85 
 
 
796 aa  702    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2212  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  50.93 
 
 
762 aa  739    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.752976  normal  0.0546044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2438  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  50.27 
 
 
775 aa  722    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156692  normal  0.122475 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0974  molybdopterin oxidoreductase  46.51 
 
 
753 aa  666    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3214  molybdopterin oxidoreductase  45.94 
 
 
783 aa  639    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3613  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  47.54 
 
 
760 aa  638    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.908584  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3247  molybdopterin oxidoreductase  46.24 
 
 
751 aa  661    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000784055 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3648  molybdopterin oxidoreductase  50.2 
 
 
763 aa  738    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.114285 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2155  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  50.93 
 
 
762 aa  741    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1389  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  52.6 
 
 
772 aa  733    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0600897  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3958  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  50.91 
 
 
798 aa  760    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0664262  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2769  molybdopterin oxidoreductase  50.2 
 
 
836 aa  684    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3160  molybdopterin oxidoreductase  46.69 
 
 
752 aa  665    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6311  molybdopterin oxidoreductase  49.09 
 
 
786 aa  736    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813095  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11470  molybdopterin oxidoreductase  51.56 
 
 
766 aa  741    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000112103  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0922  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  45.82 
 
 
752 aa  630  1e-179  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433061  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3382  molybdopterin oxidoreductase  45.15 
 
 
752 aa  627  1e-178  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.471363  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3048  DMSO/TMAO-reductase  42.15 
 
 
822 aa  615  1e-175  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180176  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2645  molybdopterin oxidoreductase  45.33 
 
 
771 aa  615  1e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3775  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  42.15 
 
 
822 aa  615  1e-175  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0227198  normal  0.692951 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4593  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  44.85 
 
 
771 aa  613  9.999999999999999e-175  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0871534  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1751  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  41.89 
 
 
824 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4344  molybdopterin oxidoreductase  44.81 
 
 
760 aa  609  1e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0116562  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3233  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  39.82 
 
 
826 aa  591  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000820415 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1287  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  40.49 
 
 
823 aa  587  1e-166  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0738  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  38.73 
 
 
822 aa  588  1e-166  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0806  trimethylamine-N-oxide reductase 2, biotin sulfoxide reductase  40.59 
 
 
801 aa  585  1.0000000000000001e-165  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4273  hypothetical protein  40.44 
 
 
827 aa  579  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1145  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  41.34 
 
 
825 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259974  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0658  twin-arginine translocation pathway signal  40.88 
 
 
817 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1877  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  40.59 
 
 
820 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0361  molybdopterin oxidoreductase  38.96 
 
 
841 aa  562  1e-158  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01843  trimethylamine N-oxide reductase system III, catalytic subunit  40.13 
 
 
809 aa  552  1e-156  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2608  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  40 
 
 
809 aa  552  1e-156  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.022137 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5194  molybdopterin oxidoreductase  47.41 
 
 
845 aa  555  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.050154  normal  0.834363 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1967  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  40.13 
 
 
815 aa  553  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1760  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  40.13 
 
 
809 aa  552  1e-156  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1314  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  40.13 
 
 
809 aa  553  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.887927 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1768  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  40 
 
 
809 aa  550  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.876265  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000871  biotin sulfoxide reductase  40.75 
 
 
815 aa  551  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1459  trimethylamine N-oxide reductase, catalytic subunit  38.7 
 
 
839 aa  549  1e-155  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.278851  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2165  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  39.74 
 
 
815 aa  549  1e-155  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0291  biotin sulfoxide reductase  39.12 
 
 
838 aa  547  1e-154  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2103  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  39.74 
 
 
815 aa  546  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0848  molybdopterin oxidoreductase domain-containing protein  38.54 
 
 
816 aa  545  1e-153  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1538  biotin sulfoxide reductase  40.27 
 
 
815 aa  545  1e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0161  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  39.97 
 
 
777 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0165  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  39.84 
 
 
777 aa  538  1e-151  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3839  biotin sulfoxide reductase  39.64 
 
 
777 aa  535  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3871  biotin sulfoxide reductase  39.84 
 
 
777 aa  537  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4926  biotin sulfoxide reductase  39.72 
 
 
777 aa  536  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3752  biotin sulfoxide reductase  39.84 
 
 
777 aa  538  1e-151  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3976  biotin sulfoxide reductase  39.84 
 
 
777 aa  537  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3858  biotin sulfoxide reductase  39.82 
 
 
777 aa  535  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3967  biotin sulfoxide reductase  39.69 
 
 
777 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3923  biotin sulfoxide reductase  39.56 
 
 
777 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.937494  normal  0.611984 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06846  hypothetical protein  38.8 
 
 
815 aa  533  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4045  biotin sulfoxide reductase  40.49 
 
 
777 aa  535  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4027  biotin sulfoxide reductase  39.56 
 
 
777 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633224  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03352  hypothetical protein  40.35 
 
 
759 aa  530  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03401  biotin sulfoxide reductase  40.35 
 
 
759 aa  530  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0391  biotin sulfoxide reductase (BDS reductase) (bsoreductase)  37.41 
 
 
837 aa  532  1e-149  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0186908  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1514  trimethylamine-n-oxide reductase 2 (tmaoreductase 2) (trimethylamine oxidase 2)  37.4 
 
 
828 aa  530  1e-149  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0894241  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0173  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  39.53 
 
 
775 aa  526  1e-148  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0394  biotin sulfoxide reductase (BDS reductase) (bsoreductase)  37.95 
 
 
839 aa  524  1e-147  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0392  trimethylamine-n-oxide reductase 2 (tmaoreductase 2) (trimethylamine oxidase 2)  37.16 
 
 
856 aa  523  1e-147  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0661  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  39.42 
 
 
792 aa  514  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1396  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  36.53 
 
 
835 aa  514  1e-144  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4218  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  38.88 
 
 
837 aa  512  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.216901  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2798  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  37.01 
 
 
828 aa  510  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0178103 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3360  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  36.36 
 
 
830 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0430  biotin sulfoxide reductase  37.26 
 
 
799 aa  500  1e-140  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.559575  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1051  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  35.77 
 
 
829 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3526  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  35.94 
 
 
830 aa  499  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170885  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1116  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  35.77 
 
 
829 aa  499  1e-140  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.310041  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1055  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  35.89 
 
 
829 aa  501  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4212  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  38.68 
 
 
850 aa  500  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2127  trimethylamine-N-oxide reductase  38.34 
 
 
848 aa  496  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.600325  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4033  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  38.68 
 
 
850 aa  499  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4154  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  38.68 
 
 
850 aa  498  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.208646  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1114  trimethylamine-N-oxide reductase  38.47 
 
 
848 aa  498  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4050  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  38.68 
 
 
850 aa  498  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1994  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  35.4 
 
 
830 aa  496  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0339743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>