More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1026 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1789  dimethylsulfoxide reductase  46.97 
 
 		 756 aa  662    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.858784  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3605  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  47.77 
 
 		 756 aa  703    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0340  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  47.21 
 
 		 776 aa  660    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.422952  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3160  molybdopterin oxidoreductase  74.13 
 
 		 752 aa  1138    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5717  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  46.51 
 
 		 768 aa  672    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1026  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 753 aa  1558    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1492  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  49.06 
 
 		 773 aa  703    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3139  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  46.64 
 
 		 789 aa  648    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.167271  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3247  molybdopterin oxidoreductase  99.2 
 
 		 751 aa  1516    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000784055 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2539  molybdopterin oxidoreductase  47.11 
 
 		 777 aa  691    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3611  molybdopterin oxidoreductase  49.2 
 
 		 759 aa  706    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.507632  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3742  molybdopterin oxidoreductase  45.55 
 
 		 774 aa  666    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.922901  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3382  molybdopterin oxidoreductase  74.53 
 
 		 752 aa  1130    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.471363  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21940  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  48.99 
 
 		 756 aa  679    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3891  molybdopterin oxidoreductase  48.59 
 
 		 770 aa  711    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3229  molybdopterin oxidoreductase  74.97 
 
 		 753 aa  1137    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4593  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  48.33 
 
 		 771 aa  660    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0871534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3613  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  47.33 
 
 		 760 aa  650    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.908584  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0922  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  75.2 
 
 		 752 aa  1142    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433061  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3648  molybdopterin oxidoreductase  48.93 
 
 		 763 aa  712    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114285 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1942  molybdopterin oxidoreductase  46.09 
 
 		 758 aa  657    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.838902 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3831  molybdopterin oxidoreductase  86.02 
 
 		 752 aa  1321    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0974  molybdopterin oxidoreductase  99.73 
 
 		 753 aa  1553    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1389  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  46.66 
 
 		 772 aa  632  1e-180  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0600897  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3958  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  46.04 
 
 		 798 aa  632  1e-180  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0664262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6311  molybdopterin oxidoreductase  43.09 
 
 		 786 aa  626  1e-178  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3048  DMSO/TMAO-reductase  42.93 
 
 		 822 aa  623  1e-177  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180176  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3775  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  42.93 
 
 		 822 aa  625  1e-177  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0227198  normal  0.692951 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2438  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  45.77 
 
 		 775 aa  615  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156692  normal  0.122475 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2645  molybdopterin oxidoreductase  45.21 
 
 		 771 aa  613  9.999999999999999e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2166  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  45.13 
 
 		 762 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2212  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  45.13 
 
 		 762 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.752976  normal  0.0546044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2155  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  44.99 
 
 		 762 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353685 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1145  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  42.52 
 
 		 825 aa  608  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1287  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  41.92 
 
 		 823 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2769  molybdopterin oxidoreductase  46.98 
 
 		 836 aa  605  1.0000000000000001e-171  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7853  molybdopterin oxidoreductase  43.07 
 
 		 784 aa  599  1e-170  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.710352  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3214  molybdopterin oxidoreductase  44.12 
 
 		 783 aa  601  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1751  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  41.72 
 
 		 824 aa  597  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4273  hypothetical protein  41.99 
 
 		 827 aa  594  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0806  trimethylamine-N-oxide reductase 2, biotin sulfoxide reductase  40.26 
 
 		 801 aa  589  1e-167  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4801  molybdopterin oxidoreductase  42.57 
 
 		 796 aa  590  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3233  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  39.69 
 
 		 826 aa  587  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000820415 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11470  molybdopterin oxidoreductase  42.31 
 
 		 766 aa  573  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000112103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1877  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  39.74 
 
 		 820 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4344  molybdopterin oxidoreductase  41.67 
 
 		 760 aa  567  1e-160  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0116562  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0361  molybdopterin oxidoreductase  38.33 
 
 		 841 aa  565  1.0000000000000001e-159  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0658  twin-arginine translocation pathway signal  39.61 
 
 		 817 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0738  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  37.89 
 
 		 822 aa  552  1e-156  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01843  trimethylamine N-oxide reductase system III, catalytic subunit  39.21 
 
 		 809 aa  551  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1768  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  39.21 
 
 		 809 aa  550  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.876265  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1967  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  39.21 
 
 		 815 aa  551  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1760  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  39.21 
 
 		 809 aa  551  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2103  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  39.08 
 
 		 815 aa  549  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2608  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  38.95 
 
 		 809 aa  549  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.022137 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1514  trimethylamine-n-oxide reductase 2 (tmaoreductase 2) (trimethylamine oxidase 2)  37.21 
 
 		 828 aa  551  1e-155  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0894241  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1314  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  39.47 
 
 		 809 aa  550  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.887927 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2165  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  39.08 
 
 		 815 aa  551  1e-155  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0661  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  40.9 
 
 		 792 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4154  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  39.9 
 
 		 850 aa  535  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.208646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3967  biotin sulfoxide reductase  41.29 
 
 		 777 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000871  biotin sulfoxide reductase  38.39 
 
 		 815 aa  533  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4050  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  39.9 
 
 		 850 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3752  biotin sulfoxide reductase  39.97 
 
 		 777 aa  533  1e-150  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3839  biotin sulfoxide reductase  41.42 
 
 		 777 aa  535  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4033  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  39.9 
 
 		 850 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4212  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  39.9 
 
 		 850 aa  535  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4105  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  39.77 
 
 		 850 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0165  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  39.97 
 
 		 777 aa  533  1e-150  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3858  biotin sulfoxide reductase  41.16 
 
 		 777 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3976  biotin sulfoxide reductase  39.71 
 
 		 777 aa  531  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4027  biotin sulfoxide reductase  41.16 
 
 		 777 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3923  biotin sulfoxide reductase  41.16 
 
 		 777 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.937494  normal  0.611984 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0161  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  39.45 
 
 		 777 aa  525  1e-148  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4926  biotin sulfoxide reductase  39.45 
 
 		 777 aa  526  1e-148  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1114  trimethylamine-N-oxide reductase  39.63 
 
 		 848 aa  525  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3871  biotin sulfoxide reductase  39.45 
 
 		 777 aa  528  1e-148  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4045  biotin sulfoxide reductase  39.32 
 
 		 777 aa  525  1e-148  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2127  trimethylamine-N-oxide reductase  39.63 
 
 		 848 aa  525  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.600325  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03401  biotin sulfoxide reductase  40.88 
 
 		 759 aa  525  1e-147  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4218  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  39.27 
 
 		 837 aa  524  1e-147  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.216901  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03352  hypothetical protein  40.88 
 
 		 759 aa  525  1e-147  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1538  biotin sulfoxide reductase  38.13 
 
 		 815 aa  525  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1233  trimethylamine-N-oxide reductase  39.53 
 
 		 848 aa  519  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0987  trimethylamine-N-oxide reductase  37.44 
 
 		 829 aa  519  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2798  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  37.09 
 
 		 828 aa  520  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0178103 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01000  trimethylamine N-oxide (TMAO) reductase I, catalytic subunit  39.37 
 
 		 848 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2598  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  39.37 
 
 		 848 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.514456 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2645  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  39.37 
 
 		 848 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01007  hypothetical protein  39.37 
 
 		 848 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3360  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  37.05 
 
 		 830 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06846  hypothetical protein  37.55 
 
 		 815 aa  517  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1108  trimethylamine-N-oxide reductase  39.24 
 
 		 848 aa  519  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0173  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  38.56 
 
 		 775 aa  519  1.0000000000000001e-145  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2731  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  38.17 
 
 		 838 aa  513  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3343  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  37.31 
 
 		 830 aa  513  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.922902  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0214  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  37.76 
 
 		 840 aa  514  1e-144  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3352  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  37.31 
 
 		 829 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1154  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  37.18 
 
 		 829 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1994  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  36.79 
 
 		 830 aa  512  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0339743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>