More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0922 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3831  molybdopterin oxidoreductase  76.8 
 
 
752 aa  1174    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1942  molybdopterin oxidoreductase  45.36 
 
 
758 aa  655    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.838902 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0922  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  100 
 
 
752 aa  1554    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433061  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1789  dimethylsulfoxide reductase  46.5 
 
 
756 aa  645    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.858784  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3605  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  46.57 
 
 
756 aa  684    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5717  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  45.82 
 
 
768 aa  645    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1492  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  47.12 
 
 
773 aa  660    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3382  molybdopterin oxidoreductase  96.01 
 
 
752 aa  1462    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.471363  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3160  molybdopterin oxidoreductase  82.8 
 
 
752 aa  1285    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2539  molybdopterin oxidoreductase  46.76 
 
 
777 aa  663    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3611  molybdopterin oxidoreductase  48.2 
 
 
759 aa  678    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.507632  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3742  molybdopterin oxidoreductase  45.2 
 
 
774 aa  651    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.922901  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3229  molybdopterin oxidoreductase  82.29 
 
 
753 aa  1279    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3247  molybdopterin oxidoreductase  74.8 
 
 
751 aa  1149    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000784055 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3891  molybdopterin oxidoreductase  45.61 
 
 
770 aa  640    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21940  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  48.25 
 
 
756 aa  640    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4593  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  46.99 
 
 
771 aa  651    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0871534  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3613  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  47.34 
 
 
760 aa  638    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.908584  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1026  molybdopterin oxidoreductase  75.2 
 
 
753 aa  1162    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3648  molybdopterin oxidoreductase  47.4 
 
 
763 aa  675    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.114285 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0974  molybdopterin oxidoreductase  75.2 
 
 
753 aa  1159    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0340  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  46.22 
 
 
776 aa  629  1e-179  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.422952  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3139  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  45.58 
 
 
789 aa  629  1e-179  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.167271  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6311  molybdopterin oxidoreductase  44.24 
 
 
786 aa  631  1e-179  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813095  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1389  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  46.6 
 
 
772 aa  630  1e-179  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0600897  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2645  molybdopterin oxidoreductase  47.02 
 
 
771 aa  618  1e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3214  molybdopterin oxidoreductase  44.25 
 
 
783 aa  607  9.999999999999999e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3048  DMSO/TMAO-reductase  41.88 
 
 
822 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180176  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7853  molybdopterin oxidoreductase  43.35 
 
 
784 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.710352  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3775  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  41.88 
 
 
822 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0227198  normal  0.692951 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2769  molybdopterin oxidoreductase  46.38 
 
 
836 aa  596  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3958  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  44.34 
 
 
798 aa  593  1e-168  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0664262  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2438  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  44.61 
 
 
775 aa  587  1e-166  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156692  normal  0.122475 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1751  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  41.66 
 
 
824 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1145  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  41.39 
 
 
825 aa  582  1e-164  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259974  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4801  molybdopterin oxidoreductase  41.72 
 
 
796 aa  579  1e-164  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2166  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  43.13 
 
 
762 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0806  trimethylamine-N-oxide reductase 2, biotin sulfoxide reductase  40.58 
 
 
801 aa  578  1.0000000000000001e-163  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2212  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  43.13 
 
 
762 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.752976  normal  0.0546044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2155  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  42.99 
 
 
762 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353685 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4344  molybdopterin oxidoreductase  43.48 
 
 
760 aa  573  1.0000000000000001e-162  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0116562  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3233  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  39.57 
 
 
826 aa  568  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000820415 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1287  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  40.32 
 
 
823 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1877  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  41.45 
 
 
820 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4273  hypothetical protein  39.61 
 
 
827 aa  560  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11470  molybdopterin oxidoreductase  41.88 
 
 
766 aa  549  1e-155  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000112103  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1514  trimethylamine-n-oxide reductase 2 (tmaoreductase 2) (trimethylamine oxidase 2)  37.55 
 
 
828 aa  536  1e-151  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0894241  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0658  twin-arginine translocation pathway signal  39.42 
 
 
817 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0738  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  37.37 
 
 
822 aa  531  1e-149  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0361  molybdopterin oxidoreductase  36.89 
 
 
841 aa  526  1e-148  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01843  trimethylamine N-oxide reductase system III, catalytic subunit  38.11 
 
 
809 aa  521  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1768  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  38.11 
 
 
809 aa  520  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.876265  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2165  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  37.84 
 
 
815 aa  520  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1314  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  38.11 
 
 
809 aa  520  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.887927 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1967  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  38.11 
 
 
815 aa  521  1e-146  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2608  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  38.11 
 
 
809 aa  521  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.022137 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1760  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  38.11 
 
 
809 aa  521  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2103  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  37.84 
 
 
815 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4218  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  40.26 
 
 
837 aa  515  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.216901  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0214  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  37.78 
 
 
840 aa  510  1e-143  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3976  biotin sulfoxide reductase  38.57 
 
 
777 aa  503  1e-141  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0848  molybdopterin oxidoreductase domain-containing protein  35.84 
 
 
816 aa  503  1e-141  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0291  biotin sulfoxide reductase  36.47 
 
 
838 aa  503  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4926  biotin sulfoxide reductase  38.57 
 
 
777 aa  503  1e-141  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0161  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  38.39 
 
 
777 aa  499  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0165  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  38.31 
 
 
777 aa  499  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3752  biotin sulfoxide reductase  38.31 
 
 
777 aa  499  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0661  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  37.15 
 
 
792 aa  500  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3967  biotin sulfoxide reductase  38.76 
 
 
777 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2127  trimethylamine-N-oxide reductase  38.95 
 
 
848 aa  499  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.600325  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1114  trimethylamine-N-oxide reductase  39.3 
 
 
848 aa  499  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3858  biotin sulfoxide reductase  38.89 
 
 
777 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03401  biotin sulfoxide reductase  39.23 
 
 
759 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1459  trimethylamine N-oxide reductase, catalytic subunit  35.29 
 
 
839 aa  496  1e-139  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.278851  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4212  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  38.69 
 
 
850 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4045  biotin sulfoxide reductase  37.91 
 
 
777 aa  496  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03352  hypothetical protein  39.23 
 
 
759 aa  496  1e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000871  biotin sulfoxide reductase  36.53 
 
 
815 aa  498  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0987  trimethylamine-N-oxide reductase  37.81 
 
 
829 aa  496  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3839  biotin sulfoxide reductase  38.62 
 
 
777 aa  498  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3923  biotin sulfoxide reductase  38.62 
 
 
777 aa  498  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.937494  normal  0.611984 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4027  biotin sulfoxide reductase  38.62 
 
 
777 aa  498  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633224  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3871  biotin sulfoxide reductase  38.18 
 
 
777 aa  498  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4105  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  38.56 
 
 
850 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2645  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  39.03 
 
 
848 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5194  molybdopterin oxidoreductase  45.02 
 
 
845 aa  494  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.050154  normal  0.834363 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1108  trimethylamine-N-oxide reductase  38.9 
 
 
848 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4154  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  38.69 
 
 
850 aa  495  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.208646  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0394  biotin sulfoxide reductase (BDS reductase) (bsoreductase)  36.57 
 
 
839 aa  494  9.999999999999999e-139  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4050  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  38.69 
 
 
850 aa  495  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4033  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  38.69 
 
 
850 aa  495  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1233  trimethylamine-N-oxide reductase  39.11 
 
 
848 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2598  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  39.03 
 
 
848 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0173  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  37.94 
 
 
775 aa  493  9.999999999999999e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0772  trimethylamine-N-oxide reductase precursor  37.66 
 
 
820 aa  495  9.999999999999999e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01000  trimethylamine N-oxide (TMAO) reductase I, catalytic subunit  39.03 
 
 
848 aa  492  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0392  trimethylamine-n-oxide reductase 2 (tmaoreductase 2) (trimethylamine oxidase 2)  36.3 
 
 
856 aa  490  1e-137  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1673  trimethylamine-N-oxide reductase precursor  36.34 
 
 
822 aa  489  1e-137  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3360  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  36.38 
 
 
830 aa  492  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06846  hypothetical protein  36.4 
 
 
815 aa  492  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>