More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HS_1673 on replicon NC_008309
Organism: Haemophilus somnus 129PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01000  trimethylamine N-oxide (TMAO) reductase I, catalytic subunit  51.97 
 
 		 848 aa  894    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2598  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  51.97 
 
 		 848 aa  896    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2127  trimethylamine-N-oxide reductase  52.09 
 
 		 848 aa  897    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.600325  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2645  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  51.97 
 
 		 848 aa  896    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4105  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  51.98 
 
 		 850 aa  899    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1833  trimethylamine-N-oxide reductase  61.61 
 
 		 830 aa  1108    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1232  trimethylamine-N-oxide reductase  60.31 
 
 		 829 aa  1072    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4218  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  49.15 
 
 		 837 aa  844    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.216901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0738  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  45.12 
 
 		 822 aa  729    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3048  DMSO/TMAO-reductase  46.17 
 
 		 822 aa  746    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180176  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1287  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  44.58 
 
 		 823 aa  727    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4033  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  52.1 
 
 		 850 aa  900    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1751  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  45.93 
 
 		 824 aa  730    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1108  trimethylamine-N-oxide reductase  51.73 
 
 		 848 aa  893    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1145  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  44.65 
 
 		 825 aa  732    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4154  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  52.1 
 
 		 850 aa  901    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.208646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1233  trimethylamine-N-oxide reductase  51.61 
 
 		 848 aa  889    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1673  trimethylamine-N-oxide reductase precursor  100 
 
 		 822 aa  1728    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1051  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  59.59 
 
 		 829 aa  1080    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3360  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  60.14 
 
 		 830 aa  1090    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1116  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  59.59 
 
 		 829 aa  1080    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.310041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3526  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  60.96 
 
 		 830 aa  1094    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1994  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  59.5 
 
 		 830 aa  1092    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0339743  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1114  trimethylamine-N-oxide reductase  52.15 
 
 		 848 aa  896    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1055  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  59.59 
 
 		 829 aa  1080    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0772  trimethylamine-N-oxide reductase precursor  64.39 
 
 		 820 aa  1172    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0987  trimethylamine-N-oxide reductase  59.73 
 
 		 829 aa  1089    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1154  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  59.54 
 
 		 829 aa  1085    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4212  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  52.1 
 
 		 850 aa  901    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003825  trimethylamine-N-oxide reductase  64.07 
 
 		 820 aa  1154    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3775  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  45.92 
 
 		 822 aa  745    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0227198  normal  0.692951 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2798  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  59.73 
 
 		 828 aa  1082    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0178103 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4273  hypothetical protein  42.27 
 
 		 827 aa  688    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3343  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  61.08 
 
 		 830 aa  1090    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.922902  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1296  trimethylamine-N-oxide reductase  64.8 
 
 		 820 aa  1177    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0214  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  66.5 
 
 		 840 aa  1226    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2731  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  70.33 
 
 		 838 aa  1257    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3213  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  59.54 
 
 		 829 aa  1084    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3352  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  59.54 
 
 		 829 aa  1087    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01007  hypothetical protein  51.97 
 
 		 848 aa  894    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4050  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  52.1 
 
 		 850 aa  900    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3233  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  41.59 
 
 		 826 aa  648    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000820415 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01857  hypothetical protein  63.82 
 
 		 820 aa  1144    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0361  molybdopterin oxidoreductase  40.78 
 
 		 841 aa  635  1e-180  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1877  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  40.17 
 
 		 820 aa  634  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1514  trimethylamine-n-oxide reductase 2 (tmaoreductase 2) (trimethylamine oxidase 2)  41.51 
 
 		 828 aa  632  1e-179  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0894241  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0806  trimethylamine-N-oxide reductase 2, biotin sulfoxide reductase  40.74 
 
 		 801 aa  621  1e-176  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1396  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  41.22 
 
 		 835 aa  615  9.999999999999999e-175  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0391  biotin sulfoxide reductase (BDS reductase) (bsoreductase)  40.05 
 
 		 837 aa  605  9.999999999999999e-173  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0186908  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0394  biotin sulfoxide reductase (BDS reductase) (bsoreductase)  39.08 
 
 		 839 aa  607  9.999999999999999e-173  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0392  trimethylamine-n-oxide reductase 2 (tmaoreductase 2) (trimethylamine oxidase 2)  38.74 
 
 		 856 aa  604  1.0000000000000001e-171  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05452  trimethylamine-N-oxide reductase 1  38.72 
 
 		 808 aa  597  1e-169  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1459  trimethylamine N-oxide reductase, catalytic subunit  38.65 
 
 		 839 aa  593  1e-168  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.278851  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0658  twin-arginine translocation pathway signal  41.1 
 
 		 817 aa  594  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0291  biotin sulfoxide reductase  38.24 
 
 		 838 aa  588  1e-166  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1395  radical SAM domain-containing protein  38.02 
 
 		 855 aa  581  1e-164  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1967  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  37.89 
 
 		 815 aa  572  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3839  biotin sulfoxide reductase  39.34 
 
 		 777 aa  571  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01843  trimethylamine N-oxide reductase system III, catalytic subunit  37.89 
 
 		 809 aa  572  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2165  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  37.89 
 
 		 815 aa  572  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3923  biotin sulfoxide reductase  39.22 
 
 		 777 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.937494  normal  0.611984 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3967  biotin sulfoxide reductase  39.34 
 
 		 777 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1760  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  37.89 
 
 		 809 aa  572  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2608  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  37.89 
 
 		 809 aa  572  1e-161  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.022137 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2103  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  37.77 
 
 		 815 aa  569  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3858  biotin sulfoxide reductase  39.34 
 
 		 777 aa  571  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1768  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  37.89 
 
 		 809 aa  568  1e-160  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.876265  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1314  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  37.65 
 
 		 809 aa  568  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.887927 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4027  biotin sulfoxide reductase  39.22 
 
 		 777 aa  568  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000871  biotin sulfoxide reductase  37.79 
 
 		 815 aa  565  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0848  molybdopterin oxidoreductase domain-containing protein  39.67 
 
 		 816 aa  567  1e-160  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0161  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  38.28 
 
 		 777 aa  560  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3871  biotin sulfoxide reductase  38.28 
 
 		 777 aa  561  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0165  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  38.15 
 
 		 777 aa  561  1e-158  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3752  biotin sulfoxide reductase  38.15 
 
 		 777 aa  561  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3976  biotin sulfoxide reductase  38.15 
 
 		 777 aa  556  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4926  biotin sulfoxide reductase  38.02 
 
 		 777 aa  557  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4045  biotin sulfoxide reductase  38.02 
 
 		 777 aa  558  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1538  biotin sulfoxide reductase  37.3 
 
 		 815 aa  557  1e-157  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0173  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  38.32 
 
 		 775 aa  554  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03401  biotin sulfoxide reductase  38.94 
 
 		 759 aa  549  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03352  hypothetical protein  38.94 
 
 		 759 aa  549  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06846  hypothetical protein  36.45 
 
 		 815 aa  543  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2044  trimethylamine-n-oxide reductase 1 (tmaoreductase 1) (trimethylamine oxidase 1)  36.55 
 
 		 816 aa  540  9.999999999999999e-153  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0661  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  38.85 
 
 		 792 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1119  hypothetical protein  37.18 
 
 		 813 aa  523  1e-147  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0685924  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0430  biotin sulfoxide reductase  36.93 
 
 		 799 aa  513  1e-144  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.559575  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0406  radical SAM domain-containing protein  35.55 
 
 		 817 aa  509  1e-143  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3605  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  35.74 
 
 		 756 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2539  molybdopterin oxidoreductase  36.65 
 
 		 777 aa  503  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3139  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  37.13 
 
 		 789 aa  502  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.167271  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21940  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  37.31 
 
 		 756 aa  496  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0429  trimethylamine-N-oxide reductase 2  37.55 
 
 		 793 aa  492  1e-137  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.160806  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1942  molybdopterin oxidoreductase  37.1 
 
 		 758 aa  486  1e-136  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.838902 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2166  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  35.05 
 
 		 762 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1389  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  35.83 
 
 		 772 aa  486  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0600897  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2212  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  35.05 
 
 		 762 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.752976  normal  0.0546044 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3831  molybdopterin oxidoreductase  36.64 
 
 		 752 aa  483  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2155  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  34.75 
 
 		 762 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353685 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4801  molybdopterin oxidoreductase  35.02 
 
 		 796 aa  479  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>