More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003825 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011094  SeSA_A4033  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  51.25 
 
 		 850 aa  875    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01000  trimethylamine N-oxide (TMAO) reductase I, catalytic subunit  51.31 
 
 		 848 aa  873    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4105  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  51.13 
 
 		 850 aa  876    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2645  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  51.31 
 
 		 848 aa  874    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4154  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  51.25 
 
 		 850 aa  877    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.208646  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1833  trimethylamine-N-oxide reductase  65.78 
 
 		 830 aa  1179    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2127  trimethylamine-N-oxide reductase  51.07 
 
 		 848 aa  868    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.600325  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1232  trimethylamine-N-oxide reductase  65.82 
 
 		 829 aa  1159    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2598  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  51.31 
 
 		 848 aa  874    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0738  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  45 
 
 		 822 aa  719    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1154  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  66.06 
 
 		 829 aa  1177    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3048  DMSO/TMAO-reductase  45.68 
 
 		 822 aa  736    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180176  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1287  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  46.35 
 
 		 823 aa  744    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1108  trimethylamine-N-oxide reductase  51.07 
 
 		 848 aa  872    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4218  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  50.61 
 
 		 837 aa  866    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.216901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1751  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  46 
 
 		 824 aa  744    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1877  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  41.92 
 
 		 820 aa  665    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1145  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  44.42 
 
 		 825 aa  710    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01857  hypothetical protein  95.98 
 
 		 820 aa  1630    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2731  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  64.54 
 
 		 838 aa  1125    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1673  trimethylamine-N-oxide reductase precursor  64.07 
 
 		 822 aa  1164    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1051  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  66.02 
 
 		 829 aa  1179    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3360  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  64.78 
 
 		 830 aa  1171    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1116  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  66.02 
 
 		 829 aa  1179    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.310041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1994  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  64.78 
 
 		 830 aa  1165    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0339743  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3352  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  66.06 
 
 		 829 aa  1178    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3343  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  65.78 
 
 		 830 aa  1174    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.922902  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1055  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  65.9 
 
 		 829 aa  1177    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4212  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  51.25 
 
 		 850 aa  878    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0987  trimethylamine-N-oxide reductase  65.42 
 
 		 829 aa  1166    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0361  molybdopterin oxidoreductase  41.98 
 
 		 841 aa  656    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1233  trimethylamine-N-oxide reductase  51.19 
 
 		 848 aa  868    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0772  trimethylamine-N-oxide reductase precursor  84.62 
 
 		 820 aa  1507    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3775  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  45.49 
 
 		 822 aa  736    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0227198  normal  0.692951 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1114  trimethylamine-N-oxide reductase  51.07 
 
 		 848 aa  867    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003825  trimethylamine-N-oxide reductase  100 
 
 		 820 aa  1722    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2798  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  65.3 
 
 		 828 aa  1174    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0178103 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4273  hypothetical protein  41.35 
 
 		 827 aa  667    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4050  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  51.13 
 
 		 850 aa  876    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1296  trimethylamine-N-oxide reductase  88.03 
 
 		 820 aa  1550    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0214  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  64.61 
 
 		 840 aa  1158    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3213  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  66.06 
 
 		 829 aa  1176    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01007  hypothetical protein  51.31 
 
 		 848 aa  873    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3526  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  64.54 
 
 		 830 aa  1156    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0806  trimethylamine-N-oxide reductase 2, biotin sulfoxide reductase  41.55 
 
 		 801 aa  632  1e-179  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1514  trimethylamine-n-oxide reductase 2 (tmaoreductase 2) (trimethylamine oxidase 2)  41.22 
 
 		 828 aa  630  1e-179  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0894241  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3233  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  41.4 
 
 		 826 aa  626  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000820415 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0658  twin-arginine translocation pathway signal  41.41 
 
 		 817 aa  616  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05452  trimethylamine-N-oxide reductase 1  38.91 
 
 		 808 aa  614  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1396  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  38.67 
 
 		 835 aa  592  1e-167  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0291  biotin sulfoxide reductase  38.99 
 
 		 838 aa  590  1e-167  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0394  biotin sulfoxide reductase (BDS reductase) (bsoreductase)  40.1 
 
 		 839 aa  591  1e-167  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0391  biotin sulfoxide reductase (BDS reductase) (bsoreductase)  39.46 
 
 		 837 aa  587  1e-166  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0186908  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0392  trimethylamine-n-oxide reductase 2 (tmaoreductase 2) (trimethylamine oxidase 2)  38.91 
 
 		 856 aa  585  1.0000000000000001e-165  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1459  trimethylamine N-oxide reductase, catalytic subunit  38.43 
 
 		 839 aa  580  1e-164  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.278851  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0848  molybdopterin oxidoreductase domain-containing protein  39.1 
 
 		 816 aa  577  1.0000000000000001e-163  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01843  trimethylamine N-oxide reductase system III, catalytic subunit  37.45 
 
 		 809 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1768  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  37.33 
 
 		 809 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.876265  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1760  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  37.45 
 
 		 809 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1967  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  37.45 
 
 		 815 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2165  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  37.45 
 
 		 815 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1314  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  37.45 
 
 		 809 aa  572  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.887927 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2103  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  37.33 
 
 		 815 aa  569  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2608  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  37.45 
 
 		 809 aa  572  1e-161  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.022137 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000871  biotin sulfoxide reductase  37.58 
 
 		 815 aa  570  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1395  radical SAM domain-containing protein  37.67 
 
 		 855 aa  565  1.0000000000000001e-159  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3839  biotin sulfoxide reductase  39.59 
 
 		 777 aa  564  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1538  biotin sulfoxide reductase  36.92 
 
 		 815 aa  562  1.0000000000000001e-159  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06846  hypothetical protein  36.97 
 
 		 815 aa  559  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3967  biotin sulfoxide reductase  39.34 
 
 		 777 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3858  biotin sulfoxide reductase  39.47 
 
 		 777 aa  561  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3923  biotin sulfoxide reductase  39.21 
 
 		 777 aa  558  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.937494  normal  0.611984 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4027  biotin sulfoxide reductase  39.21 
 
 		 777 aa  557  1e-157  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0661  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  40.05 
 
 		 792 aa  553  1e-156  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0173  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  38.68 
 
 		 775 aa  554  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0165  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  38.04 
 
 		 777 aa  550  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3871  biotin sulfoxide reductase  37.91 
 
 		 777 aa  550  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4926  biotin sulfoxide reductase  37.91 
 
 		 777 aa  550  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3752  biotin sulfoxide reductase  38.04 
 
 		 777 aa  550  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03401  biotin sulfoxide reductase  39.26 
 
 		 759 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0161  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  38.04 
 
 		 777 aa  548  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03352  hypothetical protein  39.26 
 
 		 759 aa  546  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4045  biotin sulfoxide reductase  37.91 
 
 		 777 aa  547  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3976  biotin sulfoxide reductase  37.91 
 
 		 777 aa  545  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2044  trimethylamine-n-oxide reductase 1 (tmaoreductase 1) (trimethylamine oxidase 1)  37.76 
 
 		 816 aa  545  1e-153  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1119  hypothetical protein  38.44 
 
 		 813 aa  538  1e-151  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0685924  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0430  biotin sulfoxide reductase  38.24 
 
 		 799 aa  527  1e-148  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.559575  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3605  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  36.1 
 
 		 756 aa  528  1e-148  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0406  radical SAM domain-containing protein  36.2 
 
 		 817 aa  524  1e-147  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3742  molybdopterin oxidoreductase  36.29 
 
 		 774 aa  509  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.922901  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1389  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  38.55 
 
 		 772 aa  509  1e-143  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0600897  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21940  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  36.71 
 
 		 756 aa  501  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3139  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  36.09 
 
 		 789 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.167271  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1942  molybdopterin oxidoreductase  37.79 
 
 		 758 aa  498  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.838902 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3891  molybdopterin oxidoreductase  36.02 
 
 		 770 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2539  molybdopterin oxidoreductase  36.51 
 
 		 777 aa  493  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11470  molybdopterin oxidoreductase  36.39 
 
 		 766 aa  490  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000112103  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1789  dimethylsulfoxide reductase  36.15 
 
 		 756 aa  487  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.858784  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2769  molybdopterin oxidoreductase  38.42 
 
 		 836 aa  488  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3958  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  35.08 
 
 		 798 aa  488  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0664262  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>