More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_1119 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0406  radical SAM domain-containing protein  53.5 
 
 
817 aa  900    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2044  trimethylamine-n-oxide reductase 1 (tmaoreductase 1) (trimethylamine oxidase 1)  76.72 
 
 
816 aa  1321    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3048  DMSO/TMAO-reductase  41.78 
 
 
822 aa  639    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180176  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1119  hypothetical protein  100 
 
 
813 aa  1687    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0685924  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1287  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  44.15 
 
 
823 aa  662    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0361  molybdopterin oxidoreductase  43.77 
 
 
841 aa  671    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1145  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  41.72 
 
 
825 aa  660    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259974  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0738  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  47.68 
 
 
822 aa  771    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3775  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  41.78 
 
 
822 aa  639    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0227198  normal  0.692951 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3233  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  42.02 
 
 
826 aa  640    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000820415 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1751  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  43.55 
 
 
824 aa  633  1e-180  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0848  molybdopterin oxidoreductase domain-containing protein  42.23 
 
 
816 aa  631  1e-179  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0291  biotin sulfoxide reductase  42.74 
 
 
838 aa  624  1e-177  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1459  trimethylamine N-oxide reductase, catalytic subunit  41.19 
 
 
839 aa  609  1e-173  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.278851  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4273  hypothetical protein  39.48 
 
 
827 aa  610  1e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0806  trimethylamine-N-oxide reductase 2, biotin sulfoxide reductase  43.62 
 
 
801 aa  607  9.999999999999999e-173  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0392  trimethylamine-n-oxide reductase 2 (tmaoreductase 2) (trimethylamine oxidase 2)  40.37 
 
 
856 aa  600  1e-170  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1877  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  39.9 
 
 
820 aa  595  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1514  trimethylamine-n-oxide reductase 2 (tmaoreductase 2) (trimethylamine oxidase 2)  42.95 
 
 
828 aa  591  1e-167  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0894241  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0391  biotin sulfoxide reductase (BDS reductase) (bsoreductase)  40.07 
 
 
837 aa  590  1e-167  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0186908  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0394  biotin sulfoxide reductase (BDS reductase) (bsoreductase)  40.52 
 
 
839 aa  585  1e-166  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1395  radical SAM domain-containing protein  40.44 
 
 
855 aa  581  1e-164  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1396  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.07 
 
 
835 aa  573  1.0000000000000001e-162  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0658  twin-arginine translocation pathway signal  41.72 
 
 
817 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2127  trimethylamine-N-oxide reductase  40.6 
 
 
848 aa  567  1e-160  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.600325  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1314  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  37.97 
 
 
809 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.887927 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01843  trimethylamine N-oxide reductase system III, catalytic subunit  38.09 
 
 
809 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1768  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  38.24 
 
 
809 aa  565  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.876265  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2645  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  40.48 
 
 
848 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1760  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  38.09 
 
 
809 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2598  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  40.48 
 
 
848 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1967  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  38.09 
 
 
815 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2608  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  37.79 
 
 
809 aa  562  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.022137 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1114  trimethylamine-N-oxide reductase  40.48 
 
 
848 aa  564  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4212  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  39.42 
 
 
850 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01000  trimethylamine N-oxide (TMAO) reductase I, catalytic subunit  40.48 
 
 
848 aa  562  1e-158  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4154  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  39.42 
 
 
850 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.208646  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4105  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  39.29 
 
 
850 aa  559  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2165  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  37.83 
 
 
815 aa  559  1e-158  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4033  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  39.54 
 
 
850 aa  561  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2103  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  37.97 
 
 
815 aa  559  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01007  hypothetical protein  40.48 
 
 
848 aa  562  1e-158  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1108  trimethylamine-N-oxide reductase  40.35 
 
 
848 aa  561  1e-158  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1233  trimethylamine-N-oxide reductase  40.23 
 
 
848 aa  561  1e-158  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4050  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  39.54 
 
 
850 aa  560  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06846  hypothetical protein  37.09 
 
 
815 aa  558  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000871  biotin sulfoxide reductase  37.33 
 
 
815 aa  558  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0430  biotin sulfoxide reductase  39.25 
 
 
799 aa  558  1e-157  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.559575  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4218  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  38.8 
 
 
837 aa  550  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.216901  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1538  biotin sulfoxide reductase  37 
 
 
815 aa  549  1e-155  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0772  trimethylamine-N-oxide reductase precursor  38.06 
 
 
820 aa  542  1e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3858  biotin sulfoxide reductase  38.77 
 
 
777 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3967  biotin sulfoxide reductase  38.64 
 
 
777 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4027  biotin sulfoxide reductase  38.5 
 
 
777 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633224  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0987  trimethylamine-N-oxide reductase  37.09 
 
 
829 aa  536  1e-151  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003825  trimethylamine-N-oxide reductase  37.98 
 
 
820 aa  537  1e-151  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3923  biotin sulfoxide reductase  38.5 
 
 
777 aa  536  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.937494  normal  0.611984 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1994  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  37.01 
 
 
830 aa  534  1e-150  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0339743  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01857  hypothetical protein  37.29 
 
 
820 aa  533  1e-150  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3839  biotin sulfoxide reductase  38.5 
 
 
777 aa  535  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1673  trimethylamine-N-oxide reductase precursor  37.08 
 
 
822 aa  529  1e-149  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0429  trimethylamine-N-oxide reductase 2  38.82 
 
 
793 aa  530  1e-149  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.160806  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0173  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  37.24 
 
 
775 aa  529  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1296  trimethylamine-N-oxide reductase  36.62 
 
 
820 aa  529  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3360  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  36.18 
 
 
830 aa  528  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0214  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  36.61 
 
 
840 aa  528  1e-148  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1833  trimethylamine-N-oxide reductase  36.42 
 
 
830 aa  523  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1051  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  36.8 
 
 
829 aa  522  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1116  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  36.8 
 
 
829 aa  522  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.310041  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3752  biotin sulfoxide reductase  36.86 
 
 
777 aa  523  1e-147  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1055  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  36.8 
 
 
829 aa  523  1e-147  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4045  biotin sulfoxide reductase  36.73 
 
 
777 aa  523  1e-147  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0165  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  36.86 
 
 
777 aa  523  1e-147  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03401  biotin sulfoxide reductase  37.57 
 
 
759 aa  519  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0161  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  36.73 
 
 
777 aa  519  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1232  trimethylamine-N-oxide reductase  36.37 
 
 
829 aa  519  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4926  biotin sulfoxide reductase  36.86 
 
 
777 aa  521  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3871  biotin sulfoxide reductase  36.73 
 
 
777 aa  521  1e-146  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2798  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  36.42 
 
 
828 aa  522  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0178103 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03352  hypothetical protein  37.57 
 
 
759 aa  519  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3526  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  36.02 
 
 
830 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170885  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3976  biotin sulfoxide reductase  36.73 
 
 
777 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3605  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  35.08 
 
 
756 aa  515  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1154  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  36.49 
 
 
829 aa  515  1e-144  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2731  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  37.1 
 
 
838 aa  513  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3213  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  36.29 
 
 
829 aa  514  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3352  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  36.17 
 
 
829 aa  515  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3343  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  35.66 
 
 
830 aa  510  1e-143  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.922902  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1789  dimethylsulfoxide reductase  36.11 
 
 
756 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.858784  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0661  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  38.18 
 
 
792 aa  495  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2539  molybdopterin oxidoreductase  35.73 
 
 
777 aa  484  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3891  molybdopterin oxidoreductase  35 
 
 
770 aa  485  1e-135  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6311  molybdopterin oxidoreductase  36.63 
 
 
786 aa  481  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813095  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1942  molybdopterin oxidoreductase  34.93 
 
 
758 aa  476  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.838902 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2155  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  35.7 
 
 
762 aa  476  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353685 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2166  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  35.57 
 
 
762 aa  475  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4801  molybdopterin oxidoreductase  35.77 
 
 
796 aa  473  1e-132  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2212  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  35.57 
 
 
762 aa  475  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.752976  normal  0.0546044 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5717  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  35.37 
 
 
768 aa  469  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2278  dimethyl sulfoxide reductase precursor  35.36 
 
 
890 aa  468  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.630178  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>