More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A1287 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A4105  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  48.85 
 
 		 850 aa  793    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01000  trimethylamine N-oxide (TMAO) reductase I, catalytic subunit  49.15 
 
 		 848 aa  793    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2127  trimethylamine-N-oxide reductase  49.03 
 
 		 848 aa  793    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.600325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3976  biotin sulfoxide reductase  45.71 
 
 		 777 aa  721    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01843  trimethylamine N-oxide reductase system III, catalytic subunit  49.51 
 
 		 809 aa  800    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03401  biotin sulfoxide reductase  47.46 
 
 		 759 aa  713    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0161  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  45.96 
 
 		 777 aa  724    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1768  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  49.26 
 
 		 809 aa  795    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.876265  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3526  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  47.1 
 
 		 830 aa  762    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170885  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2645  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  49.15 
 
 		 848 aa  795    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3923  biotin sulfoxide reductase  48.01 
 
 		 777 aa  738    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.937494  normal  0.611984 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1967  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  49.51 
 
 		 815 aa  799    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1833  trimethylamine-N-oxide reductase  46.8 
 
 		 830 aa  764    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1232  trimethylamine-N-oxide reductase  45.89 
 
 		 829 aa  754    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3967  biotin sulfoxide reductase  48.14 
 
 		 777 aa  741    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01857  hypothetical protein  46.11 
 
 		 820 aa  727    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3605  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  43.85 
 
 		 756 aa  660    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3352  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  45.65 
 
 		 829 aa  754    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1395  radical SAM domain-containing protein  47.9 
 
 		 855 aa  801    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3048  DMSO/TMAO-reductase  69.54 
 
 		 822 aa  1224    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180176  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1760  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  49.51 
 
 		 809 aa  800    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1287  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  100 
 
 		 823 aa  1702    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4050  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  48.97 
 
 		 850 aa  794    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3752  biotin sulfoxide reductase  45.96 
 
 		 777 aa  723    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0361  molybdopterin oxidoreductase  48.46 
 
 		 841 aa  778    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2044  trimethylamine-n-oxide reductase 1 (tmaoreductase 1) (trimethylamine oxidase 1)  43.87 
 
 		 816 aa  679    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0848  molybdopterin oxidoreductase domain-containing protein  46.2 
 
 		 816 aa  707    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1108  trimethylamine-N-oxide reductase  48.91 
 
 		 848 aa  792    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0658  twin-arginine translocation pathway signal  53.77 
 
 		 817 aa  885    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0661  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  46.31 
 
 		 792 aa  694    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1751  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  73.52 
 
 		 824 aa  1254    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1877  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  53.19 
 
 		 820 aa  880    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3871  biotin sulfoxide reductase  45.71 
 
 		 777 aa  722    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06846  hypothetical protein  47.79 
 
 		 815 aa  781    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1145  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  67.65 
 
 		 825 aa  1190    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4154  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  49.21 
 
 		 850 aa  794    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.208646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000871  biotin sulfoxide reductase  48.59 
 
 		 815 aa  797    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4027  biotin sulfoxide reductase  48.01 
 
 		 777 aa  739    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0738  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  50.86 
 
 		 822 aa  859    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0806  trimethylamine-N-oxide reductase 2, biotin sulfoxide reductase  53.97 
 
 		 801 aa  879    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1673  trimethylamine-N-oxide reductase precursor  44.58 
 
 		 822 aa  734    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1051  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  45.77 
 
 		 829 aa  754    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0394  biotin sulfoxide reductase (BDS reductase) (bsoreductase)  46.28 
 
 		 839 aa  767    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003825  trimethylamine-N-oxide reductase  46.35 
 
 		 820 aa  748    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1396  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  46.44 
 
 		 835 aa  756    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4218  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  49.09 
 
 		 837 aa  800    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.216901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1116  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  45.77 
 
 		 829 aa  754    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.310041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1994  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  46.14 
 
 		 830 aa  771    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0339743  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3233  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  54.89 
 
 		 826 aa  920    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000820415 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3343  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  46.14 
 
 		 830 aa  755    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.922902  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2103  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  49.51 
 
 		 815 aa  798    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3891  molybdopterin oxidoreductase  44.43 
 
 		 770 aa  636    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1114  trimethylamine-N-oxide reductase  49.15 
 
 		 848 aa  792    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2598  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  49.15 
 
 		 848 aa  795    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1055  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  45.65 
 
 		 829 aa  753    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2608  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  49.39 
 
 		 809 aa  799    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.022137 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4212  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  49.21 
 
 		 850 aa  796    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4926  biotin sulfoxide reductase  46.23 
 
 		 777 aa  721    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0987  trimethylamine-N-oxide reductase  46.85 
 
 		 829 aa  762    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03352  hypothetical protein  47.46 
 
 		 759 aa  713    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2731  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  46.26 
 
 		 838 aa  729    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0392  trimethylamine-n-oxide reductase 2 (tmaoreductase 2) (trimethylamine oxidase 2)  48.95 
 
 		 856 aa  822    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0772  trimethylamine-N-oxide reductase precursor  47.2 
 
 		 820 aa  761    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3839  biotin sulfoxide reductase  48.14 
 
 		 777 aa  741    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0291  biotin sulfoxide reductase  48.27 
 
 		 838 aa  819    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3360  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  47.17 
 
 		 830 aa  778    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3775  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  69.54 
 
 		 822 aa  1225    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0227198  normal  0.692951 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1119  hypothetical protein  44.31 
 
 		 813 aa  671    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0685924  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01007  hypothetical protein  49.15 
 
 		 848 aa  793    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4033  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  49.03 
 
 		 850 aa  790    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2798  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  46.5 
 
 		 828 aa  765    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0178103 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4045  biotin sulfoxide reductase  45.96 
 
 		 777 aa  726    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4273  hypothetical protein  63.46 
 
 		 827 aa  1121    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0173  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  47.75 
 
 		 775 aa  741    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3858  biotin sulfoxide reductase  48.4 
 
 		 777 aa  744    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1459  trimethylamine N-oxide reductase, catalytic subunit  48.51 
 
 		 839 aa  821    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.278851  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1296  trimethylamine-N-oxide reductase  45.5 
 
 		 820 aa  748    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1538  biotin sulfoxide reductase  48.28 
 
 		 815 aa  787    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1314  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  49.26 
 
 		 809 aa  796    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.887927 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0214  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  45.16 
 
 		 840 aa  743    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1154  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  46.01 
 
 		 829 aa  754    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1233  trimethylamine-N-oxide reductase  48.67 
 
 		 848 aa  788    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3213  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  45.77 
 
 		 829 aa  753    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1942  molybdopterin oxidoreductase  45.8 
 
 		 758 aa  646    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.838902 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0165  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  45.96 
 
 		 777 aa  723    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2165  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  49.39 
 
 		 815 aa  797    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1514  trimethylamine-n-oxide reductase 2 (tmaoreductase 2) (trimethylamine oxidase 2)  51.7 
 
 		 828 aa  874    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0894241  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0391  biotin sulfoxide reductase (BDS reductase) (bsoreductase)  46.06 
 
 		 837 aa  754    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0186908  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0430  biotin sulfoxide reductase  41.99 
 
 		 799 aa  634  1e-180  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.559575  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1789  dimethylsulfoxide reductase  44.4 
 
 		 756 aa  631  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.858784  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1389  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  44.17 
 
 		 772 aa  617  1e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0600897  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2539  molybdopterin oxidoreductase  43.1 
 
 		 777 aa  617  1e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3958  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  43.2 
 
 		 798 aa  614  9.999999999999999e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0664262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21940  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  43.81 
 
 		 756 aa  606  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05452  trimethylamine-N-oxide reductase 1  39.59 
 
 		 808 aa  600  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2438  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  43.69 
 
 		 775 aa  597  1e-169  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156692  normal  0.122475 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0340  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  41.51 
 
 		 776 aa  594  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.422952  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3611  molybdopterin oxidoreductase  42.6 
 
 		 759 aa  592  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.507632  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3648  molybdopterin oxidoreductase  43.52 
 
 		 763 aa  593  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114285 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0406  radical SAM domain-containing protein  38.16 
 
 		 817 aa  593  1e-168  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>