More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4154 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C3967  biotin sulfoxide reductase  43.95 
 
 
777 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01000  trimethylamine N-oxide (TMAO) reductase I, catalytic subunit  89.94 
 
 
848 aa  1586    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4154  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  100 
 
 
850 aa  1776    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.208646  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2165  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  43.62 
 
 
815 aa  664    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01843  trimethylamine N-oxide reductase system III, catalytic subunit  43.82 
 
 
809 aa  665    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1768  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  43.58 
 
 
809 aa  661    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.876265  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2127  trimethylamine-N-oxide reductase  89.94 
 
 
848 aa  1589    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.600325  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3839  biotin sulfoxide reductase  43.99 
 
 
777 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2645  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  90.06 
 
 
848 aa  1591    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4033  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  99.18 
 
 
850 aa  1767    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2103  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  43.74 
 
 
815 aa  667    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1833  trimethylamine-N-oxide reductase  51.37 
 
 
830 aa  889    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1232  trimethylamine-N-oxide reductase  51.56 
 
 
829 aa  896    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0361  molybdopterin oxidoreductase  43.52 
 
 
841 aa  680    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4050  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  99.65 
 
 
850 aa  1770    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1154  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  51.2 
 
 
829 aa  887    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000871  biotin sulfoxide reductase  42.28 
 
 
815 aa  655    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1395  radical SAM domain-containing protein  40.83 
 
 
855 aa  641    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3048  DMSO/TMAO-reductase  48.43 
 
 
822 aa  794    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180176  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1287  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  49.21 
 
 
823 aa  804    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2731  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  56.06 
 
 
838 aa  926    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3526  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  51.58 
 
 
830 aa  855    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170885  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0658  twin-arginine translocation pathway signal  43.74 
 
 
817 aa  636    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1751  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  49.94 
 
 
824 aa  803    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1877  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  44.78 
 
 
820 aa  683    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1396  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  41.13 
 
 
835 aa  652    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01857  hypothetical protein  50.95 
 
 
820 aa  862    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1145  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  47.72 
 
 
825 aa  787    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259974  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1108  trimethylamine-N-oxide reductase  89.82 
 
 
848 aa  1587    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1114  trimethylamine-N-oxide reductase  89.94 
 
 
848 aa  1590    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4105  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  99.65 
 
 
850 aa  1771    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0806  trimethylamine-N-oxide reductase 2, biotin sulfoxide reductase  45.09 
 
 
801 aa  698    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1673  trimethylamine-N-oxide reductase precursor  52.16 
 
 
822 aa  912    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1051  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  51.56 
 
 
829 aa  899    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3360  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  51.91 
 
 
830 aa  894    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3352  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  51.08 
 
 
829 aa  887    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1116  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  51.56 
 
 
829 aa  899    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.310041  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1994  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  51.14 
 
 
830 aa  891    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0339743  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3233  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  45.57 
 
 
826 aa  729    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000820415 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1314  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  43.82 
 
 
809 aa  664    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.887927 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1055  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  51.44 
 
 
829 aa  897    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0738  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  44.81 
 
 
822 aa  750    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1233  trimethylamine-N-oxide reductase  89.82 
 
 
848 aa  1584    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0987  trimethylamine-N-oxide reductase  51.91 
 
 
829 aa  897    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06846  hypothetical protein  41.68 
 
 
815 aa  644    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01007  hypothetical protein  89.94 
 
 
848 aa  1586    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0772  trimethylamine-N-oxide reductase precursor  50.96 
 
 
820 aa  885    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2598  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  90.06 
 
 
848 aa  1591    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2608  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  43.63 
 
 
809 aa  660    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.022137 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0291  biotin sulfoxide reductase  41.65 
 
 
838 aa  650    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4218  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  57.07 
 
 
837 aa  991    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.216901  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1459  trimethylamine N-oxide reductase, catalytic subunit  40.52 
 
 
839 aa  649    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.278851  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3775  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  48.37 
 
 
822 aa  793    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0227198  normal  0.692951 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1760  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  43.82 
 
 
809 aa  665    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2798  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  51.44 
 
 
828 aa  887    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0178103 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003825  trimethylamine-N-oxide reductase  51.31 
 
 
820 aa  885    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4273  hypothetical protein  45.55 
 
 
827 aa  739    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3343  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  51.85 
 
 
830 aa  891    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.922902  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1296  trimethylamine-N-oxide reductase  51.97 
 
 
820 aa  907    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1538  biotin sulfoxide reductase  42.05 
 
 
815 aa  656    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1967  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  43.62 
 
 
815 aa  666    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0214  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  52.23 
 
 
840 aa  904    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4212  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  99.76 
 
 
850 aa  1772    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3213  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  51.2 
 
 
829 aa  885    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3858  biotin sulfoxide reductase  44.14 
 
 
777 aa  636    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1514  trimethylamine-n-oxide reductase 2 (tmaoreductase 2) (trimethylamine oxidase 2)  42.65 
 
 
828 aa  680    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0894241  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0391  biotin sulfoxide reductase (BDS reductase) (bsoreductase)  42.64 
 
 
837 aa  662    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0186908  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0392  trimethylamine-n-oxide reductase 2 (tmaoreductase 2) (trimethylamine oxidase 2)  42.46 
 
 
856 aa  684    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0394  biotin sulfoxide reductase (BDS reductase) (bsoreductase)  40.4 
 
 
839 aa  640    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05452  trimethylamine-N-oxide reductase 1  39.52 
 
 
808 aa  634  1e-180  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4027  biotin sulfoxide reductase  43.83 
 
 
777 aa  634  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633224  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3923  biotin sulfoxide reductase  43.83 
 
 
777 aa  634  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.937494  normal  0.611984 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3871  biotin sulfoxide reductase  43.16 
 
 
777 aa  627  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3976  biotin sulfoxide reductase  42.93 
 
 
777 aa  625  1e-178  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4045  biotin sulfoxide reductase  42.68 
 
 
777 aa  623  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3752  biotin sulfoxide reductase  43.29 
 
 
777 aa  625  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0165  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  43.29 
 
 
777 aa  625  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4926  biotin sulfoxide reductase  43.16 
 
 
777 aa  625  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0161  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  43.16 
 
 
777 aa  622  1e-176  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03401  biotin sulfoxide reductase  44.58 
 
 
759 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03352  hypothetical protein  44.58 
 
 
759 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0848  molybdopterin oxidoreductase domain-containing protein  41.55 
 
 
816 aa  614  9.999999999999999e-175  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0173  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  42.84 
 
 
775 aa  606  9.999999999999999e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2044  trimethylamine-n-oxide reductase 1 (tmaoreductase 1) (trimethylamine oxidase 1)  38.88 
 
 
816 aa  601  1e-170  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0661  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  40.58 
 
 
792 aa  582  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1119  hypothetical protein  39.42 
 
 
813 aa  571  1e-161  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0685924  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0406  radical SAM domain-containing protein  36.53 
 
 
817 aa  567  1e-160  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3891  molybdopterin oxidoreductase  40.94 
 
 
770 aa  551  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3605  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  40.15 
 
 
756 aa  546  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1026  molybdopterin oxidoreductase  39.9 
 
 
753 aa  534  1e-150  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0974  molybdopterin oxidoreductase  39.9 
 
 
753 aa  530  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3831  molybdopterin oxidoreductase  40.71 
 
 
752 aa  527  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3247  molybdopterin oxidoreductase  39.77 
 
 
751 aa  524  1e-147  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000784055 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0430  biotin sulfoxide reductase  37.07 
 
 
799 aa  525  1e-147  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.559575  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3139  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  40.15 
 
 
789 aa  519  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.167271  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4801  molybdopterin oxidoreductase  40.38 
 
 
796 aa  521  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21940  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  40.18 
 
 
756 aa  510  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3229  molybdopterin oxidoreductase  39.08 
 
 
753 aa  503  1e-141  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3160  molybdopterin oxidoreductase  38.79 
 
 
752 aa  502  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1389  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  39.46 
 
 
772 aa  498  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0600897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>