More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1492 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1026  molybdopterin oxidoreductase  49.06 
 
 		 753 aa  708    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1389  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  52.41 
 
 		 772 aa  729    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0600897  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1789  dimethylsulfoxide reductase  53.95 
 
 		 756 aa  791    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.858784  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3605  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  54.21 
 
 		 756 aa  835    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0340  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  51.05 
 
 		 776 aa  728    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.422952  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5717  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  48.1 
 
 		 768 aa  710    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1492  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  100 
 
 		 773 aa  1590    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3139  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  48.76 
 
 		 789 aa  704    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.167271  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2166  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  47.77 
 
 		 762 aa  679    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2539  molybdopterin oxidoreductase  49.67 
 
 		 777 aa  765    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3611  molybdopterin oxidoreductase  52.62 
 
 		 759 aa  799    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.507632  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3742  molybdopterin oxidoreductase  46.67 
 
 		 774 aa  710    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.922901  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0922  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  47.12 
 
 		 752 aa  647    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433061  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3160  molybdopterin oxidoreductase  47.65 
 
 		 752 aa  672    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7853  molybdopterin oxidoreductase  46.58 
 
 		 784 aa  669    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.710352  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3891  molybdopterin oxidoreductase  48.43 
 
 		 770 aa  708    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3382  molybdopterin oxidoreductase  46.32 
 
 		 752 aa  638    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.471363  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4801  molybdopterin oxidoreductase  45.96 
 
 		 796 aa  665    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3229  molybdopterin oxidoreductase  47.38 
 
 		 753 aa  655    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2212  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  47.77 
 
 		 762 aa  679    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.752976  normal  0.0546044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2438  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  49.4 
 
 		 775 aa  688    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156692  normal  0.122475 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3214  molybdopterin oxidoreductase  48.03 
 
 		 783 aa  668    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3613  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  49.53 
 
 		 760 aa  656    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.908584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3648  molybdopterin oxidoreductase  55.53 
 
 		 763 aa  825    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114285 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2155  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  47.9 
 
 		 762 aa  683    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353685 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3247  molybdopterin oxidoreductase  48.92 
 
 		 751 aa  704    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000784055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2769  molybdopterin oxidoreductase  52.89 
 
 		 836 aa  702    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3958  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  47.83 
 
 		 798 aa  679    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0664262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3831  molybdopterin oxidoreductase  49.8 
 
 		 752 aa  709    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6311  molybdopterin oxidoreductase  50.79 
 
 		 786 aa  798    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11470  molybdopterin oxidoreductase  47.25 
 
 		 766 aa  673    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000112103  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21940  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  57.11 
 
 		 756 aa  818    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0974  molybdopterin oxidoreductase  49.06 
 
 		 753 aa  707    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1942  molybdopterin oxidoreductase  50.6 
 
 		 758 aa  736    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.838902 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1145  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  43.04 
 
 		 825 aa  611  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259974  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4593  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  46.7 
 
 		 771 aa  610  1e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0871534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4344  molybdopterin oxidoreductase  43.93 
 
 		 760 aa  609  1e-173  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0116562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2645  molybdopterin oxidoreductase  45.45 
 
 		 771 aa  601  1e-170  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1287  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  42.05 
 
 		 823 aa  598  1e-169  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3233  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  41.04 
 
 		 826 aa  595  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000820415 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3775  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  41.52 
 
 		 822 aa  589  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0227198  normal  0.692951 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3048  DMSO/TMAO-reductase  41.39 
 
 		 822 aa  586  1e-166  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180176  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1751  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  40.76 
 
 		 824 aa  582  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0806  trimethylamine-N-oxide reductase 2, biotin sulfoxide reductase  40.66 
 
 		 801 aa  577  1.0000000000000001e-163  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0361  molybdopterin oxidoreductase  38.61 
 
 		 841 aa  567  1e-160  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0738  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  37.71 
 
 		 822 aa  567  1e-160  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1877  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  40.38 
 
 		 820 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4273  hypothetical protein  40.15 
 
 		 827 aa  559  1e-158  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0161  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  40.98 
 
 		 777 aa  554  1e-156  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3871  biotin sulfoxide reductase  40.85 
 
 		 777 aa  554  1e-156  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3858  biotin sulfoxide reductase  41.13 
 
 		 777 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3967  biotin sulfoxide reductase  41.26 
 
 		 777 aa  552  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4045  biotin sulfoxide reductase  39.87 
 
 		 777 aa  550  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3839  biotin sulfoxide reductase  41.13 
 
 		 777 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1514  trimethylamine-n-oxide reductase 2 (tmaoreductase 2) (trimethylamine oxidase 2)  37.37 
 
 		 828 aa  550  1e-155  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0894241  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4027  biotin sulfoxide reductase  41.13 
 
 		 777 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3923  biotin sulfoxide reductase  41.13 
 
 		 777 aa  551  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.937494  normal  0.611984 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4926  biotin sulfoxide reductase  40.72 
 
 		 777 aa  550  1e-155  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3752  biotin sulfoxide reductase  40.46 
 
 		 777 aa  547  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0658  twin-arginine translocation pathway signal  39.28 
 
 		 817 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1459  trimethylamine N-oxide reductase, catalytic subunit  38.38 
 
 		 839 aa  548  1e-154  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.278851  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3976  biotin sulfoxide reductase  40.93 
 
 		 777 aa  546  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0165  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  40.46 
 
 		 777 aa  547  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1760  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  38.41 
 
 		 809 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01843  trimethylamine N-oxide reductase system III, catalytic subunit  38.41 
 
 		 809 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1314  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  38.67 
 
 		 809 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.887927 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0291  biotin sulfoxide reductase  37.48 
 
 		 838 aa  539  9.999999999999999e-153  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0173  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  40.26 
 
 		 775 aa  541  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1967  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  38.41 
 
 		 815 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03401  biotin sulfoxide reductase  40.98 
 
 		 759 aa  537  1e-151  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1768  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  38.52 
 
 		 809 aa  539  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.876265  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2608  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  38.11 
 
 		 809 aa  536  1e-151  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.022137 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03352  hypothetical protein  40.98 
 
 		 759 aa  537  1e-151  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2165  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  38.16 
 
 		 815 aa  537  1e-151  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2103  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  38.16 
 
 		 815 aa  535  1e-150  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5194  molybdopterin oxidoreductase  47.85 
 
 		 845 aa  530  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.050154  normal  0.834363 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0848  molybdopterin oxidoreductase domain-containing protein  38.13 
 
 		 816 aa  527  1e-148  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1395  radical SAM domain-containing protein  37.8 
 
 		 855 aa  526  1e-148  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0391  biotin sulfoxide reductase (BDS reductase) (bsoreductase)  37.75 
 
 		 837 aa  524  1e-147  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0186908  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0392  trimethylamine-n-oxide reductase 2 (tmaoreductase 2) (trimethylamine oxidase 2)  36.67 
 
 		 856 aa  521  1e-146  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0661  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  40.94 
 
 		 792 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0394  biotin sulfoxide reductase (BDS reductase) (bsoreductase)  37.95 
 
 		 839 aa  517  1.0000000000000001e-145  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000871  biotin sulfoxide reductase  37.18 
 
 		 815 aa  515  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06846  hypothetical protein  36.68 
 
 		 815 aa  515  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1538  biotin sulfoxide reductase  38.24 
 
 		 815 aa  509  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1396  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.13 
 
 		 835 aa  504  1e-141  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4218  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  36.96 
 
 		 837 aa  498  1e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.216901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1114  trimethylamine-N-oxide reductase  39.51 
 
 		 848 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2127  trimethylamine-N-oxide reductase  39.39 
 
 		 848 aa  491  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.600325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0430  biotin sulfoxide reductase  37.07 
 
 		 799 aa  490  1e-137  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.559575  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4154  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  38.75 
 
 		 850 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.208646  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2645  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  39.13 
 
 		 848 aa  486  1e-136  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1233  trimethylamine-N-oxide reductase  39.26 
 
 		 848 aa  486  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2598  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  39.13 
 
 		 848 aa  486  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.514456 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4212  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  38.75 
 
 		 850 aa  486  1e-136  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01000  trimethylamine N-oxide (TMAO) reductase I, catalytic subunit  39.13 
 
 		 848 aa  485  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4050  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  38.75 
 
 		 850 aa  485  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1108  trimethylamine-N-oxide reductase  39 
 
 		 848 aa  484  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01007  hypothetical protein  39.13 
 
 		 848 aa  485  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4105  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  38.75 
 
 		 850 aa  485  1e-135  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>