More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4593 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1026  molybdopterin oxidoreductase  48.33 
 
 		 753 aa  687    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1389  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  50.87 
 
 		 772 aa  655    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0600897  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3831  molybdopterin oxidoreductase  49.33 
 
 		 752 aa  693    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3160  molybdopterin oxidoreductase  48.4 
 
 		 752 aa  666    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3605  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  47.77 
 
 		 756 aa  676    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.412954 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5717  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  44.85 
 
 		 768 aa  641    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3247  molybdopterin oxidoreductase  48.2 
 
 		 751 aa  680    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000784055 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3139  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  49.8 
 
 		 789 aa  676    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.167271  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0922  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  47.94 
 
 		 752 aa  657    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.433061  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2539  molybdopterin oxidoreductase  49.14 
 
 		 777 aa  659    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2645  molybdopterin oxidoreductase  57.77 
 
 		 771 aa  847    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3611  molybdopterin oxidoreductase  48.07 
 
 		 759 aa  682    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.507632  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3742  molybdopterin oxidoreductase  48.47 
 
 		 774 aa  659    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.922901  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4593  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  100 
 
 		 771 aa  1561    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0871534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3613  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  64.89 
 
 		 760 aa  935    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.908584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3648  molybdopterin oxidoreductase  48.51 
 
 		 763 aa  662    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.114285 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3229  molybdopterin oxidoreductase  47.54 
 
 		 753 aa  642    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3382  molybdopterin oxidoreductase  47.8 
 
 		 752 aa  657    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.471363  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1942  molybdopterin oxidoreductase  47.26 
 
 		 758 aa  654    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.838902 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0974  molybdopterin oxidoreductase  48.33 
 
 		 753 aa  686    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21940  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  49.8 
 
 		 756 aa  636    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2769  molybdopterin oxidoreductase  50.47 
 
 		 836 aa  633  1e-180  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1789  dimethylsulfoxide reductase  47.36 
 
 		 756 aa  627  1e-178  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.858784  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1492  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  46.7 
 
 		 773 aa  626  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3891  molybdopterin oxidoreductase  45.87 
 
 		 770 aa  626  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4801  molybdopterin oxidoreductase  47.32 
 
 		 796 aa  628  1e-178  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0340  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  46.74 
 
 		 776 aa  615  9.999999999999999e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.422952  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7853  molybdopterin oxidoreductase  44.75 
 
 		 784 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.710352  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3048  DMSO/TMAO-reductase  44.59 
 
 		 822 aa  599  1e-170  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.180176  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3214  molybdopterin oxidoreductase  45.6 
 
 		 783 aa  601  1e-170  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6311  molybdopterin oxidoreductase  44.58 
 
 		 786 aa  596  1e-169  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.813095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3775  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  44.46 
 
 		 822 aa  596  1e-169  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0227198  normal  0.692951 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3958  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  44.97 
 
 		 798 aa  585  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0664262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2438  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  44.97 
 
 		 775 aa  578  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.156692  normal  0.122475 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1751  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  42.16 
 
 		 824 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2166  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  44.75 
 
 		 762 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.148047  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2212  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  44.75 
 
 		 762 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.752976  normal  0.0546044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2155  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductases  44.75 
 
 		 762 aa  572  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00353685 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1287  trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  42.37 
 
 		 823 aa  571  1e-161  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4344  molybdopterin oxidoreductase  45.2 
 
 		 760 aa  569  1e-161  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0116562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1145  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  42.11 
 
 		 825 aa  568  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0259974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3233  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  39.92 
 
 		 826 aa  564  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000820415 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1877  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  40.44 
 
 		 820 aa  559  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0806  trimethylamine-N-oxide reductase 2, biotin sulfoxide reductase  40.42 
 
 		 801 aa  556  1e-157  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0658  twin-arginine translocation pathway signal  41.88 
 
 		 817 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.655574 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11470  molybdopterin oxidoreductase  42.78 
 
 		 766 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000112103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4273  hypothetical protein  41.34 
 
 		 827 aa  531  1e-149  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0738  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  37.32 
 
 		 822 aa  525  1e-148  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2165  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  39.16 
 
 		 815 aa  520  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0361  molybdopterin oxidoreductase  38.19 
 
 		 841 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01843  trimethylamine N-oxide reductase system III, catalytic subunit  38.9 
 
 		 809 aa  513  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2103  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  38.9 
 
 		 815 aa  512  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1760  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  38.9 
 
 		 809 aa  513  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1967  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  38.9 
 
 		 815 aa  513  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1314  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  38.9 
 
 		 809 aa  512  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.887927 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1514  trimethylamine-n-oxide reductase 2 (tmaoreductase 2) (trimethylamine oxidase 2)  36.08 
 
 		 828 aa  512  1e-144  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0894241  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2608  trimethylamine N-oxide reductase III, subunit TorZ  38.77 
 
 		 809 aa  513  1e-144  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.022137 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0392  trimethylamine-n-oxide reductase 2 (tmaoreductase 2) (trimethylamine oxidase 2)  37.22 
 
 		 856 aa  510  1e-143  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1768  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  38.75 
 
 		 809 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.876265  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5194  molybdopterin oxidoreductase  40.7 
 
 		 845 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.050154  normal  0.834363 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0173  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  39.27 
 
 		 775 aa  504  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4218  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  40.44 
 
 		 837 aa  501  1e-140  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.216901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0987  trimethylamine-N-oxide reductase  38.02 
 
 		 829 aa  497  1e-139  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3871  biotin sulfoxide reductase  39.79 
 
 		 777 aa  496  1e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1459  trimethylamine N-oxide reductase, catalytic subunit  36.13 
 
 		 839 aa  494  9.999999999999999e-139  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.278851  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0161  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  39.71 
 
 		 777 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4926  biotin sulfoxide reductase  39.84 
 
 		 777 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3839  biotin sulfoxide reductase  38.87 
 
 		 777 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3858  biotin sulfoxide reductase  38.87 
 
 		 777 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3923  biotin sulfoxide reductase  38.74 
 
 		 777 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.937494  normal  0.611984 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3976  biotin sulfoxide reductase  38.76 
 
 		 777 aa  491  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3967  biotin sulfoxide reductase  38.87 
 
 		 777 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2798  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  37.39 
 
 		 828 aa  491  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0178103 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4027  biotin sulfoxide reductase  38.74 
 
 		 777 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633224  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03401  biotin sulfoxide reductase  39.47 
 
 		 759 aa  487  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1833  trimethylamine-N-oxide reductase  36.47 
 
 		 830 aa  488  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0165  molybdopterin guanine dinucleotide-containing S/N-oxide reductase  39.31 
 
 		 777 aa  489  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000871  biotin sulfoxide reductase  36.95 
 
 		 815 aa  486  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3343  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  37.6 
 
 		 830 aa  488  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.922902  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03352  hypothetical protein  39.47 
 
 		 759 aa  487  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3752  biotin sulfoxide reductase  39.31 
 
 		 777 aa  489  1e-136  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1538  biotin sulfoxide reductase  36.9 
 
 		 815 aa  486  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1994  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  36.43 
 
 		 830 aa  485  1e-135  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0339743  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1154  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  37.08 
 
 		 829 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4045  biotin sulfoxide reductase  38.79 
 
 		 777 aa  484  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0848  molybdopterin oxidoreductase domain-containing protein  36.1 
 
 		 816 aa  484  1e-135  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3360  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  36.69 
 
 		 830 aa  482  1e-134  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3213  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  37.08 
 
 		 829 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3352  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  37.21 
 
 		 829 aa  482  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06846  hypothetical protein  36.16 
 
 		 815 aa  476  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1051  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  36.95 
 
 		 829 aa  478  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1116  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  36.95 
 
 		 829 aa  478  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.310041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4033  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  38.54 
 
 		 850 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1055  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  36.95 
 
 		 829 aa  478  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4154  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  38.33 
 
 		 850 aa  475  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.208646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4212  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  38.33 
 
 		 850 aa  475  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3526  trimethylamine-N-oxide reductase TorA  36.3 
 
 		 830 aa  474  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.170885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2127  trimethylamine-N-oxide reductase  38.07 
 
 		 848 aa  474  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.600325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1673  trimethylamine-N-oxide reductase precursor  35.49 
 
 		 822 aa  474  1e-132  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1114  trimethylamine-N-oxide reductase  38.07 
 
 		 848 aa  473  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>