More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1634 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1208  molybdopterin oxidoreductase  42.81 
 
 
947 aa  691    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1634  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
1087 aa  2275    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  29.28 
 
 
760 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  29.98 
 
 
764 aa  199  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  29.98 
 
 
764 aa  199  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  30 
 
 
764 aa  198  6e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  29.78 
 
 
760 aa  197  7e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  29.81 
 
 
760 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  29.82 
 
 
764 aa  196  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  28.36 
 
 
760 aa  195  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  29.64 
 
 
764 aa  195  5e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0389  response regulator receiver domain-containing protein  27.66 
 
 
757 aa  188  5e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.257769  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  27.91 
 
 
758 aa  188  5e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  27.73 
 
 
758 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  28.49 
 
 
758 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  28.49 
 
 
758 aa  186  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  28.32 
 
 
760 aa  186  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2235  thiosulfate reductase  27.54 
 
 
758 aa  186  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209797  normal  0.286987 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  28.39 
 
 
760 aa  183  2e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  27.32 
 
 
758 aa  181  7e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  27.08 
 
 
695 aa  178  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  28.44 
 
 
759 aa  176  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0269  Nitrate reductase  27.73 
 
 
754 aa  174  5.999999999999999e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  24.83 
 
 
745 aa  174  6.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  24.7 
 
 
747 aa  173  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3188  molybdopterin oxidoreductase  26.57 
 
 
756 aa  172  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  27.81 
 
 
730 aa  170  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2605  twin-arginine translocation pathway signal  26.17 
 
 
879 aa  170  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0387  molybdopterin oxidoreductase  25.57 
 
 
879 aa  168  5e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  27.32 
 
 
722 aa  167  1.0000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0470  molybdopterin oxidoreductase  25.94 
 
 
855 aa  165  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  27.71 
 
 
744 aa  163  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  26.39 
 
 
731 aa  163  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0265  molybdopterin oxidoreductase  26.98 
 
 
764 aa  162  4e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.227459  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1914  thiosulfate reductase  26.77 
 
 
761 aa  161  8e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.527644  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2276  molybdopterin oxidoreductase  26.61 
 
 
807 aa  160  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  26.57 
 
 
711 aa  157  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  25.04 
 
 
812 aa  154  7e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  22.71 
 
 
1139 aa  152  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0171  molybdopterin oxidoreductase  28.65 
 
 
709 aa  153  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.662613  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1228  molybdopterin oxidoreductase  25.77 
 
 
843 aa  152  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  22.91 
 
 
1143 aa  148  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1628  molybdopterin oxidoreductase  29.2 
 
 
691 aa  146  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  25.58 
 
 
729 aa  146  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1890  molybdopterin oxidoreductase  25.38 
 
 
726 aa  145  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0643  formate dehydrogenase  28.32 
 
 
764 aa  145  5e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02586  hypothetical protein  39.01 
 
 
257 aa  145  6e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  26.19 
 
 
750 aa  145  6e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6214  molybdopterin oxidoreductase  25.86 
 
 
978 aa  144  8e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492261  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1206  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.23 
 
 
193 aa  144  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3848  molybdopterin oxidoreductase  25.8 
 
 
738 aa  143  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2365  molybdopterin oxidoreductase  31.22 
 
 
777 aa  143  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2341  molybdopterin oxidoreductase  25.61 
 
 
854 aa  143  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.064973  normal  0.0429388 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3826  molybdopterin oxidoreductase  25.61 
 
 
854 aa  143  1.9999999999999998e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185272  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  26.46 
 
 
698 aa  142  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1612  molydopterin dinucleotide-binding region  24.02 
 
 
967 aa  142  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  25.04 
 
 
891 aa  141  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2338  molybdopterin oxidoreductase  25.69 
 
 
729 aa  140  8.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1195  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.08 
 
 
197 aa  140  8.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.675637  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2794  molybdopterin oxidoreductase  26.32 
 
 
698 aa  140  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2511  molybdopterin oxidoreductase  26.62 
 
 
776 aa  140  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  26.38 
 
 
732 aa  139  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0340  putative molybdopterin oxidoreductase family protein  26.36 
 
 
969 aa  139  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0895  Nitrate reductase  25.6 
 
 
711 aa  139  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.381214  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1179  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.96 
 
 
211 aa  139  3.0000000000000003e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2768  molydopterin dinucleotide-binding region  33.81 
 
 
898 aa  139  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.81742  normal  0.229258 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0511  molydopterin dinucleotide-binding region  23.64 
 
 
994 aa  138  6.0000000000000005e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0709241  normal  0.262694 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2919  molybdopterin oxidoreductase  25.53 
 
 
733 aa  138  7.000000000000001e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2603  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  36.08 
 
 
231 aa  137  8e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.777571 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0635  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.89 
 
 
251 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000692745 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6518  molybdopterin dinucleotide-binding region  26.11 
 
 
773 aa  136  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1318  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.57 
 
 
973 aa  136  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2187  molybdopterin oxidoreductase  26.12 
 
 
725 aa  136  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000199348  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1793  formate dehydrogenase  23.38 
 
 
1014 aa  136  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.546724  normal  0.0478269 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  24.22 
 
 
731 aa  135  3e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2256  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  27.51 
 
 
816 aa  135  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0635  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.34 
 
 
251 aa  135  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000753763 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2933  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  35.68 
 
 
505 aa  136  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1318  molybdopterin oxidoreductase  25.88 
 
 
695 aa  135  3.9999999999999996e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.952277  hitchhiker  0.000256409 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0641  formate dehydrogenase, alpha subunit  26.43 
 
 
979 aa  135  5e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0034  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.2 
 
 
517 aa  135  5e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0026  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 1-like  34.64 
 
 
523 aa  135  6e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00952912  normal  0.230083 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0664  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.8 
 
 
260 aa  135  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1613  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  34.54 
 
 
531 aa  134  6.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1149  molybdopterin oxidoreductase  24.72 
 
 
856 aa  134  9e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000213682  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2860  molybdopterin oxidoreductase  26.16 
 
 
695 aa  134  9e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0385  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  34.01 
 
 
236 aa  134  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1965  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 1-like  33.84 
 
 
517 aa  133  1.0000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1957  tetrathionate reductase subunit B  37.02 
 
 
244 aa  134  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000105881 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0119  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.64 
 
 
517 aa  134  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0357166  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1786  tetrathionate reductase subunit B  37.02 
 
 
244 aa  134  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1498  tetrathionate reductase subunit B  37.02 
 
 
244 aa  134  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000220463 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0591  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.8 
 
 
260 aa  134  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1519  tetrathionate reductase subunit B  37.02 
 
 
244 aa  134  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.607656  hitchhiker  0.0000454632 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1482  tetrathionate reductase subunit B  37.02 
 
 
244 aa  134  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.376515 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  26.14 
 
 
739 aa  132  2.0000000000000002e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0510  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.59 
 
 
559 aa  133  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0098001  normal  0.0322264 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3860  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.25 
 
 
260 aa  133  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.468907 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0353  formate dehydrogenase  24.64 
 
 
833 aa  133  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000992334  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2632  molybdopterin oxidoreductase  25.87 
 
 
739 aa  132  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.348569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>