More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1228 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_0643  molybdopterin oxidoreductase  57.29 
 
 		 866 aa  976    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1228  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 843 aa  1755    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2341  molybdopterin oxidoreductase  51.76 
 
 		 854 aa  929    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.064973  normal  0.0429388 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1149  molybdopterin oxidoreductase  55.65 
 
 		 856 aa  984    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000213682  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3826  molybdopterin oxidoreductase  51.76 
 
 		 854 aa  929    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185272  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0470  molybdopterin oxidoreductase  55.65 
 
 		 855 aa  984    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0216  molybdopterin oxidoreductase  31.89 
 
 		 837 aa  399  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0353  formate dehydrogenase  30.17 
 
 		 833 aa  367  1e-100  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000992334  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2426  molybdopterin oxidoreductase  31.29 
 
 		 826 aa  338  3.9999999999999995e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242196 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3094  molybdopterin oxidoreductase  27.6 
 
 		 858 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.799457  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  26.76 
 
 		 758 aa  211  7e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0387  molybdopterin oxidoreductase  26.54 
 
 		 879 aa  208  3e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  28.22 
 
 		 764 aa  207  9e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  28.85 
 
 		 760 aa  206  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  28.22 
 
 		 764 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  28.05 
 
 		 760 aa  206  2e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  25.62 
 
 		 758 aa  206  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1810  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  25.07 
 
 		 730 aa  205  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  25.62 
 
 		 758 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  28.1 
 
 		 760 aa  204  5e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  28.1 
 
 		 764 aa  204  5e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2605  twin-arginine translocation pathway signal  25.53 
 
 		 879 aa  204  6e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2235  thiosulfate reductase  25.5 
 
 		 758 aa  204  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209797  normal  0.286987 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  25.5 
 
 		 758 aa  204  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  27.92 
 
 		 764 aa  204  8e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  25.5 
 
 		 758 aa  203  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  27.92 
 
 		 764 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  26.02 
 
 		 759 aa  202  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  24.91 
 
 		 722 aa  199  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  25.28 
 
 		 760 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  27.54 
 
 		 760 aa  196  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  25.85 
 
 		 739 aa  194  6e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0610  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  24.91 
 
 		 804 aa  193  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.124465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0265  molybdopterin oxidoreductase  26.16 
 
 		 764 aa  192  2.9999999999999997e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.227459  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  26.95 
 
 		 760 aa  191  4e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2276  molybdopterin oxidoreductase  24.2 
 
 		 807 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2777  nitrate reductase  24.35 
 
 		 731 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1197  molybdopterin oxidoreductase  23.97 
 
 		 934 aa  184  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  27.49 
 
 		 730 aa  184  5.0000000000000004e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2400  molybdopterin oxidoreductase  26.82 
 
 		 738 aa  184  5.0000000000000004e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0425196  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1914  thiosulfate reductase  23.97 
 
 		 761 aa  180  8e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.527644  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0389  response regulator receiver domain-containing protein  27.24 
 
 		 757 aa  180  1e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.257769  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2386  molybdopterin oxidoreductase  26.57 
 
 		 747 aa  179  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  25.98 
 
 		 731 aa  179  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0269  Nitrate reductase  23.35 
 
 		 754 aa  176  9.999999999999999e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2562  formate dehydrogenase  26.62 
 
 		 720 aa  176  9.999999999999999e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  25.19 
 
 		 936 aa  174  5e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0620  twin-arginine translocation pathway signal  26.16 
 
 		 741 aa  174  5.999999999999999e-42  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.390565  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  24.64 
 
 		 731 aa  174  6.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0166  Formate dehydrogenase  26.33 
 
 		 711 aa  170  1e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149305 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0912  molybdopterin oxidoreductase  26.33 
 
 		 739 aa  170  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  24.44 
 
 		 695 aa  168  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  27.68 
 
 		 744 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  24.7 
 
 		 747 aa  165  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0931  molybdopterin oxidoreductase  25 
 
 		 743 aa  163  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.837438 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0664  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  25.47 
 
 		 759 aa  163  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0723  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  25.47 
 
 		 759 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1583  aminotransferase class V  25.03 
 
 		 1139 aa  162  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  23.07 
 
 		 750 aa  162  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  24.49 
 
 		 745 aa  162  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3188  molybdopterin oxidoreductase  24.97 
 
 		 756 aa  161  6e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0769  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  25.34 
 
 		 759 aa  160  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447962  normal  0.969632 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0650  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  25.59 
 
 		 759 aa  160  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2338  molybdopterin oxidoreductase  24.26 
 
 		 729 aa  159  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1509  Formate dehydrogenase  25.21 
 
 		 732 aa  156  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2632  molybdopterin oxidoreductase  26.63 
 
 		 739 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.348569  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0340  putative molybdopterin oxidoreductase family protein  23.32 
 
 		 969 aa  152  2e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  24.65 
 
 		 1143 aa  152  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1634  molybdopterin oxidoreductase  25.77 
 
 		 1087 aa  152  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1609  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.43 
 
 		 811 aa  150  7e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.356497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0059  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  23.49 
 
 		 953 aa  150  8e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1668  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.38 
 
 		 811 aa  150  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1674  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.44 
 
 		 811 aa  150  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.666152  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0447  molybdopterin oxidoreductase  29.16 
 
 		 731 aa  149  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  23.74 
 
 		 698 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4696  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  25.03 
 
 		 847 aa  149  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0792872  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2701  anaerobic dehydrogenase, acetylene hydratase-like  23.4 
 
 		 692 aa  149  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00185864  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1841  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.08 
 
 		 811 aa  148  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1600  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.27 
 
 		 811 aa  148  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573894  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01557  oxidoreductase subunit  23.9 
 
 		 807 aa  148  5e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.405121  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  24.26 
 
 		 732 aa  148  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1795  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  23.9 
 
 		 807 aa  148  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.725278  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01547  hypothetical protein  23.9 
 
 		 807 aa  148  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.475009  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1880  Formate dehydrogenase  23.76 
 
 		 744 aa  148  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2042  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  23.9 
 
 		 807 aa  148  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2055  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  23.9 
 
 		 798 aa  147  8.000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2718  molybdopterin oxidoreductase  25.88 
 
 		 737 aa  147  9e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  24.88 
 
 		 812 aa  147  9e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2297  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  23.79 
 
 		 798 aa  146  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000563804 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2919  molybdopterin oxidoreductase  28.05 
 
 		 733 aa  146  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1661  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  23.79 
 
 		 807 aa  146  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  23.99 
 
 		 1135 aa  145  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0899  Formate dehydrogenase  22.87 
 
 		 756 aa  145  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1629  molybdopterin oxidoreductase  22.99 
 
 		 789 aa  145  4e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  24.02 
 
 		 691 aa  145  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  24.02 
 
 		 691 aa  145  4e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  24.02 
 
 		 691 aa  145  4e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1229  molybdopterin oxidoreductase  23.85 
 
 		 758 aa  144  6e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.634886  normal  0.648552 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0056  molydopterin dinucleotide-binding region  29.95 
 
 		 951 aa  144  6e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0442  molybdopterin oxidoreductase  23.88 
 
 		 731 aa  144  7e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>