More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0470 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0470  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
855 aa  1773    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1228  molybdopterin oxidoreductase  55.88 
 
 
843 aa  1001    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2341  molybdopterin oxidoreductase  47.97 
 
 
854 aa  829    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.064973  normal  0.0429388 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0643  molybdopterin oxidoreductase  50.55 
 
 
866 aa  878    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3826  molybdopterin oxidoreductase  47.97 
 
 
854 aa  829    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185272  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1149  molybdopterin oxidoreductase  80.28 
 
 
856 aa  1432    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000213682  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0353  formate dehydrogenase  30.01 
 
 
833 aa  337  7.999999999999999e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000992334  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0216  molybdopterin oxidoreductase  30.97 
 
 
837 aa  334  5e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2426  molybdopterin oxidoreductase  29.46 
 
 
826 aa  302  1e-80  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.242196 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  25.73 
 
 
758 aa  198  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  25.73 
 
 
758 aa  198  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  25.17 
 
 
758 aa  198  5.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  25.73 
 
 
758 aa  197  7e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  25.61 
 
 
758 aa  197  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2235  thiosulfate reductase  25.61 
 
 
758 aa  195  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209797  normal  0.286987 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  25.06 
 
 
760 aa  192  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3094  molybdopterin oxidoreductase  24.86 
 
 
858 aa  190  1e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.799457  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  25.12 
 
 
764 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0265  molybdopterin oxidoreductase  26.07 
 
 
764 aa  187  7e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.227459  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  25.83 
 
 
730 aa  187  9e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  24.4 
 
 
759 aa  183  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0644016 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2055  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  26.5 
 
 
798 aa  181  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01547  hypothetical protein  26.5 
 
 
807 aa  181  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.475009  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01557  oxidoreductase subunit  26.5 
 
 
807 aa  181  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.405121  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2042  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  26.5 
 
 
807 aa  181  4.999999999999999e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1795  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  26.5 
 
 
807 aa  181  4.999999999999999e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.725278  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2297  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  26.23 
 
 
798 aa  181  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000563804 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  24.6 
 
 
760 aa  181  7e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  26.37 
 
 
760 aa  180  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1661  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  26.39 
 
 
807 aa  180  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  27.71 
 
 
760 aa  178  4e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  26.59 
 
 
764 aa  177  5e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1668  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.09 
 
 
811 aa  176  9.999999999999999e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1674  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.18 
 
 
811 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.666152  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  26.43 
 
 
764 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1609  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.03 
 
 
811 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.356497  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  25.87 
 
 
764 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  27.89 
 
 
764 aa  175  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1600  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.09 
 
 
811 aa  174  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573894  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1841  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  25.95 
 
 
811 aa  173  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0610  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  24.32 
 
 
804 aa  172  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.124465  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  27.3 
 
 
760 aa  171  7e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0389  response regulator receiver domain-containing protein  24.65 
 
 
757 aa  170  8e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.257769  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2605  twin-arginine translocation pathway signal  26 
 
 
879 aa  169  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  23.63 
 
 
760 aa  168  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1774  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  26.25 
 
 
752 aa  167  6.9999999999999995e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  25.51 
 
 
936 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  23.64 
 
 
695 aa  166  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1634  molybdopterin oxidoreductase  26.15 
 
 
1087 aa  165  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1914  thiosulfate reductase  24.49 
 
 
761 aa  165  4.0000000000000004e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.527644  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2256  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  25.28 
 
 
816 aa  159  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6214  molybdopterin oxidoreductase  23.37 
 
 
978 aa  159  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492261  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  23.08 
 
 
750 aa  159  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1418  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  25.2 
 
 
814 aa  158  3e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0387  molybdopterin oxidoreductase  24.97 
 
 
879 aa  158  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1078  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  25.52 
 
 
814 aa  158  4e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.965114 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1810  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  24.96 
 
 
730 aa  158  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  22.48 
 
 
739 aa  157  6e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1629  molybdopterin oxidoreductase  22.38 
 
 
789 aa  157  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2226  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  24.86 
 
 
814 aa  157  8e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.982689 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1063  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  25.23 
 
 
814 aa  157  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0105709  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  25.23 
 
 
814 aa  157  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00898  dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit A  24.74 
 
 
814 aa  155  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0778088  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2749  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  24.74 
 
 
814 aa  155  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0999  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  24.74 
 
 
814 aa  155  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00905  hypothetical protein  24.74 
 
 
814 aa  155  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0839348  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2702  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  24.74 
 
 
814 aa  155  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.98868 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2777  nitrate reductase  25.07 
 
 
731 aa  155  4e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1197  molybdopterin oxidoreductase  22.84 
 
 
934 aa  155  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1056  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  24.74 
 
 
814 aa  155  4e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  24.74 
 
 
814 aa  154  5e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0059  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  22.45 
 
 
953 aa  154  5.9999999999999996e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1208  molybdopterin oxidoreductase  26.91 
 
 
947 aa  154  7e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0998  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  25.03 
 
 
814 aa  154  8e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.181006  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2056  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  24.94 
 
 
808 aa  153  1e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0340  putative molybdopterin oxidoreductase family protein  22.74 
 
 
969 aa  153  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1029  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  25.03 
 
 
814 aa  153  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1687  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  24.25 
 
 
817 aa  153  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914371  normal  0.111557 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  27.96 
 
 
722 aa  153  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2043  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  24.94 
 
 
808 aa  152  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1773  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  25 
 
 
808 aa  152  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2304  molybdopterin oxidoreductase  22.96 
 
 
803 aa  152  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3188  molybdopterin oxidoreductase  24.18 
 
 
756 aa  152  3e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4524  molybdopterin oxidoreductase  22.41 
 
 
978 aa  152  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.556057 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0269  Nitrate reductase  26.2 
 
 
754 aa  151  6e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1613  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  25.09 
 
 
808 aa  150  7e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  23.68 
 
 
1135 aa  150  9e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  24.59 
 
 
731 aa  150  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0345  nitrate reductase  23.35 
 
 
731 aa  150  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213856  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1071  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.26 
 
 
973 aa  148  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0422  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  23.13 
 
 
806 aa  147  6e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0580651  decreased coverage  0.000000000595111 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1356  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.26 
 
 
973 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2338  molybdopterin oxidoreductase  22.26 
 
 
973 aa  147  7.0000000000000006e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.941239  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2047  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.26 
 
 
978 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1660  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  24.68 
 
 
808 aa  147  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1743  molybdopterin oxidoreductase  23.12 
 
 
974 aa  146  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.216268  normal  0.286341 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1497  molydopterin dinucleotide-binding region  23.27 
 
 
713 aa  146  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3221  molybdopterin oxidoreductase  22.15 
 
 
973 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.461579  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3106  molybdopterin oxidoreductase  22.15 
 
 
973 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1612  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  24.2 
 
 
820 aa  145  3e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>