More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1810 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1810  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  100 
 
 
730 aa  1481    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2777  nitrate reductase  73.77 
 
 
731 aa  1120    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0125  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  33.91 
 
 
966 aa  335  2e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0106  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  33.33 
 
 
966 aa  333  6e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00863778 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2547  molybdopterin oxidoreductase  31.67 
 
 
711 aa  274  4.0000000000000004e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00181061  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2551  molybdopterin oxidoreductase, iron-sulfur binding subunit  29.93 
 
 
920 aa  273  1e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0610  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  29.48 
 
 
804 aa  267  5.999999999999999e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.124465  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0353  formate dehydrogenase  27.75 
 
 
833 aa  239  2e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000992334  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0216  molybdopterin oxidoreductase  27.53 
 
 
837 aa  223  8e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2269  molybdopterin oxidoreductase  29.94 
 
 
691 aa  221  3e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.737839  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5665  putative iron-sulfur binding oxidoreductase  28.28 
 
 
1037 aa  215  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.858878  normal  0.730626 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2212  molybdopterin oxidoreductase, iron-sulfur binding subunit  28.03 
 
 
1023 aa  206  1e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1228  molybdopterin oxidoreductase  25.07 
 
 
843 aa  205  3e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  25.94 
 
 
739 aa  204  6e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2426  molybdopterin oxidoreductase  27.78 
 
 
826 aa  203  9e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.242196 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0289  putative iron-sulfur binding oxidoreductase  27.16 
 
 
1026 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.120275  hitchhiker  0.0040392 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2933  molybdopterin oxidoreductase, molybdopterin-binding subunit, putative  27.88 
 
 
689 aa  201  5e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1527  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 1-like protein  28.14 
 
 
1036 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1595  molybdopterin oxidoreductase, iron-sulfur binding subunit  26.48 
 
 
984 aa  198  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3476  molybdopterin oxidoreductase, iron-sulfur binding subunit  27.36 
 
 
1031 aa  196  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.460173  normal  0.230979 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2605  twin-arginine translocation pathway signal  27.82 
 
 
879 aa  192  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0528  putative iron-sulfur binding oxidoreductase  26.82 
 
 
1028 aa  187  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0222  Fe-S-cluster-containing hydrogenase  28.13 
 
 
1039 aa  187  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  28.1 
 
 
731 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2341  molybdopterin oxidoreductase  24.04 
 
 
854 aa  185  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.064973  normal  0.0429388 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3391  molybdopterin oxidoreductase  27.38 
 
 
686 aa  185  3e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3386  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 1-like protein  26.98 
 
 
1029 aa  184  3e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.364426 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3826  molybdopterin oxidoreductase  24.04 
 
 
854 aa  185  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185272  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  26.09 
 
 
760 aa  182  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0620  twin-arginine translocation pathway signal  25.63 
 
 
741 aa  181  4.999999999999999e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.390565  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  26.2 
 
 
722 aa  179  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0387  molybdopterin oxidoreductase  27.35 
 
 
879 aa  179  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  25.95 
 
 
764 aa  179  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  25.49 
 
 
764 aa  178  3e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  25.49 
 
 
764 aa  177  4e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2562  formate dehydrogenase  25.07 
 
 
720 aa  177  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  28.3 
 
 
750 aa  178  4e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01310  molybdopterin oxidoreductase, iron-sulfur binding subunit  26.95 
 
 
1037 aa  176  9.999999999999999e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.462461  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2689  molybdopterin oxidoreductase  31.03 
 
 
691 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0572937 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  25.87 
 
 
760 aa  172  1e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1238  molybdopterin oxidoreductase, iron-sulfur binding subunit  25.24 
 
 
993 aa  172  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.23327  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  28.57 
 
 
730 aa  172  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  26.44 
 
 
695 aa  172  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2919  molybdopterin oxidoreductase  26.95 
 
 
733 aa  172  2e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1463  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 1-like protein  26.57 
 
 
1010 aa  172  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.210969  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2386  molybdopterin oxidoreductase  26.16 
 
 
747 aa  171  5e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2400  molybdopterin oxidoreductase  25.95 
 
 
738 aa  169  2e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0425196  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4918  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  26.42 
 
 
668 aa  169  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000514285  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  27.58 
 
 
760 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2597  molybdopterin oxidoreductase  27.29 
 
 
688 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2413  molybdopterin oxidoreductase, iron-sulfur binding subunit  27.12 
 
 
1087 aa  168  4e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220952  normal  0.47173 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3983  molybdopterin oxidoreductase, iron-sulfur binding subunit  25.32 
 
 
1099 aa  167  6.9999999999999995e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.53116  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  26.92 
 
 
759 aa  167  8e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0912  molybdopterin oxidoreductase  27.29 
 
 
739 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  27.39 
 
 
764 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3153  molybdopterin oxidoreductase  24.01 
 
 
689 aa  166  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  27.12 
 
 
764 aa  165  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  26.44 
 
 
760 aa  163  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  24.83 
 
 
758 aa  162  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1425  iron-sulfur binding oxidoreductase  26.15 
 
 
962 aa  162  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2375  molybdopterin oxidoreductase  24.39 
 
 
747 aa  162  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  24.83 
 
 
758 aa  161  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  24.83 
 
 
758 aa  161  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2235  thiosulfate reductase  24.83 
 
 
758 aa  161  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209797  normal  0.286987 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5955  molybdopterin oxidoreductase, iron-sulfur binding subunit  26.23 
 
 
942 aa  161  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.456452  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  24.7 
 
 
758 aa  159  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4140  Fe-S-cluster-containing hydrogenase components 1-like protein  25.96 
 
 
1010 aa  159  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1635  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  26.07 
 
 
1019 aa  159  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.985157  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6893  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  27.32 
 
 
960 aa  158  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2713  putative oxidoreductase, iron-sulfur binding protein  28.39 
 
 
974 aa  157  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0503336  normal  0.426471 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0841  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.26 
 
 
1007 aa  155  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216613  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5824  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  27.36 
 
 
947 aa  156  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.056314  normal  0.0644472 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0166  Formate dehydrogenase  26.01 
 
 
711 aa  155  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149305 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0271  molybdopterin oxidoreductase  27.57 
 
 
688 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0737341  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0470  molybdopterin oxidoreductase  24.61 
 
 
855 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  25.45 
 
 
760 aa  154  5e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2539  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.8 
 
 
766 aa  154  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  24.67 
 
 
718 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  24.67 
 
 
718 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  24.86 
 
 
718 aa  153  1e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  28.92 
 
 
744 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  26.35 
 
 
731 aa  152  2e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1633  molybdopterin oxidoreductase  23.34 
 
 
734 aa  152  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3003  Fe-S-cluster-containing hydrogenase  26.79 
 
 
1014 aa  152  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00213363 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2769  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.04 
 
 
792 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2682  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.07 
 
 
792 aa  151  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2718  molybdopterin oxidoreductase  27.9 
 
 
737 aa  150  7e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0320  Formate dehydrogenase  25.81 
 
 
700 aa  150  8e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2900  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  23.93 
 
 
792 aa  150  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735186  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2788  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  23.93 
 
 
792 aa  150  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2725  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  23.84 
 
 
792 aa  150  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1382  molybdopterin oxidoreductase  26.45 
 
 
678 aa  149  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0219675  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2813  molybdopterin oxidoreductase  27.68 
 
 
738 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2632  molybdopterin oxidoreductase  27.47 
 
 
739 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.348569  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2276  molybdopterin oxidoreductase  24.68 
 
 
807 aa  149  2.0000000000000003e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4428  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  27.88 
 
 
950 aa  148  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  24.04 
 
 
760 aa  149  3e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0547  molybdopterin oxidoreductase  23.24 
 
 
732 aa  148  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  23.86 
 
 
729 aa  147  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  24.95 
 
 
758 aa  147  6e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>