More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2269 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2933  molybdopterin oxidoreductase, molybdopterin-binding subunit, putative  63.78 
 
 		 689 aa  901    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2689  molybdopterin oxidoreductase  73.99 
 
 		 691 aa  1014    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0572937 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2269  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 691 aa  1396    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.737839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3391  molybdopterin oxidoreductase  47.69 
 
 		 686 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0271  molybdopterin oxidoreductase  43.47 
 
 		 688 aa  520  1e-146  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0737341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2547  molybdopterin oxidoreductase  34.24 
 
 		 711 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00181061  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0610  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  30.93 
 
 		 804 aa  308  2.0000000000000002e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.124465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2777  nitrate reductase  29.24 
 
 		 731 aa  266  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1810  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  30.08 
 
 		 730 aa  243  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  26.02 
 
 		 760 aa  154  4e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0125  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  27.12 
 
 		 966 aa  154  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  26.7 
 
 		 722 aa  153  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  25.1 
 
 		 764 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  24.81 
 
 		 764 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  25.85 
 
 		 760 aa  152  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2551  molybdopterin oxidoreductase, iron-sulfur binding subunit  25.33 
 
 		 920 aa  151  5e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  24.84 
 
 		 764 aa  150  6e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4918  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  24.35 
 
 		 668 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000514285  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0106  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  26.57 
 
 		 966 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00863778 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  24.84 
 
 		 760 aa  147  8.000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1170  formate dehydrogenase  29.12 
 
 		 667 aa  146  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894825  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  24.74 
 
 		 764 aa  144  8e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  25.1 
 
 		 758 aa  143  9e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  24.33 
 
 		 760 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  24.87 
 
 		 764 aa  141  3e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  24.36 
 
 		 760 aa  140  6e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02090  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  22.91 
 
 		 734 aa  139  1e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1229  Formate dehydrogenase  28.5 
 
 		 667 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1331  Formate dehydrogenase  28.41 
 
 		 667 aa  138  4e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  25.35 
 
 		 730 aa  136  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2276  molybdopterin oxidoreductase  26.39 
 
 		 807 aa  135  3e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0320  Formate dehydrogenase  25.99 
 
 		 700 aa  135  3e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2738  molybdopterin oxidoreductase  26.62 
 
 		 671 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1217  molybdopterin oxidoreductase  27.96 
 
 		 666 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.718553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  28.45 
 
 		 718 aa  130  6e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  28.45 
 
 		 718 aa  130  6e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  27.59 
 
 		 718 aa  130  8.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  25 
 
 		 936 aa  128  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  26.08 
 
 		 760 aa  128  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  24.49 
 
 		 758 aa  127  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  24.87 
 
 		 758 aa  127  7e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0620  twin-arginine translocation pathway signal  24.93 
 
 		 741 aa  127  7e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.390565  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0265  molybdopterin oxidoreductase  22.41 
 
 		 764 aa  127  9e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.227459  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2860  molybdopterin oxidoreductase  26.34 
 
 		 695 aa  126  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2235  thiosulfate reductase  24.75 
 
 		 758 aa  125  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209797  normal  0.286987 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  24.37 
 
 		 758 aa  125  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  26.05 
 
 		 750 aa  124  7e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  24.27 
 
 		 758 aa  124  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0216  molybdopterin oxidoreductase  24.5 
 
 		 837 aa  124  8e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2919  molybdopterin oxidoreductase  26.07 
 
 		 733 aa  121  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2562  formate dehydrogenase  24.32 
 
 		 720 aa  122  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0353  formate dehydrogenase  25.1 
 
 		 833 aa  120  6e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000992334  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  23.64 
 
 		 759 aa  119  9.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  23.55 
 
 		 745 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2341  molybdopterin oxidoreductase  24.9 
 
 		 854 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.064973  normal  0.0429388 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3826  molybdopterin oxidoreductase  24.9 
 
 		 854 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185272  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  26.21 
 
 		 731 aa  118  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0880  molybdopterin oxidoreductase family protein  26.4 
 
 		 671 aa  117  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.772127  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  27.83 
 
 		 691 aa  117  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2400  molybdopterin oxidoreductase  24.25 
 
 		 738 aa  117  6e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0425196  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  26.92 
 
 		 728 aa  117  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  24.52 
 
 		 695 aa  117  7.999999999999999e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0643  formate dehydrogenase  24.11 
 
 		 764 aa  116  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  24.44 
 
 		 744 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3188  molybdopterin oxidoreductase  24.5 
 
 		 756 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  25.79 
 
 		 691 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  27.63 
 
 		 691 aa  114  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  25.79 
 
 		 691 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  25.79 
 
 		 691 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  27.44 
 
 		 691 aa  114  5e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  24.17 
 
 		 739 aa  114  6e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  26.83 
 
 		 691 aa  114  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0447  molybdopterin oxidoreductase  26.2 
 
 		 731 aa  114  8.000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  26.83 
 
 		 691 aa  114  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1921  molybdopterin oxidoreductase  21.14 
 
 		 669 aa  114  9e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0912  molybdopterin oxidoreductase  24.4 
 
 		 739 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  27.44 
 
 		 691 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5335  Nitrate reductase  25.74 
 
 		 654 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0713  molybdopterin oxidoreductase  27.21 
 
 		 668 aa  112  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1285  formate dehydrogenase  25.65 
 
 		 676 aa  111  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2813  molybdopterin oxidoreductase  25.66 
 
 		 738 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0269  Nitrate reductase  23.41 
 
 		 754 aa  110  8.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1497  molydopterin dinucleotide-binding region  23.24 
 
 		 713 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  27.85 
 
 		 670 aa  110  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2605  twin-arginine translocation pathway signal  25.32 
 
 		 879 aa  110  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3090  oxidoreductase protein  26.05 
 
 		 680 aa  109  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.725789 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0442  molybdopterin oxidoreductase  25.45 
 
 		 731 aa  108  3e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2794  molybdopterin oxidoreductase  25.53 
 
 		 698 aa  108  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  23.76 
 
 		 731 aa  107  5e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2565  molybdopterin oxidoreductase  26.71 
 
 		 747 aa  107  6e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0260966 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1243  molybdopterin oxidoreductase  25.55 
 
 		 662 aa  107  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0725  Nitrate reductase  26.51 
 
 		 668 aa  107  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000713238 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2925  molydopterin dinucleotide-binding region  22.62 
 
 		 691 aa  106  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  25.72 
 
 		 691 aa  106  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1074  molybdopterin oxidoreductase  22.16 
 
 		 717 aa  106  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3153  molybdopterin oxidoreductase  24.53 
 
 		 689 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0387  molybdopterin oxidoreductase  24.35 
 
 		 879 aa  106  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4342  molydopterin dinucleotide-binding region  23.08 
 
 		 727 aa  105  2e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.303774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0767  molybdopterin oxidoreductase  26.96 
 
 		 694 aa  106  2e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.487649 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1484  Nitrate reductase  30.02 
 
 		 739 aa  106  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>