More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2689 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2933  molybdopterin oxidoreductase, molybdopterin-binding subunit, putative  64.36 
 
 		 689 aa  896    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2269  molybdopterin oxidoreductase  73.99 
 
 		 691 aa  978    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.737839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2689  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 691 aa  1382    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0572937 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3391  molybdopterin oxidoreductase  48.06 
 
 		 686 aa  598  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0271  molybdopterin oxidoreductase  43.39 
 
 		 688 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0737341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2547  molybdopterin oxidoreductase  33.56 
 
 		 711 aa  320  7e-86  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00181061  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0610  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  32.65 
 
 		 804 aa  256  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.124465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2777  nitrate reductase  28.11 
 
 		 731 aa  228  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1810  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  31.03 
 
 		 730 aa  186  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0125  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  27.76 
 
 		 966 aa  144  8e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0106  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  27.6 
 
 		 966 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00863778 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2551  molybdopterin oxidoreductase, iron-sulfur binding subunit  25.18 
 
 		 920 aa  137  9e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  25.43 
 
 		 722 aa  133  7.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3594  molybdopterin oxidoreductase  27.49 
 
 		 718 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.810093  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3667  molybdopterin oxidoreductase  27.49 
 
 		 718 aa  126  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.18517  normal  0.604802 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2276  molybdopterin oxidoreductase  26.94 
 
 		 807 aa  125  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3599  molybdopterin oxidoreductase  27.29 
 
 		 718 aa  124  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0991875  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0265  molybdopterin oxidoreductase  24.12 
 
 		 764 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.227459  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0216  molybdopterin oxidoreductase  24.91 
 
 		 837 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2919  molybdopterin oxidoreductase  25.21 
 
 		 733 aa  121  3e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0353  formate dehydrogenase  25.14 
 
 		 833 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000992334  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  24.12 
 
 		 760 aa  118  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3632  molybdopterin oxidoreductase  26.53 
 
 		 691 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1170  formate dehydrogenase  29.29 
 
 		 667 aa  117  5e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894825  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0517  molybdopterin oxidoreductase  27.33 
 
 		 691 aa  118  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.180368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  23.88 
 
 		 936 aa  117  6e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02090  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  22.62 
 
 		 734 aa  117  7.999999999999999e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1229  Formate dehydrogenase  29.62 
 
 		 667 aa  117  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  24.17 
 
 		 764 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0063  molybdopterin oxidoreductase  27.33 
 
 		 691 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0545  molybdopterin oxidoreductase  27.33 
 
 		 691 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  24.17 
 
 		 760 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0473  putative molybdopterin oxidoreductase  25.35 
 
 		 692 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2849  molybdopterin oxidoreductase  26.93 
 
 		 691 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  24.23 
 
 		 764 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1105  molybdopterin oxidoreductase  26.88 
 
 		 691 aa  115  3e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1331  Formate dehydrogenase  29.42 
 
 		 667 aa  115  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0450  molybdopterin oxidoreductase  26.73 
 
 		 691 aa  115  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  26.56 
 
 		 691 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  26.56 
 
 		 691 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  26.56 
 
 		 691 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  25.05 
 
 		 760 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2565  molybdopterin oxidoreductase  28.09 
 
 		 747 aa  114  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0260966 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  23.89 
 
 		 764 aa  114  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0912  molybdopterin oxidoreductase  24.96 
 
 		 739 aa  114  9e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4918  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  24.04 
 
 		 668 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000514285  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0320  Formate dehydrogenase  27.77 
 
 		 700 aa  112  3e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  24.24 
 
 		 760 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3483  molybdopterin oxidoreductase  26.14 
 
 		 692 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.220796  hitchhiker  0.00253515 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5335  Nitrate reductase  24.73 
 
 		 654 aa  111  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  24.55 
 
 		 758 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2562  formate dehydrogenase  24.85 
 
 		 720 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  24.26 
 
 		 760 aa  111  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  23.36 
 
 		 764 aa  111  5e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  25.43 
 
 		 759 aa  111  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  23.24 
 
 		 764 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0688  molybdopterin oxidoreductase  27.04 
 
 		 692 aa  110  7.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2400  molybdopterin oxidoreductase  23.36 
 
 		 738 aa  110  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0425196  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  25.8 
 
 		 666 aa  109  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0475  molybdopterin oxidoreductase  26.85 
 
 		 670 aa  109  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5161  molybdopterin oxidoreductase  26.41 
 
 		 728 aa  109  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.054105 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2738  molybdopterin oxidoreductase  27.77 
 
 		 671 aa  108  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 		 760 aa  107  5e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2860  molybdopterin oxidoreductase  23.85 
 
 		 695 aa  107  7e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1932  molybdopterin oxidoreductase  26.25 
 
 		 726 aa  107  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.496239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2686  molybdopterin oxidoreductase  24.6 
 
 		 692 aa  106  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.604293  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2003  molybdopterin oxidoreductase  24.17 
 
 		 726 aa  106  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.447732 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2208  molybdopterin oxidoreductase  26.04 
 
 		 726 aa  105  2e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.881316  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2474  molybdopterin oxidoreductase  25.9 
 
 		 684 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00135693  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0643  formate dehydrogenase  25.31 
 
 		 764 aa  104  5e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3826  molybdopterin oxidoreductase  22.94 
 
 		 854 aa  104  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185272  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2341  molybdopterin oxidoreductase  22.94 
 
 		 854 aa  104  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.064973  normal  0.0429388 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  23.91 
 
 		 739 aa  103  8e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3090  oxidoreductase protein  24.81 
 
 		 680 aa  103  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.725789 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  27.22 
 
 		 750 aa  103  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0620  twin-arginine translocation pathway signal  24 
 
 		 741 aa  102  2e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.390565  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2187  molybdopterin oxidoreductase  26.42 
 
 		 725 aa  102  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000199348  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  25.45 
 
 		 730 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0880  molybdopterin oxidoreductase family protein  27.29 
 
 		 671 aa  102  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.772127  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  26.16 
 
 		 698 aa  101  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  24.29 
 
 		 758 aa  101  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  24.46 
 
 		 758 aa  100  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  24.46 
 
 		 758 aa  100  8e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  24.46 
 
 		 758 aa  100  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4342  molydopterin dinucleotide-binding region  24.12 
 
 		 727 aa  100  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.303774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2235  thiosulfate reductase  24.11 
 
 		 758 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209797  normal  0.286987 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1130  molybdopterin oxidoreductase  25.53 
 
 		 727 aa  100  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3188  molybdopterin oxidoreductase  24.83 
 
 		 756 aa  99.8  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3106  molybdopterin oxidoreductase  26.14 
 
 		 698 aa  99  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  24.85 
 
 		 731 aa  99  3e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1907  molybdopterin oxidoreductase  26.41 
 
 		 794 aa  98.6  3e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1823  molybdopterin oxidoreductase  25.83 
 
 		 726 aa  98.2  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320306  normal  0.908332 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0643  molybdopterin oxidoreductase  24.3 
 
 		 866 aa  98.6  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0442  molybdopterin oxidoreductase  26.95 
 
 		 688 aa  98.6  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284657  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1217  molybdopterin oxidoreductase  28.36 
 
 		 666 aa  98.2  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.718553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3151  molybdopterin oxidoreductase  26.64 
 
 		 701 aa  97.8  6e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1721  molydopterin dinucleotide-binding region  26.92 
 
 		 753 aa  97.8  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.54844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0451  molybdopterin oxidoreductase  26.89 
 
 		 688 aa  97.8  6e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.097886  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  27.19 
 
 		 698 aa  97.8  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2338  molybdopterin oxidoreductase  24.31 
 
 		 729 aa  97.4  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>