More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0166 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0166  Formate dehydrogenase  100 
 
 
711 aa  1480    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00149305 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0895  Nitrate reductase  60.34 
 
 
711 aa  932    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.381214  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0171  molybdopterin oxidoreductase  59.41 
 
 
709 aa  915    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.662613  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  30.92 
 
 
722 aa  238  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  27.48 
 
 
730 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  30.07 
 
 
731 aa  219  2e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2813  molybdopterin oxidoreductase  29.33 
 
 
738 aa  219  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2632  molybdopterin oxidoreductase  29.18 
 
 
739 aa  204  4e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.348569  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0620  twin-arginine translocation pathway signal  28.19 
 
 
741 aa  203  9.999999999999999e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.390565  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2718  molybdopterin oxidoreductase  29.47 
 
 
737 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2562  formate dehydrogenase  28.02 
 
 
720 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  27.81 
 
 
760 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  27.55 
 
 
760 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  27.26 
 
 
760 aa  197  7e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  26.92 
 
 
764 aa  195  3e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  26.78 
 
 
764 aa  193  8e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  27.48 
 
 
764 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  26.71 
 
 
764 aa  192  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  27.53 
 
 
760 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  26.42 
 
 
729 aa  191  4e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2400  molybdopterin oxidoreductase  27.79 
 
 
738 aa  191  4e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0425196  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  27.06 
 
 
764 aa  191  5e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  26.7 
 
 
760 aa  191  5e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  26.39 
 
 
695 aa  190  8e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  27.73 
 
 
759 aa  189  2e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2338  molybdopterin oxidoreductase  28.66 
 
 
729 aa  189  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0265  molybdopterin oxidoreductase  26.09 
 
 
764 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.227459  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  25.03 
 
 
739 aa  185  3e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0912  molybdopterin oxidoreductase  26.41 
 
 
739 aa  182  2e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  26.44 
 
 
760 aa  182  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  26.99 
 
 
750 aa  182  2e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  26.49 
 
 
731 aa  181  5.999999999999999e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  26.03 
 
 
758 aa  180  9e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0389  response regulator receiver domain-containing protein  25.17 
 
 
757 aa  179  2e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.257769  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2386  molybdopterin oxidoreductase  25.66 
 
 
747 aa  177  5e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1904  molydopterin dinucleotide-binding region  25.6 
 
 
753 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0269  Nitrate reductase  25.63 
 
 
754 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0027  molybdenum enzyme related to thiosulfate reductase and polysulfide reductase, large subunit  26.33 
 
 
955 aa  176  1.9999999999999998e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0352248  normal  0.101653 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  26.41 
 
 
744 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1484  Nitrate reductase  27.25 
 
 
739 aa  174  5e-42  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1914  thiosulfate reductase  24.79 
 
 
761 aa  174  5.999999999999999e-42  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.527644  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1228  molybdopterin oxidoreductase  26.27 
 
 
843 aa  172  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  26.35 
 
 
698 aa  171  5e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2375  molybdopterin oxidoreductase  24.68 
 
 
747 aa  171  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01556  oxidoreductase subunit  25.51 
 
 
808 aa  169  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.56782  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01546  hypothetical protein  25.51 
 
 
808 aa  169  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.838194  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2296  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  25.44 
 
 
808 aa  169  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000246763 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1773  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  25.51 
 
 
808 aa  169  2e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2511  molybdopterin oxidoreductase  24.75 
 
 
776 aa  169  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1613  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  25.51 
 
 
808 aa  169  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0127  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  26.23 
 
 
799 aa  169  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2777  nitrate reductase  26.65 
 
 
731 aa  169  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2056  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  25.51 
 
 
808 aa  168  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1794  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  25.51 
 
 
808 aa  168  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1660  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  25.51 
 
 
808 aa  168  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2043  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  25.51 
 
 
808 aa  168  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1612  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  26.51 
 
 
820 aa  167  5e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  26.58 
 
 
936 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  26.13 
 
 
891 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1318  molybdopterin oxidoreductase  25.73 
 
 
695 aa  166  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.952277  hitchhiker  0.000256409 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2919  molybdopterin oxidoreductase  26.49 
 
 
733 aa  166  1.0000000000000001e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1003  molybdopterin oxidoreductase  26.07 
 
 
700 aa  165  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0447  molybdopterin oxidoreductase  25.15 
 
 
731 aa  164  4.0000000000000004e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  25.99 
 
 
711 aa  164  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1580  molybdopterin oxidoreductase  26.29 
 
 
694 aa  164  6e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0320  Formate dehydrogenase  24.58 
 
 
700 aa  164  6e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2794  molybdopterin oxidoreductase  25.52 
 
 
698 aa  162  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0362  molybdopterin oxidoreductase  26.63 
 
 
857 aa  162  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.196674  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  26.85 
 
 
747 aa  162  3e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0345  nitrate reductase  26.26 
 
 
731 aa  161  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213856  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0650  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  26.3 
 
 
759 aa  160  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0664  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  26.3 
 
 
759 aa  160  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7633  reductase  25.59 
 
 
708 aa  160  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2365  molybdopterin oxidoreductase  25.46 
 
 
777 aa  160  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1382  molybdopterin oxidoreductase  26 
 
 
678 aa  159  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0219675  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  25.88 
 
 
745 aa  159  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0769  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  26.3 
 
 
759 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.447962  normal  0.969632 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  25.03 
 
 
812 aa  159  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0723  molybdopterin-containing oxidoreductase catalytic subunit  26.16 
 
 
759 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4651  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.89 
 
 
809 aa  158  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00741112  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1029  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.29 
 
 
814 aa  158  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1063  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.44 
 
 
814 aa  158  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0105709  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4700  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.89 
 
 
809 aa  158  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1078  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.44 
 
 
814 aa  158  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.965114 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.44 
 
 
814 aa  158  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0998  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  26.23 
 
 
814 aa  158  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.181006  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2563  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  25.58 
 
 
794 aa  158  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000909986  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4560  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.89 
 
 
809 aa  157  5.0000000000000005e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.949615 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0442  molybdopterin oxidoreductase  25.18 
 
 
731 aa  157  5.0000000000000005e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4568  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.75 
 
 
809 aa  157  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4651  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.75 
 
 
809 aa  157  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0188549  normal  0.28896 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  26.03 
 
 
745 aa  157  9e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  23.8 
 
 
758 aa  157  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  23.94 
 
 
758 aa  157  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1907  molybdopterin oxidoreductase  26.12 
 
 
794 aa  157  9e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  23.8 
 
 
758 aa  157  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2605  twin-arginine translocation pathway signal  27.98 
 
 
879 aa  156  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1810  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  26.14 
 
 
730 aa  156  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0056  molydopterin dinucleotide-binding region  24.58 
 
 
951 aa  156  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  23.8 
 
 
758 aa  156  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>