More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0271 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0271  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 688 aa  1389    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0737341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2933  molybdopterin oxidoreductase, molybdopterin-binding subunit, putative  46.05 
 
 		 689 aa  585  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3391  molybdopterin oxidoreductase  45.56 
 
 		 686 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2689  molybdopterin oxidoreductase  43.39 
 
 		 691 aa  532  1e-150  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0572937 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2269  molybdopterin oxidoreductase  42.75 
 
 		 691 aa  528  1e-149  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.737839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2547  molybdopterin oxidoreductase  34.99 
 
 		 711 aa  343  5e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00181061  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0610  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  30.14 
 
 		 804 aa  284  4.0000000000000003e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.124465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1810  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  28.21 
 
 		 730 aa  190  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2777  nitrate reductase  27.05 
 
 		 731 aa  188  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0106  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  27.62 
 
 		 966 aa  147  8.000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00863778 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0125  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  26.46 
 
 		 966 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4918  Trimethylamine-N-oxide reductase (cytochrome c)  23.64 
 
 		 668 aa  106  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000514285  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0353  formate dehydrogenase  26.57 
 
 		 833 aa  106  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000992334  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2187  molybdopterin oxidoreductase  23.82 
 
 		 725 aa  105  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000199348  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1921  molybdopterin oxidoreductase  21.55 
 
 		 669 aa  104  5e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2236  formate dehydrogenase  21.42 
 
 		 726 aa  103  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2919  molybdopterin oxidoreductase  23.93 
 
 		 733 aa  101  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  25.46 
 
 		 722 aa  101  5e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2551  molybdopterin oxidoreductase, iron-sulfur binding subunit  25.46 
 
 		 920 aa  100  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  26.29 
 
 		 760 aa  100  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0216  molybdopterin oxidoreductase  25.49 
 
 		 837 aa  98.2  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  24.66 
 
 		 695 aa  96.7  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03498  Anaerobic dehydrogenase  22.83 
 
 		 729 aa  95.1  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2276  molybdopterin oxidoreductase  24.62 
 
 		 807 aa  94.7  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0442  molybdopterin oxidoreductase  26.1 
 
 		 731 aa  94  8e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1990  molybdopterin oxidoreductase  23.91 
 
 		 743 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3826  molybdopterin oxidoreductase  23.25 
 
 		 854 aa  92.4  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185272  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2341  molybdopterin oxidoreductase  23.25 
 
 		 854 aa  92.4  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.064973  normal  0.0429388 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2055  formate dehydrogenase  23.14 
 
 		 733 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  22.02 
 
 		 739 aa  92.4  3e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0447  molybdopterin oxidoreductase  26.18 
 
 		 731 aa  92  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  24.21 
 
 		 758 aa  91.7  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  26.02 
 
 		 731 aa  91.7  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  25.38 
 
 		 764 aa  91.7  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2605  twin-arginine translocation pathway signal  25.96 
 
 		 879 aa  91.3  6e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  25.71 
 
 		 760 aa  90.5  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  25.19 
 
 		 764 aa  90.5  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.62 
 
 		 688 aa  90.5  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1228  molybdopterin oxidoreductase  24.75 
 
 		 843 aa  89.7  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  25.85 
 
 		 764 aa  89.4  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2009  formate dehydrogenase  23.21 
 
 		 715 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  26.14 
 
 		 936 aa  89.4  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 		 764 aa  89.4  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  24.64 
 
 		 760 aa  89  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  25.85 
 
 		 764 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0620  twin-arginine translocation pathway signal  21.69 
 
 		 741 aa  88.6  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.390565  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0643  formate dehydrogenase  24.51 
 
 		 764 aa  89  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1170  formate dehydrogenase  25.41 
 
 		 667 aa  88.2  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.894825  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  26.12 
 
 		 760 aa  87.4  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  23.65 
 
 		 760 aa  87.4  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  24.73 
 
 		 760 aa  87.4  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  23.23 
 
 		 758 aa  87  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1425  iron-sulfur binding oxidoreductase  24.85 
 
 		 962 aa  86.7  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  23.89 
 
 		 758 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2235  thiosulfate reductase  24.08 
 
 		 758 aa  86.3  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209797  normal  0.286987 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  23.89 
 
 		 758 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  23.89 
 
 		 758 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1217  molybdopterin oxidoreductase  26.23 
 
 		 666 aa  85.5  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.718553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2426  molybdopterin oxidoreductase  22.19 
 
 		 826 aa  85.5  0.000000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.242196 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2562  formate dehydrogenase  22.84 
 
 		 720 aa  85.5  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.47 
 
 		 685 aa  85.5  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3899  molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region  25.68 
 
 		 702 aa  85.1  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.945677 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0269  Nitrate reductase  22.59 
 
 		 754 aa  85.1  0.000000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2400  molybdopterin oxidoreductase  22.34 
 
 		 738 aa  85.1  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0425196  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1497  molydopterin dinucleotide-binding region  20.93 
 
 		 713 aa  84.3  0.000000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  27.86 
 
 		 744 aa  84  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  22.66 
 
 		 731 aa  84  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3340  molydopterin dinucleotide-binding region  25.24 
 
 		 702 aa  83.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.203215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02090  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  21.61 
 
 		 734 aa  82  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0643  molybdopterin oxidoreductase  23.68 
 
 		 866 aa  82.4  0.00000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2860  molybdopterin oxidoreductase  23.88 
 
 		 695 aa  81.6  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4162  oxidoreductase, molybdopterin-binding protein  25.28 
 
 		 732 aa  80.9  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1595  molybdopterin oxidoreductase, iron-sulfur binding subunit  23.97 
 
 		 984 aa  80.5  0.00000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1914  thiosulfate reductase  22.09 
 
 		 761 aa  80.1  0.0000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.527644  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0816  molybdopterin dinucleotide-binding region  24.38 
 
 		 732 aa  80.5  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1331  Formate dehydrogenase  25.22 
 
 		 667 aa  79.7  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  26.37 
 
 		 759 aa  79.3  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4342  molydopterin dinucleotide-binding region  21.56 
 
 		 727 aa  79.7  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.303774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1229  Formate dehydrogenase  25.22 
 
 		 667 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0387  molybdopterin oxidoreductase  24.66 
 
 		 879 aa  79  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2059  molybdopterin oxidoreductase  21.94 
 
 		 704 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0389  response regulator receiver domain-containing protein  21.79 
 
 		 757 aa  78.2  0.0000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.257769  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  21.4 
 
 		 698 aa  78.2  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18640  putative oxidoreductase  24.02 
 
 		 702 aa  78.2  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0882727 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3956  formate dehydrogenase  23.25 
 
 		 721 aa  77.4  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0923262  decreased coverage  0.00564803 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3153  molybdopterin oxidoreductase  23.53 
 
 		 689 aa  77.4  0.0000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  23.31 
 
 		 666 aa  76.6  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2925  molydopterin dinucleotide-binding region  23.58 
 
 		 691 aa  76.6  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3548  molybdopterin oxidoreductase  21.43 
 
 		 673 aa  77  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1109  molydopterin dinucleotide-binding region  25.92 
 
 		 702 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2390  molybdopterin oxidoreductase  23.16 
 
 		 709 aa  77  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.479736  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3942  formate dehydrogenase  23.02 
 
 		 721 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4016  formate dehydrogenase  23.02 
 
 		 721 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2565  molybdopterin oxidoreductase  23.82 
 
 		 747 aa  76.6  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0260966 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1613  putative oxidoreductase  24.54 
 
 		 702 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0713  molybdopterin oxidoreductase  23.89 
 
 		 668 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4442  molydopterin dinucleotide-binding region  23.86 
 
 		 720 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.510451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  21.71 
 
 		 917 aa  75.5  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2413  molybdopterin oxidoreductase, iron-sulfur binding subunit  25.93 
 
 		 1087 aa  75.1  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.220952  normal  0.47173 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1855  molybdopterin oxidoreductase  23.41 
 
 		 527 aa  74.3  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>