More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1855 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  58.56 
 
 		 898 aa  638    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  58.97 
 
 		 899 aa  638    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1855  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 		 527 aa  1097    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0846  molybdopterin oxidoreductase  54.94 
 
 		 527 aa  621  1e-177  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2706  formate dehydrogenase, alpha subunit  54.94 
 
 		 541 aa  618  1e-176  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  54.94 
 
 		 900 aa  604  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  54.86 
 
 		 893 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  54.18 
 
 		 917 aa  601  1e-170  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0786  formate dehydrogenase alpha subunit  53.77 
 
 		 529 aa  597  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  53.42 
 
 		 904 aa  595  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  55.13 
 
 		 893 aa  593  1e-168  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.86 
 
 		 893 aa  590  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.85 
 
 		 900 aa  584  1.0000000000000001e-165  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1028  putative formate dehydrogenase alpha subunit  53.41 
 
 		 536 aa  578  1e-164  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1795  molybdopterin oxidoreductase  53.22 
 
 		 526 aa  577  1.0000000000000001e-163  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  51.89 
 
 		 901 aa  573  1.0000000000000001e-162  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0473  formate dehydrogenase, chain A  52.84 
 
 		 581 aa  570  1e-161  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1830  putative formate dehydrogenase alpha subunit  53.6 
 
 		 536 aa  569  1e-161  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  51.87 
 
 		 687 aa  561  1e-158  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2945  molybdopterin oxidoreductase  51.9 
 
 		 542 aa  560  1e-158  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.381249 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.66 
 
 		 677 aa  543  1e-153  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.25 
 
 		 676 aa  543  1e-153  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.76 
 
 		 920 aa  543  1e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.06 
 
 		 676 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  50.27 
 
 		 745 aa  541  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.93 
 
 		 688 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  50.28 
 
 		 695 aa  537  1e-151  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  51.63 
 
 		 886 aa  533  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.88 
 
 		 688 aa  533  1e-150  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.68 
 
 		 676 aa  534  1e-150  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.11 
 
 		 879 aa  531  1e-149  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.93 
 
 		 911 aa  528  1e-148  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.06 
 
 		 674 aa  526  1e-148  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.57 
 
 		 686 aa  522  1e-147  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0031  molybdopterin oxidoreductase  49.34 
 
 		 528 aa  523  1e-147  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.116629  normal  0.760475 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  47.49 
 
 		 689 aa  518  1e-146  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.87 
 
 		 688 aa  521  1e-146  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.57 
 
 		 906 aa  521  1e-146  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  48.7 
 
 		 687 aa  519  1e-146  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.04 
 
 		 688 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.11 
 
 		 674 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.3 
 
 		 674 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.74 
 
 		 674 aa  511  1e-143  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.74 
 
 		 689 aa  510  1e-143  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.57 
 
 		 1425 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1545  molybdopterin oxidoreductase  46.59 
 
 		 527 aa  504  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.21 
 
 		 905 aa  503  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.08 
 
 		 1410 aa  502  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.57 
 
 		 1421 aa  502  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.2 
 
 		 1425 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.39 
 
 		 1425 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.86 
 
 		 668 aa  499  1e-140  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.98 
 
 		 1440 aa  501  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.74 
 
 		 685 aa  499  1e-140  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.11 
 
 		 1428 aa  497  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.3 
 
 		 1424 aa  497  1e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3198  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.3 
 
 		 1432 aa  497  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.554904 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2249  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.93 
 
 		 903 aa  498  1e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.580662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0825  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.93 
 
 		 1432 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541451 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  47.44 
 
 		 1387 aa  488  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.24 
 
 		 1406 aa  487  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.69 
 
 		 1440 aa  486  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.37 
 
 		 1432 aa  487  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  47.25 
 
 		 1412 aa  483  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  46.69 
 
 		 1385 aa  484  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2576  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.94 
 
 		 925 aa  480  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1038  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.98 
 
 		 1130 aa  476  1e-133  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2021  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.28 
 
 		 686 aa  476  1e-133  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.463591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2805  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.7 
 
 		 945 aa  478  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3479  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.61 
 
 		 946 aa  476  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.389807 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4119  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.78 
 
 		 754 aa  474  1e-132  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0031  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.38 
 
 		 1000 aa  472  1e-132  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.28 
 
 		 1426 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0555  formate dehydrogenase subunit alpha  45.91 
 
 		 957 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.358497 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1708  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.54 
 
 		 959 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0619  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.69 
 
 		 956 aa  467  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.961077  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4746  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.73 
 
 		 1111 aa  466  9.999999999999999e-131  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.879601  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2185  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.54 
 
 		 960 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.602321  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1391  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.32 
 
 		 947 aa  463  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4651  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.54 
 
 		 937 aa  462  1e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3552  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.13 
 
 		 960 aa  462  1e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1809  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.17 
 
 		 960 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.550904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0389  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.57 
 
 		 944 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3926  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.7 
 
 		 924 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8358  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.87 
 
 		 988 aa  455  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2058  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.02 
 
 		 967 aa  456  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.896651  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4578  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.69 
 
 		 723 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0907  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.57 
 
 		 983 aa  455  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.979482  decreased coverage  0.00925571 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5226  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.87 
 
 		 988 aa  455  1e-127  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.24763  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2513  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.14 
 
 		 927 aa  455  1e-127  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0190469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4160  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.11 
 
 		 1110 aa  457  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.129392  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0727  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.05 
 
 		 979 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0216931  normal  0.398444 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2366  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.63 
 
 		 983 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.739285 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0967  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.13 
 
 		 984 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4144  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.26 
 
 		 983 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6171  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.62 
 
 		 989 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.796652 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2023  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.23 
 
 		 685 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0303762  normal  0.701303 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0180  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.13 
 
 		 984 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0964  NAD-dependent formate dehydrogenase, alpha subunit  44.61 
 
 		 982 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2595  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.13 
 
 		 984 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.619743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>