More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0473 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0473  formate dehydrogenase, chain A  100 
 
 		 581 aa  1188    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0786  formate dehydrogenase alpha subunit  56.71 
 
 		 529 aa  615  1e-175  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2706  formate dehydrogenase, alpha subunit  55.17 
 
 		 541 aa  613  9.999999999999999e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0100  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.68 
 
 		 893 aa  602  1.0000000000000001e-171  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000102152  hitchhiker  0.000000000000206048 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1795  molybdopterin oxidoreductase  56.44 
 
 		 526 aa  600  1e-170  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.727225 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3520  formate dehydrogenase, alpha subunit  53.62 
 
 		 904 aa  596  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  51.02 
 
 		 893 aa  592  1e-168  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.04 
 
 		 893 aa  588  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2312  formate dehydrogenase subunit alpha  54.36 
 
 		 899 aa  584  1.0000000000000001e-165  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0386  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.92 
 
 		 917 aa  581  1e-164  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.28 
 
 		 900 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1028  putative formate dehydrogenase alpha subunit  50.93 
 
 		 536 aa  576  1.0000000000000001e-163  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2945  molybdopterin oxidoreductase  51.21 
 
 		 542 aa  568  1e-161  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.381249 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0846  molybdopterin oxidoreductase  53.77 
 
 		 527 aa  567  1e-160  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1855  molybdopterin oxidoreductase  52.84 
 
 		 527 aa  565  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1830  putative formate dehydrogenase alpha subunit  49.63 
 
 		 536 aa  562  1.0000000000000001e-159  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.43 
 
 		 677 aa  560  1e-158  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.54 
 
 		 901 aa  559  1e-158  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.91 
 
 		 879 aa  561  1e-158  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0814  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.82 
 
 		 676 aa  556  1e-157  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1137  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.27 
 
 		 676 aa  556  1e-157  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0704  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.09 
 
 		 900 aa  555  1e-157  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0608  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.62 
 
 		 674 aa  553  1e-156  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0915  formate dehydrogenase, alpha subunit  50.83 
 
 		 920 aa  552  1e-156  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1538  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.91 
 
 		 676 aa  554  1e-156  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2193  formate dehydrogenase subunit alpha  49.12 
 
 		 745 aa  548  1e-155  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.571777  normal  0.536023 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1376  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.17 
 
 		 674 aa  550  1e-155  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0754319  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0295  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.17 
 
 		 674 aa  546  1e-154  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0587435  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0543  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.99 
 
 		 674 aa  545  1e-153  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.16552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0156  formate dehydrogenase, alpha subunit  51.47 
 
 		 898 aa  541  1e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3509  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.52 
 
 		 905 aa  541  1e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.434543  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1381  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.73 
 
 		 688 aa  536  1e-151  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1624  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.63 
 
 		 687 aa  533  1e-150  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0578  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.64 
 
 		 686 aa  535  1e-150  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0413343  normal  0.361775 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1545  molybdopterin oxidoreductase  49.34 
 
 		 527 aa  529  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1561  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  49.73 
 
 		 695 aa  530  1e-149  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0463  formate dehydrogenase, alpha subunit (F420)  47.91 
 
 		 689 aa  528  1e-148  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3238  molydopterin dinucleotide-binding region  48.09 
 
 		 687 aa  525  1e-148  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0973988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0167  formate dehydrogenase, alpha subunit  51.12 
 
 		 886 aa  526  1e-148  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0530728  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00220  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.24 
 
 		 906 aa  523  1e-147  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0797991 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3051  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.57 
 
 		 1424 aa  520  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0398  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  49.26 
 
 		 1385 aa  521  1e-146  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25280  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.87 
 
 		 911 aa  520  1e-146  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0556633 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0871  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.36 
 
 		 1425 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.510403  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1813  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.73 
 
 		 688 aa  521  1e-146  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3493  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.18 
 
 		 1425 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3616  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.36 
 
 		 1421 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3421  formate dehydrogenase, alpha subunit  48 
 
 		 1425 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0988  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.19 
 
 		 1428 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1379  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.64 
 
 		 688 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0754  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.81 
 
 		 1440 aa  513  1e-144  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3198  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.18 
 
 		 1432 aa  513  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.554904 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3298  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.36 
 
 		 1432 aa  514  1e-144  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2249  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.52 
 
 		 903 aa  508  1e-143  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.580662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0825  formate dehydrogenase, alpha subunit  48 
 
 		 1432 aa  509  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541451 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0031  molybdopterin oxidoreductase  47.46 
 
 		 528 aa  509  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.116629  normal  0.760475 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0809  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.82 
 
 		 1410 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0196  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.14 
 
 		 689 aa  499  1e-140  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.202612  hitchhiker  0.00634005 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0792  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.6 
 
 		 1406 aa  495  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1045  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.59 
 
 		 688 aa  495  9.999999999999999e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.77936  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0838  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.75 
 
 		 1440 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06362  oxidoreductase  45.89 
 
 		 1412 aa  485  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001399  formate dehydrogenase-O major subunit  44.95 
 
 		 1387 aa  483  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0389  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.26 
 
 		 944 aa  483  1e-135  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0720  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.18 
 
 		 949 aa  479  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4746  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.25 
 
 		 1111 aa  477  1e-133  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.879601  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4160  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.98 
 
 		 1110 aa  476  1e-133  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.129392  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4097  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.18 
 
 		 959 aa  474  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0913  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.01 
 
 		 668 aa  474  1e-132  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0805  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.69 
 
 		 948 aa  472  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.624345  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0324  formate dehydrogenase alpha subunit  42.83 
 
 		 713 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0724  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.05 
 
 		 948 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.696908  normal  0.792249 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0937  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.72 
 
 		 1426 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.137872  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3636  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.31 
 
 		 959 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.234983 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1391  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.8 
 
 		 947 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4645  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.04 
 
 		 948 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2366  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.57 
 
 		 983 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.739285 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2897  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.26 
 
 		 959 aa  463  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3089  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.51 
 
 		 959 aa  463  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4144  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.38 
 
 		 983 aa  465  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.110494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3710  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  41.1 
 
 		 977 aa  463  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.749683  normal  0.699855 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1622  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.85 
 
 		 984 aa  463  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.437101  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1038  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.96 
 
 		 1130 aa  464  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1753  formate dehydrogenase alpha subunit  42.47 
 
 		 716 aa  462  1e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0179443  hitchhiker  0.000996092 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0555  formate dehydrogenase subunit alpha  44.12 
 
 		 957 aa  462  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.358497 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2750  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.24 
 
 		 969 aa  462  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0453604 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4869  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.92 
 
 		 950 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0187329 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2058  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.09 
 
 		 967 aa  461  9.999999999999999e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.896651  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2274  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.78 
 
 		 956 aa  461  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.217783 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1708  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.14 
 
 		 959 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0619  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.57 
 
 		 956 aa  460  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.961077  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3012  NAD-dependent formate dehydrogenase alpha subunit  44.67 
 
 		 984 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.467116  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3925  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.99 
 
 		 959 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1781  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.19 
 
 		 716 aa  459  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4578  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.57 
 
 		 723 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4406  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.1 
 
 		 950 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0623  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.06 
 
 		 948 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.816724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2902  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.49 
 
 		 984 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.679741  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0967  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.3 
 
 		 984 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0990  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.46 
 
 		 983 aa  455  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.656443 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>