More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_0610 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_0610  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  100 
 
 
804 aa  1641    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.124465  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2547  molybdopterin oxidoreductase  39.17 
 
 
711 aa  374  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00181061  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2933  molybdopterin oxidoreductase, molybdopterin-binding subunit, putative  28.59 
 
 
689 aa  297  6e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3391  molybdopterin oxidoreductase  30.36 
 
 
686 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1810  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  29.48 
 
 
730 aa  267  7e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2777  nitrate reductase  28.9 
 
 
731 aa  266  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2269  molybdopterin oxidoreductase  32.21 
 
 
691 aa  248  3e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.737839  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2689  molybdopterin oxidoreductase  31.43 
 
 
691 aa  244  5e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0572937 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0353  formate dehydrogenase  27.31 
 
 
833 aa  235  3e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000992334  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0216  molybdopterin oxidoreductase  26.69 
 
 
837 aa  231  5e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2341  molybdopterin oxidoreductase  27.43 
 
 
854 aa  225  2e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.064973  normal  0.0429388 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3826  molybdopterin oxidoreductase  27.43 
 
 
854 aa  225  2e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185272  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0271  molybdopterin oxidoreductase  32.72 
 
 
688 aa  216  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0737341  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  26.99 
 
 
722 aa  203  9e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  29.43 
 
 
760 aa  200  7e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2426  molybdopterin oxidoreductase  26.13 
 
 
826 aa  197  5.000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.242196 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  26.34 
 
 
760 aa  196  1e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  26.51 
 
 
760 aa  196  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1228  molybdopterin oxidoreductase  24.91 
 
 
843 aa  193  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  26.72 
 
 
764 aa  191  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  26.71 
 
 
760 aa  190  8e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  24.94 
 
 
758 aa  190  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  26.37 
 
 
764 aa  189  2e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  26.67 
 
 
764 aa  189  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2139  molybdopterin oxidoreductase  27.07 
 
 
739 aa  187  9e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.113571  normal  0.495973 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  26.08 
 
 
760 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  26.24 
 
 
764 aa  185  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  25.81 
 
 
764 aa  185  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  26.2 
 
 
760 aa  183  1e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  25.61 
 
 
750 aa  179  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2605  twin-arginine translocation pathway signal  25.62 
 
 
879 aa  177  9e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  25.19 
 
 
745 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  25.1 
 
 
729 aa  174  7.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0643  molybdopterin oxidoreductase  23.92 
 
 
866 aa  173  1e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0470  molybdopterin oxidoreductase  24.59 
 
 
855 aa  172  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3188  molybdopterin oxidoreductase  25.57 
 
 
756 aa  171  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1149  molybdopterin oxidoreductase  24.84 
 
 
856 aa  170  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000213682  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0387  molybdopterin oxidoreductase  25.62 
 
 
879 aa  169  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  24.68 
 
 
758 aa  165  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1914  thiosulfate reductase  23.69 
 
 
761 aa  165  3e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.527644  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2919  molybdopterin oxidoreductase  27.63 
 
 
733 aa  165  3e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2436  molybdopterin oxidoreductase  26.16 
 
 
936 aa  164  7e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.982452  normal  0.336779 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0269  Nitrate reductase  23.69 
 
 
754 aa  163  1e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2400  molybdopterin oxidoreductase  26.07 
 
 
738 aa  162  2e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0425196  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2235  thiosulfate reductase  24.42 
 
 
758 aa  162  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209797  normal  0.286987 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  24.56 
 
 
758 aa  162  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0389  response regulator receiver domain-containing protein  23.93 
 
 
757 aa  161  4e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.257769  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  24.42 
 
 
758 aa  161  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2562  formate dehydrogenase  25.64 
 
 
720 aa  161  4e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  24.42 
 
 
758 aa  161  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0313  molybdopterin oxidoreductase  25.2 
 
 
698 aa  160  9e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.16634  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0447  molybdopterin oxidoreductase  27.59 
 
 
731 aa  159  2e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  25.38 
 
 
731 aa  159  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2276  molybdopterin oxidoreductase  23.14 
 
 
807 aa  159  3e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3287  molybdopterin oxidoreductase  24.48 
 
 
695 aa  157  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  24.8 
 
 
730 aa  155  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1886  molybdopterin oxidoreductase  24.43 
 
 
747 aa  154  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2718  molybdopterin oxidoreductase  27.5 
 
 
737 aa  154  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2813  molybdopterin oxidoreductase  26.12 
 
 
738 aa  154  8e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0190  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.49 
 
 
685 aa  154  8.999999999999999e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0912  molybdopterin oxidoreductase  24.66 
 
 
739 aa  152  3e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0265  molybdopterin oxidoreductase  22.64 
 
 
764 aa  152  3e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.227459  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  27.79 
 
 
744 aa  152  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2386  molybdopterin oxidoreductase  24.73 
 
 
747 aa  149  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0620  twin-arginine translocation pathway signal  24.54 
 
 
741 aa  148  4.0000000000000006e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.390565  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  24.6 
 
 
731 aa  148  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1880  Formate dehydrogenase  24.56 
 
 
744 aa  147  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0340  putative molybdopterin oxidoreductase family protein  25.08 
 
 
969 aa  146  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  25.93 
 
 
759 aa  146  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3153  molybdopterin oxidoreductase  24.76 
 
 
689 aa  147  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1921  molybdopterin oxidoreductase  23.5 
 
 
669 aa  146  2e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2632  molybdopterin oxidoreductase  27.02 
 
 
739 aa  146  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.348569  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  25.17 
 
 
812 aa  145  3e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1484  Nitrate reductase  25.62 
 
 
739 aa  144  6e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0899  Formate dehydrogenase  23.81 
 
 
756 aa  144  6e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0895  Nitrate reductase  26.1 
 
 
711 aa  143  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.381214  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0442  molybdopterin oxidoreductase  24.71 
 
 
731 aa  141  4.999999999999999e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02090  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  24.47 
 
 
734 aa  140  8.999999999999999e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1646  molybdopterin oxidoreductase  25.76 
 
 
807 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165657  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3503  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.37 
 
 
900 aa  139  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1398  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.78 
 
 
893 aa  139  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1350  molybdopterin oxidoreductase  25.03 
 
 
711 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000109078  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3507  formate dehydrogenase, alpha subunit  23.52 
 
 
893 aa  138  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2511  molybdopterin oxidoreductase  23.56 
 
 
776 aa  138  5e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1628  molybdopterin oxidoreductase  24.9 
 
 
691 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1345  molybdopterin oxidoreductase  24.76 
 
 
666 aa  135  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1285  formate dehydrogenase  24.19 
 
 
676 aa  134  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2859  oxidoreductase protein  25.84 
 
 
698 aa  134  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2338  molybdopterin oxidoreductase  23.23 
 
 
729 aa  134  7.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3557  anaerobic dehydrogenase  24.61 
 
 
691 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0779594  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1509  Formate dehydrogenase  26.47 
 
 
732 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2227  molybdopterin oxidoreductase  23.86 
 
 
891 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178988  hitchhiker  0.00000402166 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3564  molybdopterin oxidoreductase  24.61 
 
 
691 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.297731  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3538  molybdopterin oxidoreductase  24.61 
 
 
691 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0808  formate dehydrogenase, alpha subunit  25.37 
 
 
879 aa  132  2.0000000000000002e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2741  molybdopterin oxidoreductase  25.61 
 
 
698 aa  132  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0180049  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2563  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  24.09 
 
 
794 aa  132  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000909986  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2860  molybdopterin oxidoreductase  24.52 
 
 
695 aa  132  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  24.9 
 
 
1143 aa  131  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1581  aminotransferase, class V  24.09 
 
 
1135 aa  130  7.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.863454  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>