More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3094 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_3094  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
858 aa  1790    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.799457  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0619  molybdopterin oxidoreductase  29.75 
 
 
911 aa  316  9.999999999999999e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2959  molybdopterin oxidoreductase  28.29 
 
 
913 aa  266  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.791344  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1560  molybdopterin oxidoreductase  27.01 
 
 
917 aa  264  4e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.444202 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0199  molybdopterin oxidoreductase  27.09 
 
 
917 aa  258  3e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2453  molybdopterin oxidoreductase  27.92 
 
 
909 aa  254  5.000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154365  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1507  molybdopterin oxidoreductase  26.2 
 
 
915 aa  250  7e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.498476  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0353  formate dehydrogenase  26.98 
 
 
833 aa  243  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.000992334  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0570  DMSO reductase chain A  26.55 
 
 
958 aa  222  1.9999999999999999e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.345051  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1228  molybdopterin oxidoreductase  27.51 
 
 
843 aa  218  5.9999999999999996e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1675  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  25.54 
 
 
974 aa  216  9.999999999999999e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0144  Nitrate reductase  25.84 
 
 
968 aa  213  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0216  molybdopterin oxidoreductase  25.84 
 
 
837 aa  209  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1936  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  25.86 
 
 
973 aa  207  5e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3996  molybdopterin oxidoreductase  25.51 
 
 
979 aa  207  7e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290267  normal  0.0213209 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0860  molybdopterin oxidoreductase family protein  25.78 
 
 
981 aa  207  9e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2605  twin-arginine translocation pathway signal  25.31 
 
 
879 aa  205  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0340  putative molybdopterin oxidoreductase family protein  25.24 
 
 
969 aa  203  9e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2426  molybdopterin oxidoreductase  27.17 
 
 
826 aa  203  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.242196 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6214  molybdopterin oxidoreductase  25.61 
 
 
978 aa  201  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492261  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1801  molybdopterin oxidoreductase  26.05 
 
 
961 aa  201  3.9999999999999996e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356497  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2646  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  26.06 
 
 
935 aa  201  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0950035  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  25.57 
 
 
764 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3815  molybdopterin oxidoreductase  25.13 
 
 
981 aa  199  1.0000000000000001e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  25.57 
 
 
764 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  25.57 
 
 
764 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0387  molybdopterin oxidoreductase  24.74 
 
 
879 aa  198  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0059  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  25.29 
 
 
953 aa  198  3e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1646  molybdopterin oxidoreductase  24.51 
 
 
807 aa  197  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165657  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0643  molybdopterin oxidoreductase  26.04 
 
 
866 aa  197  7e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  25.97 
 
 
760 aa  196  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2047  molybdopterin oxidoreductase family protein  25.55 
 
 
978 aa  194  4e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3221  molybdopterin oxidoreductase  25.65 
 
 
973 aa  195  4e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.461579  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1071  molybdopterin oxidoreductase family protein  25.55 
 
 
973 aa  194  5e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1356  molybdopterin oxidoreductase family protein  25.55 
 
 
973 aa  194  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2338  molybdopterin oxidoreductase  25.55 
 
 
973 aa  194  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.941239  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1445  molybdopterin oxidoreductase family protein  25.65 
 
 
978 aa  194  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4940  molybdopterin oxidoreductase  25 
 
 
974 aa  194  7e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.335021 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3106  molybdopterin oxidoreductase  25.65 
 
 
973 aa  194  8e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1743  molybdopterin oxidoreductase  24.79 
 
 
974 aa  193  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.216268  normal  0.286341 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1197  molybdopterin oxidoreductase  24.84 
 
 
934 aa  192  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  25.27 
 
 
760 aa  192  2e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2341  molybdopterin oxidoreductase  24.42 
 
 
854 aa  191  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.064973  normal  0.0429388 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3826  molybdopterin oxidoreductase  24.42 
 
 
854 aa  191  5.999999999999999e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.185272  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2304  molybdopterin oxidoreductase  25.03 
 
 
803 aa  190  8e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0470  molybdopterin oxidoreductase  24.86 
 
 
855 aa  190  9e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4524  molybdopterin oxidoreductase  25.31 
 
 
978 aa  189  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.556057 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  25 
 
 
764 aa  188  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  24.91 
 
 
760 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1567  molybdopterin oxidoreductase  23.69 
 
 
803 aa  185  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1238  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  25.17 
 
 
928 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389489  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  26.02 
 
 
760 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  24.54 
 
 
764 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3188  molybdopterin oxidoreductase  25.5 
 
 
756 aa  183  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2001  molybdopterin oxidoreductase  28.29 
 
 
978 aa  178  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.754637  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0389  response regulator receiver domain-containing protein  24.53 
 
 
757 aa  178  5e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.257769  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1164  Formate dehydrogenase  24.49 
 
 
730 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.589725  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4198  molybdopterin oxidoreductase  23.77 
 
 
1155 aa  175  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.676689 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1443  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 protein  25.54 
 
 
932 aa  175  3.9999999999999995e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  25.77 
 
 
758 aa  174  5e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  24.89 
 
 
760 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0682  hypothetical protein  24.15 
 
 
731 aa  173  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.968625  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1149  molybdopterin oxidoreductase  25.08 
 
 
856 aa  173  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000213682  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4227  molybdopterin oxidoreductase  25.31 
 
 
817 aa  171  6e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0767  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  24.95 
 
 
923 aa  171  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0265  molybdopterin oxidoreductase  23.68 
 
 
764 aa  170  1e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.227459  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1999  twin-arginine translocation pathway signal  24.94 
 
 
760 aa  168  4e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  26.26 
 
 
812 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  23.5 
 
 
731 aa  163  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0269  Nitrate reductase  24.15 
 
 
754 aa  162  3e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  24.41 
 
 
759 aa  161  5e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2188  thiosulfate reductase  24.83 
 
 
758 aa  161  6e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3287  molybdopterin oxidoreductase  26.04 
 
 
781 aa  160  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.239512  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2401  thiosulfate reductase  24.83 
 
 
758 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  0.834836 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2288  thiosulfate reductase  24.83 
 
 
758 aa  159  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00880607  normal  0.0980362 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2242  thiosulfate reductase  24.83 
 
 
758 aa  159  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.1266  normal  0.627013 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2235  thiosulfate reductase  24.85 
 
 
758 aa  157  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.209797  normal  0.286987 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1869  molybdopterin oxidoreductase  31.4 
 
 
800 aa  157  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0325829 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22240  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  22.72 
 
 
836 aa  155  2.9999999999999998e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.17201 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1914  thiosulfate reductase  22.36 
 
 
761 aa  155  4e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.527644  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1629  molybdopterin oxidoreductase  23.46 
 
 
789 aa  154  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0353  molybdopterin oxidoreductase  25.41 
 
 
805 aa  154  5e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.127927 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3636  molybdopterin oxidoreductase  24.31 
 
 
765 aa  152  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000159575 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2374  Nitrate reductase  22.29 
 
 
821 aa  151  5e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.037868  normal  0.51028 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2042  twin-arginine translocation pathway signal  28.91 
 
 
930 aa  151  7e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.607166  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2338  molybdopterin oxidoreductase  23.9 
 
 
729 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0162  molybdopterin oxidoreductase  25.38 
 
 
805 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2919  molybdopterin oxidoreductase  28.16 
 
 
733 aa  146  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5761  ferredoxin:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:molybdopterin oxidoreductase:molydopterin dinucleotide-binding region:molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region:oxidoreductase FAD-binding region  22.43 
 
 
1142 aa  145  4e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1500  molybdopterin oxidoreductase  26.22 
 
 
856 aa  144  7e-33  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000790574 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0620  twin-arginine translocation pathway signal  24.6 
 
 
741 aa  144  9e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.390565  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02507  hypothetical protein  23.08 
 
 
815 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6878  molybdopterin oxidoreductase  21.33 
 
 
1148 aa  142  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0354139  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4361  molybdopterin dinucleotide-binding region  23.26 
 
 
1138 aa  142  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0607  molydopterin dinucleotide-binding region  24.48 
 
 
910 aa  140  7e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.408169 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0938  molybdopterin oxidoreductase  23.35 
 
 
817 aa  141  7e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0255421  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1056  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  23.63 
 
 
814 aa  140  7.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  25.22 
 
 
722 aa  140  8.999999999999999e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2813  molybdopterin oxidoreductase  23.88 
 
 
738 aa  140  1e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2226  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  23.63 
 
 
814 aa  139  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.982689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>