More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1500 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010525  Tneu_0353  molybdopterin oxidoreductase  60.46 
 
 
805 aa  1025    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.127927 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  58.64 
 
 
812 aa  976    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0162  molybdopterin oxidoreductase  60.83 
 
 
805 aa  1029    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1500  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
856 aa  1752    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000790574 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0938  molybdopterin oxidoreductase  76.12 
 
 
817 aa  1300    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0255421  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1335  molybdopterin oxidoreductase  29.08 
 
 
928 aa  250  8e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.374333  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1863  molybdopterin oxidoreductase  27.43 
 
 
932 aa  245  3e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0307  molybdopterin oxidoreductase  27.34 
 
 
938 aa  241  5.999999999999999e-62  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000512628  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1646  molybdopterin oxidoreductase  28.37 
 
 
807 aa  239  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165657  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2042  twin-arginine translocation pathway signal  28.41 
 
 
930 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.607166  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3177  polysulfide reductase, subunit A  27.89 
 
 
760 aa  231  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0442  molybdopterin oxidoreductase  27.55 
 
 
731 aa  230  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2304  molybdopterin oxidoreductase  29.03 
 
 
803 aa  229  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0954  twin-arginine translocation pathway signal  28.15 
 
 
927 aa  223  9e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.323124  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1567  molybdopterin oxidoreductase  27.44 
 
 
803 aa  221  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3287  molybdopterin oxidoreductase  28.76 
 
 
781 aa  221  6e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.239512  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0447  molybdopterin oxidoreductase  28.36 
 
 
731 aa  220  7e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0389  response regulator receiver domain-containing protein  27.22 
 
 
757 aa  220  7e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.257769  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2919  molybdopterin oxidoreductase  29.06 
 
 
733 aa  220  8.999999999999998e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0265  molybdopterin oxidoreductase  27 
 
 
764 aa  213  1e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.227459  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0266  molybdopterin oxidoreductase  29.98 
 
 
1065 aa  213  1e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1869  molybdopterin oxidoreductase  27.95 
 
 
800 aa  213  1e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0325829 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1466  molybdopterin oxidoreductase  24.82 
 
 
731 aa  213  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1835  molybdopterin oxidoreductase  25.93 
 
 
916 aa  211  3e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.357483  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1847  molybdopterin oxidoreductase  30.53 
 
 
1058 aa  211  4e-53  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.758609 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2177  sulfur reductase, molybdopterin subunit  25.96 
 
 
909 aa  211  6e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4062  polysulfide reductase, subunit A  26.53 
 
 
760 aa  209  2e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0608  molybdopterin oxidoreductase  26.44 
 
 
760 aa  207  6e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.714014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0507  twin-arginine translocation pathway signal  25.95 
 
 
764 aa  207  7e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0559  molybdopterin oxidoreductase  26.49 
 
 
760 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3444  twin-arginine translocation pathway signal  26.19 
 
 
764 aa  206  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2405  molybdopterin oxidoreductase  26.54 
 
 
804 aa  204  6e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0154144  normal  0.420011 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1629  molybdopterin oxidoreductase  27.06 
 
 
789 aa  204  7e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0531  molybdopterin oxidoreductase  26.45 
 
 
764 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3619  molybdopterin oxidoreductase  26 
 
 
764 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0555  molybdopterin oxidoreductase  25.88 
 
 
764 aa  202  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02420  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  27.22 
 
 
824 aa  201  6e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4198  molybdopterin oxidoreductase  26.96 
 
 
1155 aa  200  9e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.676689 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2276  molybdopterin oxidoreductase  25.53 
 
 
807 aa  196  1e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02110  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  26.08 
 
 
806 aa  196  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.292195  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3039  molybdopterin oxidoreductase  25.83 
 
 
758 aa  196  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1197  molybdopterin oxidoreductase  24.92 
 
 
934 aa  194  5e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0925  molybdopterin oxidoreductase  27.77 
 
 
1062 aa  193  1e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1914  thiosulfate reductase  27.91 
 
 
761 aa  192  2e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.527644  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1508  molybdopterin oxidoreductase  29.77 
 
 
1058 aa  190  9e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000115937 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2056  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  26.56 
 
 
808 aa  189  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1773  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  26.45 
 
 
808 aa  189  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4227  molybdopterin oxidoreductase  24.65 
 
 
817 aa  189  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1613  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  26.99 
 
 
808 aa  189  2e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1908  molybdopterin oxidoreductase  26.69 
 
 
876 aa  188  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2043  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  26.45 
 
 
808 aa  188  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2055  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  26.5 
 
 
798 aa  188  4e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01557  oxidoreductase subunit  26.5 
 
 
807 aa  187  6e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.405121  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2042  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  26.5 
 
 
807 aa  187  6e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1661  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  26.5 
 
 
807 aa  187  6e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1795  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  26.5 
 
 
807 aa  187  6e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.725278  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01547  hypothetical protein  26.5 
 
 
807 aa  187  6e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.475009  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0059  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  28.38 
 
 
953 aa  187  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2297  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  26.38 
 
 
798 aa  186  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000563804 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6878  molybdopterin oxidoreductase  30.12 
 
 
1148 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0354139  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2922  molybdopterin oxidoreductase  27.04 
 
 
777 aa  185  4.0000000000000006e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.811962  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3471  molybdopterin oxidoreductase  28.06 
 
 
778 aa  182  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22240  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  28.03 
 
 
836 aa  182  2.9999999999999997e-44  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.17201 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01556  oxidoreductase subunit  26.92 
 
 
808 aa  181  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.56782  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2255  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  26.05 
 
 
814 aa  181  4.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848686  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01546  hypothetical protein  26.92 
 
 
808 aa  181  4.999999999999999e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.838194  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1794  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  26.45 
 
 
808 aa  181  7e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0340  putative molybdopterin oxidoreductase family protein  28.29 
 
 
969 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1660  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  26.87 
 
 
808 aa  180  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1668  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  25.6 
 
 
811 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1841  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  25.95 
 
 
811 aa  179  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1687  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  25.95 
 
 
817 aa  178  3e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914371  normal  0.111557 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1674  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  25.71 
 
 
811 aa  177  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.666152  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1600  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  25.71 
 
 
811 aa  178  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573894  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3221  molybdopterin oxidoreductase  25.23 
 
 
973 aa  178  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.461579  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2682  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  25.57 
 
 
792 aa  177  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2769  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  25.57 
 
 
792 aa  177  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2296  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  26.52 
 
 
808 aa  177  6e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000246763 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1609  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  25.71 
 
 
811 aa  177  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.356497  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0290  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  25.66 
 
 
781 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00528785  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2563  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  25.15 
 
 
794 aa  177  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000909986  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1356  molybdopterin oxidoreductase family protein  25.14 
 
 
973 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3106  molybdopterin oxidoreductase  25.14 
 
 
973 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2338  molybdopterin oxidoreductase  25.14 
 
 
973 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.941239  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2047  molybdopterin oxidoreductase family protein  25.26 
 
 
978 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1445  molybdopterin oxidoreductase family protein  25.14 
 
 
978 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2900  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  25.45 
 
 
792 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.735186  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2788  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  25.45 
 
 
792 aa  176  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2725  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  25.45 
 
 
792 aa  174  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1071  molybdopterin oxidoreductase family protein  25.03 
 
 
973 aa  174  7.999999999999999e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0607  molydopterin dinucleotide-binding region  27.12 
 
 
910 aa  174  7.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.408169 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0479  molybdopterin oxidoreductase  25.65 
 
 
784 aa  172  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0450  formate dehydrogenase  36.49 
 
 
722 aa  172  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1801  molybdopterin oxidoreductase  25.12 
 
 
961 aa  172  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356497  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1774  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  26.11 
 
 
752 aa  171  5e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4940  molybdopterin oxidoreductase  25.09 
 
 
974 aa  171  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.335021 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0422  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  25.77 
 
 
806 aa  170  1e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0580651  decreased coverage  0.000000000595111 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00898  dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit A  25.53 
 
 
814 aa  169  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0778088  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2749  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  25.53 
 
 
814 aa  169  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2702  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  25.53 
 
 
814 aa  169  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.98868 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>