More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1069 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C1517  tetrathionate reductase complex subunit A  64.17 
 
 
1020 aa  1343    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108438 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1069  molydopterin dinucleotide-binding region  100 
 
 
1027 aa  2111    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345727 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3679  molydopterin dinucleotide-binding region  50.87 
 
 
1035 aa  1041    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4785  molydopterin dinucleotide-binding region  37.03 
 
 
1031 aa  664    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3736  molydopterin dinucleotide-binding region  50.87 
 
 
1035 aa  1042    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003032  tetrathionate reductase subunit A  51.56 
 
 
1030 aa  1105    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1741  putative tetrathionate reductase, subunit A  49.13 
 
 
1038 aa  962    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3862  molydopterin dinucleotide-binding region  50.87 
 
 
1035 aa  1039    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1799  molydopterin dinucleotide-binding region  41.3 
 
 
1011 aa  687    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1959  molydopterin dinucleotide domain-containing protein  64.07 
 
 
1020 aa  1341    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000210512 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1480  tetrathionate reductase complex subunit A  63.97 
 
 
1020 aa  1340    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.263704 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0897  tetrathionate reductase, subunit A  54 
 
 
1029 aa  1205    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797102  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0633  molydopterin dinucleotide-binding region  50.67 
 
 
1035 aa  1031    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0100143 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1788  tetrathionate reductase complex, subunit A  64.07 
 
 
1020 aa  1341    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0633  molydopterin dinucleotide-binding region  50.58 
 
 
1035 aa  1040    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0126499 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4246  molydopterin dinucleotide-binding region  51.91 
 
 
1066 aa  1016    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.146983 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0917  molybdopterin oxidoreductase  40.67 
 
 
1022 aa  783    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.2527  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1423  molydopterin dinucleotide-binding region  50.49 
 
 
1064 aa  1011    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.658184  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2424  molydopterin dinucleotide-binding region  50.2 
 
 
1064 aa  1004    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.375347  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0589  molydopterin dinucleotide-binding region  50.53 
 
 
1036 aa  1029    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1496  tetrathionate reductase complex, subunit A  64.17 
 
 
1020 aa  1343    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000946391 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0662  molybdopterin oxidoreductase  50.48 
 
 
1035 aa  1027    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2089  orotate phosphoribosyltransferase (oprt; oprtase)  41.04 
 
 
996 aa  723    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0216873  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3982  molydopterin dinucleotide-binding region  36.03 
 
 
1026 aa  625  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3243  molydopterin dinucleotide-binding region  35.36 
 
 
1024 aa  611  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0245  molydopterin dinucleotide-binding region  34.82 
 
 
1012 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4208  molydopterin dinucleotide-binding region  35.07 
 
 
1012 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02584  hypothetical protein  31.57 
 
 
992 aa  480  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1197  molybdopterin oxidoreductase  32.1 
 
 
934 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3665  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  31.96 
 
 
1084 aa  442  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.120548  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0267  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  29.48 
 
 
1070 aa  395  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0101  molybdopterin oxidoreductase  29.17 
 
 
1033 aa  388  1e-106  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_111  molybdopterin oxidoreductase, large chain  29.55 
 
 
1070 aa  389  1e-106  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0477  molybdopterin oxidoreductase  28.53 
 
 
1074 aa  375  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0452  molydopterin dinucleotide-binding region  28.86 
 
 
1087 aa  337  5e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0389  molydopterin dinucleotide-binding region  27.74 
 
 
1173 aa  333  7.000000000000001e-90  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1675  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  23.97 
 
 
974 aa  150  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0767  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  24.2 
 
 
923 aa  149  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1238  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  23.53 
 
 
928 aa  141  4.999999999999999e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389489  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0059  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  23.19 
 
 
953 aa  140  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0860  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.52 
 
 
981 aa  136  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1936  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  23.38 
 
 
973 aa  133  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2646  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  23.98 
 
 
935 aa  131  7.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0950035  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1500  molybdopterin oxidoreductase  26.61 
 
 
856 aa  130  1.0000000000000001e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000790574 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0340  putative molybdopterin oxidoreductase family protein  23.71 
 
 
969 aa  130  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3815  molybdopterin oxidoreductase  24.07 
 
 
981 aa  129  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6214  molybdopterin oxidoreductase  25.07 
 
 
978 aa  129  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492261  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  25 
 
 
812 aa  124  7e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2001  molybdopterin oxidoreductase  24.62 
 
 
978 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.754637  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0938  molybdopterin oxidoreductase  24.91 
 
 
817 aa  123  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0255421  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1443  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 protein  22.5 
 
 
932 aa  122  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4524  molybdopterin oxidoreductase  23.94 
 
 
978 aa  122  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.556057 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0144  Nitrate reductase  22.21 
 
 
968 aa  120  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1445  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.25 
 
 
978 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1071  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.25 
 
 
973 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3996  molybdopterin oxidoreductase  23.79 
 
 
979 aa  120  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290267  normal  0.0213209 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3221  molybdopterin oxidoreductase  24.25 
 
 
973 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.461579  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3106  molybdopterin oxidoreductase  24.25 
 
 
973 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2047  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.25 
 
 
978 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1356  molybdopterin oxidoreductase family protein  24.25 
 
 
973 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2338  molybdopterin oxidoreductase  24.25 
 
 
973 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.941239  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1743  molybdopterin oxidoreductase  24.35 
 
 
974 aa  119  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.216268  normal  0.286341 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4940  molybdopterin oxidoreductase  23.82 
 
 
974 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.335021 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1801  molybdopterin oxidoreductase  22.59 
 
 
961 aa  117  2.0000000000000002e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356497  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0570  DMSO reductase chain A  22.18 
 
 
958 aa  114  7.000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.345051  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1560  molybdopterin oxidoreductase  22.62 
 
 
917 aa  112  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.444202 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0607  molydopterin dinucleotide-binding region  23.79 
 
 
910 aa  107  9e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.408169 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0162  molybdopterin oxidoreductase  25.05 
 
 
805 aa  107  1e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1020  molydopterin dinucleotide-binding region  23.27 
 
 
977 aa  106  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.961186  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0027  molybdenum enzyme related to thiosulfate reductase and polysulfide reductase, large subunit  26.78 
 
 
955 aa  105  3e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0352248  normal  0.101653 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0056  molydopterin dinucleotide-binding region  24.75 
 
 
951 aa  104  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0353  molybdopterin oxidoreductase  24.5 
 
 
805 aa  102  3e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.127927 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0035  molydopterin dinucleotide-binding region  26.1 
 
 
953 aa  102  5e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.813982  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22240  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  24.12 
 
 
836 aa  100  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.17201 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1964  molybdenum enzyme related to thiosulfate reductase and polysulfide reductase, large subunit  25.08 
 
 
952 aa  100  2e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.664709  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0120  formate dehydrogenase  25.42 
 
 
953 aa  99.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2768  molydopterin dinucleotide-binding region  24.2 
 
 
898 aa  96.3  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.81742  normal  0.229258 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1903  molybdopterin oxidoreductase  26.98 
 
 
1027 aa  96.3  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.960765  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20860  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  23.39 
 
 
942 aa  94.7  8e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3094  molybdopterin oxidoreductase  21.68 
 
 
858 aa  93.6  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.799457  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0511  molydopterin dinucleotide-binding region  22.22 
 
 
994 aa  89.4  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0709241  normal  0.262694 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0112  molybdopterin oxidoreductase  22.32 
 
 
971 aa  88.6  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.101891  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3188  molybdopterin oxidoreductase  27.71 
 
 
756 aa  87.8  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2173  nitrate reductase  24.12 
 
 
1016 aa  87.4  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000388509 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1634  molybdopterin oxidoreductase  27.27 
 
 
1087 aa  87  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4227  molybdopterin oxidoreductase  22.24 
 
 
817 aa  85.1  0.000000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1793  formate dehydrogenase  21.07 
 
 
1014 aa  84.7  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.546724  normal  0.0478269 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0024  DMSO reductase family type II enzyme, molybdopterin subunit  23.7 
 
 
951 aa  84.7  0.000000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1443  molybdopterin oxidoreductase  25.9 
 
 
729 aa  83.6  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1335  DMSO reductase family type II enzyme, molybdopterin subunit  21.27 
 
 
996 aa  84  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17920  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  20.26 
 
 
826 aa  83.6  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.194946  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1612  molydopterin dinucleotide-binding region  22.44 
 
 
967 aa  83.2  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05080  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  22.28 
 
 
857 aa  82.4  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02420  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  24.08 
 
 
824 aa  80.9  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1175  molydopterin dinucleotide-binding region  21.68 
 
 
962 aa  80.5  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000509072  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2934  formate dehydrogenase  23.05 
 
 
953 aa  79.7  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0307  molybdopterin oxidoreductase  21.11 
 
 
938 aa  79  0.0000000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000512628  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1181  molybdopterin oxidoreductase  22.05 
 
 
1073 aa  78.2  0.0000000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1847  molybdopterin oxidoreductase  25.89 
 
 
1058 aa  78.2  0.0000000000007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.758609 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1166  formate dehydrogenase  27.83 
 
 
750 aa  77.8  0.0000000000009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>