More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0477 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0101  molybdopterin oxidoreductase  48.84 
 
 
1033 aa  996    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0477  molybdopterin oxidoreductase  100 
 
 
1074 aa  2233    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_111  molybdopterin oxidoreductase, large chain  47.87 
 
 
1070 aa  1019    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3665  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  50.05 
 
 
1084 aa  1046    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.120548  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0267  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  47.31 
 
 
1070 aa  1016    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1197  molybdopterin oxidoreductase  35.87 
 
 
934 aa  622  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0452  molydopterin dinucleotide-binding region  33.1 
 
 
1087 aa  478  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02584  hypothetical protein  29.48 
 
 
992 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1741  putative tetrathionate reductase, subunit A  30.5 
 
 
1038 aa  410  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0917  molybdopterin oxidoreductase  29.99 
 
 
1022 aa  405  1e-111  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.2527  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1788  tetrathionate reductase complex, subunit A  30.19 
 
 
1020 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1517  tetrathionate reductase complex subunit A  30.28 
 
 
1020 aa  405  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000108438 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1959  molydopterin dinucleotide domain-containing protein  30.28 
 
 
1020 aa  404  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000210512 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1496  tetrathionate reductase complex, subunit A  30.28 
 
 
1020 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000000946391 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1480  tetrathionate reductase complex subunit A  30.19 
 
 
1020 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.263704 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4785  molydopterin dinucleotide-binding region  28.84 
 
 
1031 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1799  molydopterin dinucleotide-binding region  31.06 
 
 
1011 aa  397  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0897  tetrathionate reductase, subunit A  29.18 
 
 
1029 aa  390  1e-107  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797102  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1423  molydopterin dinucleotide-binding region  28.92 
 
 
1064 aa  372  1e-101  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.658184  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1069  molydopterin dinucleotide-binding region  28.16 
 
 
1027 aa  366  1e-99  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00345727 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2424  molydopterin dinucleotide-binding region  28.54 
 
 
1064 aa  365  3e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.375347  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003032  tetrathionate reductase subunit A  27.99 
 
 
1030 aa  361  3e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4246  molydopterin dinucleotide-binding region  29.14 
 
 
1066 aa  361  4e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.146983 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0633  molydopterin dinucleotide-binding region  26.98 
 
 
1035 aa  333  1e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0126499 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0389  molydopterin dinucleotide-binding region  26.24 
 
 
1173 aa  328  3e-88  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3679  molydopterin dinucleotide-binding region  26.84 
 
 
1035 aa  324  5e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3736  molydopterin dinucleotide-binding region  27.03 
 
 
1035 aa  324  7e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0633  molydopterin dinucleotide-binding region  26.54 
 
 
1035 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0100143 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3862  molydopterin dinucleotide-binding region  26.93 
 
 
1035 aa  320  7.999999999999999e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0589  molydopterin dinucleotide-binding region  26.69 
 
 
1036 aa  319  2e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0662  molybdopterin oxidoreductase  26.68 
 
 
1035 aa  317  9.999999999999999e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2089  orotate phosphoribosyltransferase (oprt; oprtase)  26.93 
 
 
996 aa  315  2.9999999999999996e-84  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0216873  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4208  molydopterin dinucleotide-binding region  26.23 
 
 
1012 aa  270  8e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3243  molydopterin dinucleotide-binding region  25.73 
 
 
1024 aa  267  7e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0245  molydopterin dinucleotide-binding region  26.48 
 
 
1012 aa  266  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3982  molydopterin dinucleotide-binding region  25.5 
 
 
1026 aa  255  3e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0340  putative molybdopterin oxidoreductase family protein  22.45 
 
 
969 aa  124  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0059  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  22.26 
 
 
953 aa  120  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6214  molybdopterin oxidoreductase  22.96 
 
 
978 aa  119  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492261  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1500  molybdopterin oxidoreductase  27.53 
 
 
856 aa  119  3.9999999999999997e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000790574 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0938  molybdopterin oxidoreductase  27.83 
 
 
817 aa  118  5e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0255421  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2646  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  23.4 
 
 
935 aa  116  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0950035  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  26.36 
 
 
812 aa  110  2e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1675  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  21.14 
 
 
974 aa  109  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3374  formate dehydrogenase, alpha subunit  24.29 
 
 
1061 aa  109  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4047  molybdopterin oxidoreductase  24.35 
 
 
760 aa  108  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1914  thiosulfate reductase  24.41 
 
 
761 aa  104  9e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.527644  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0767  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  23.33 
 
 
923 aa  102  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1847  molybdopterin oxidoreductase  24.03 
 
 
1058 aa  100  1e-19  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.758609 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1445  molybdopterin oxidoreductase family protein  23.1 
 
 
978 aa  97.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3221  molybdopterin oxidoreductase  23.1 
 
 
973 aa  97.8  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.461579  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3106  molybdopterin oxidoreductase  23.1 
 
 
973 aa  97.4  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1071  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.36 
 
 
973 aa  97.1  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0059  molybdopterin oxidoreductase  25.26 
 
 
949 aa  96.3  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.65892  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2047  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.97 
 
 
978 aa  95.9  3e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1356  molybdopterin oxidoreductase family protein  22.36 
 
 
973 aa  96.3  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2338  molybdopterin oxidoreductase  22.36 
 
 
973 aa  96.3  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.941239  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2768  molydopterin dinucleotide-binding region  26.98 
 
 
898 aa  95.1  7e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.81742  normal  0.229258 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4198  molybdopterin oxidoreductase  25 
 
 
1155 aa  94.7  9e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.676689 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4421  molybdopterin oxidoreductase  24.74 
 
 
949 aa  94.4  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4940  molybdopterin oxidoreductase  21.8 
 
 
974 aa  93.6  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.335021 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0266  molybdopterin oxidoreductase  23.62 
 
 
1065 aa  93.2  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1936  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  22.51 
 
 
973 aa  92.8  3e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0337  molybdopterin oxidoreductase  25.13 
 
 
949 aa  92.8  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2001  molybdopterin oxidoreductase  22.61 
 
 
978 aa  91.7  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.754637  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4137  molybdopterin oxidoreductase  24.48 
 
 
949 aa  90.9  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003494  formate dehydrogenase-O major subunit  23.91 
 
 
951 aa  89.7  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1801  molybdopterin oxidoreductase  21.96 
 
 
961 aa  90.1  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356497  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0353  molybdopterin oxidoreductase  26.35 
 
 
805 aa  90.1  2e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.127927 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4524  molybdopterin oxidoreductase  22.16 
 
 
978 aa  89.7  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.556057 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2638  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.66 
 
 
1059 aa  89.7  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.409853 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4110  molybdopterin oxidoreductase  26.92 
 
 
744 aa  89  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220187  normal  0.43512 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4813  molybdopterin oxidoreductase  23.71 
 
 
949 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.517826 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0925  molybdopterin oxidoreductase  22.7 
 
 
1062 aa  86.7  0.000000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0144  Nitrate reductase  21.18 
 
 
968 aa  86.3  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0162  molybdopterin oxidoreductase  25.65 
 
 
805 aa  85.5  0.000000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0570  DMSO reductase chain A  20.49 
 
 
958 aa  85.1  0.000000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.345051  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1743  molybdopterin oxidoreductase  22.51 
 
 
974 aa  84.7  0.000000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.216268  normal  0.286341 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0633  molybdopterin oxidoreductase  35.29 
 
 
759 aa  85.1  0.000000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0644016 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3996  molybdopterin oxidoreductase  21.97 
 
 
979 aa  85.1  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290267  normal  0.0213209 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02278  hypothetical protein  23 
 
 
951 aa  84.7  0.000000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3815  molybdopterin oxidoreductase  21.88 
 
 
981 aa  84.3  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1228  molybdopterin oxidoreductase  24.1 
 
 
843 aa  83.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1318  molybdopterin oxidoreductase  26.3 
 
 
695 aa  83.6  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.952277  hitchhiker  0.000256409 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1443  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 protein  22.58 
 
 
932 aa  83.2  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4809  molybdopterin oxidoreductase  23.65 
 
 
951 aa  82  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.215861 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4227  molybdopterin oxidoreductase  23.08 
 
 
817 aa  80.5  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2304  molybdopterin oxidoreductase  21.83 
 
 
803 aa  80.9  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1560  molybdopterin oxidoreductase  22.07 
 
 
917 aa  80.5  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.444202 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4271  formate dehydrogenase, alpha subunit  21.79 
 
 
1016 aa  81.3  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.12828  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1453  formate dehydrogenase  22.67 
 
 
951 aa  81.3  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0860  molybdopterin oxidoreductase family protein  20.96 
 
 
981 aa  80.9  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4133  molybdopterin oxidoreductase  23.65 
 
 
951 aa  80.5  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.987786  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4417  molybdopterin oxidoreductase  23.39 
 
 
951 aa  80.5  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3709  molybdopterin oxidoreductase  24.74 
 
 
970 aa  79.3  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1684  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  25.13 
 
 
934 aa  79  0.0000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1955  formate dehydrogenase, alpha subunit  22.11 
 
 
1009 aa  79  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1567  molybdopterin oxidoreductase  24.11 
 
 
803 aa  78.2  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2605  twin-arginine translocation pathway signal  28.02 
 
 
879 aa  78.2  0.0000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.746738 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0935  molybdopterin oxidoreductase  24.47 
 
 
745 aa  77.8  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>