More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4271 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01432  formate dehydrogenase-N, alpha subunit, nitrate-inducible  40.98 
 
 		 1015 aa  763    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03779  formate dehydrogenase-O, major subunit  40.96 
 
 		 1016 aa  743    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4090  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.96 
 
 		 1016 aa  741    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1286  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.56 
 
 		 1015 aa  691    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0187  formate dehydrogenase, alpha subunit  36 
 
 		 993 aa  649    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125328  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0777  formate dehydrogenase, major subunit, selenocysteine-containing  44.01 
 
 		 1010 aa  835    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1210  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.34 
 
 		 1066 aa  724    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4280  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  40.96 
 
 		 1016 aa  743    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_176  molybdopterin oxidoreductase, formate dehydrogenase alpha subunit  36.39 
 
 		 993 aa  645    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000885934  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0101  selenium-containing formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit  40.06 
 
 		 1004 aa  718    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2259  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  38.55 
 
 		 1023 aa  715    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181302  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2267  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.37 
 
 		 802 aa  647    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4122  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  40.96 
 
 		 1016 aa  743    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3045  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.04 
 
 		 1015 aa  702    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.01 
 
 		 1004 aa  749    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3388  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.93 
 
 		 1010 aa  832    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1059  formate dehydrogenase alpha subunit  43.93 
 
 		 1010 aa  845    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.080154 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1427  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.42 
 
 		 1016 aa  686    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.50627  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0813  formate dehydrogenase alpha subunit  38.91 
 
 		 1014 aa  704    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0860  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.79 
 
 		 1039 aa  676    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2519  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.46 
 
 		 1016 aa  692    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1868  formate dehydrogenase, alpha subunit  51.61 
 
 		 1020 aa  1072    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3043  formate dehydrogenase  54.07 
 
 		 812 aa  863    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3810  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.22 
 
 		 1028 aa  733    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0707  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  38.11 
 
 		 1023 aa  711    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0555  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.55 
 
 		 1012 aa  721    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2088  formate dehydrogenase  52.14 
 
 		 812 aa  852    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.207847  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1750  formate dehydrogenase alpha subunit  38.37 
 
 		 1016 aa  690    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182445 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5276  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.33 
 
 		 1095 aa  661    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0226  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.83 
 
 		 1005 aa  728    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.174026  normal  0.0776388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3728  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.15 
 
 		 1063 aa  650    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0214561  normal  0.0673651 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0872  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.98 
 
 		 1096 aa  692    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0971  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.85 
 
 		 1011 aa  718    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.893461  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3261  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.98 
 
 		 1022 aa  706    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0454  formate dehydrogenase  52.95 
 
 		 816 aa  845    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0891729  normal  0.433565 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2662  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.85 
 
 		 1015 aa  696    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.613089  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0165  formate dehydrogenase alpha subunit  36.35 
 
 		 993 aa  647    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.410725  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03810  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.26 
 
 		 1018 aa  697    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3894  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.22 
 
 		 1028 aa  734    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0283  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.52 
 
 		 803 aa  675    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.105016  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19190  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.51 
 
 		 1100 aa  675    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.525812  normal  0.681395 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3374  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.38 
 
 		 1061 aa  785    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4271  formate dehydrogenase, alpha subunit  100 
 
 		 1016 aa  2104    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.12828  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0643  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.25 
 
 		 1012 aa  761    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0165738 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1955  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.28 
 
 		 1009 aa  820    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0646  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.88 
 
 		 1013 aa  769    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166325 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1580  formate dehydrogenase  44.03 
 
 		 808 aa  652    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2533  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.21 
 
 		 1010 aa  712    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11280  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.31 
 
 		 1058 aa  732    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.786 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0799  formate dehydrogenase  41.53 
 
 		 851 aa  638    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1825  formate dehydrogenase  67.11 
 
 		 808 aa  1151    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63605  formate dehydrogenase-O, major subunit  38.59 
 
 		 1026 aa  714    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1789  formate dehydrogenase, alpha subunit  51.61 
 
 		 1020 aa  1072    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1700  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  40.98 
 
 		 1015 aa  763    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.3444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3510  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.21 
 
 		 1015 aa  762    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.722583  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2089  formate dehydrogenase alpha subunit  40.54 
 
 		 1005 aa  721    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000081067 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1335  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.75 
 
 		 1015 aa  698    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3325  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.37 
 
 		 1023 aa  699    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.723924 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4123  molybdopterin oxidoreductase alpha subunit  40.96 
 
 		 1016 aa  743    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1557  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  40.89 
 
 		 1015 aa  761    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.468579  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0021  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.7 
 
 		 1084 aa  692    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.12847 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2183  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.89 
 
 		 1015 aa  761    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.668487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3770  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  40.72 
 
 		 1015 aa  747    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1217  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.17 
 
 		 1008 aa  704    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0663541 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1570  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.54 
 
 		 1014 aa  747    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0876  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.79 
 
 		 1096 aa  686    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0501  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.12 
 
 		 1012 aa  776    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.662776 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0761  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.83 
 
 		 1003 aa  738    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.109779  normal  0.059567 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2365  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.11 
 
 		 1005 aa  715    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.1698 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0099  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  41.01 
 
 		 1004 aa  749    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2638  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.7 
 
 		 1059 aa  815    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.409853 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4119  aerobic formate dehydrogenase subunit alpha  40.72 
 
 		 1015 aa  747    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0827  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.62 
 
 		 1050 aa  629  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.798346  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1575  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.36 
 
 		 842 aa  616  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2008  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.16 
 
 		 824 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.715291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3754  formate dehydrogenase alpha subunit  41.22 
 
 		 828 aa  606  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0105  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.46 
 
 		 794 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2173  formate dehydrogenase, alpha subunit  41 
 
 		 803 aa  602  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.309024  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2591  Formate dehydrogenase  40.1 
 
 		 780 aa  598  1e-169  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1655  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  40.76 
 
 		 803 aa  598  1e-169  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2054  formate dehydrogenase alpha subunit  41.42 
 
 		 803 aa  597  1e-169  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2553  formate dehydrogenase alpha subunit  39.61 
 
 		 821 aa  595  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5531  formate dehydrogenase subunit alpha  39.14 
 
 		 825 aa  590  1e-167  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0612  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.36 
 
 		 1118 aa  590  1e-167  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0438  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.49 
 
 		 796 aa  586  1e-166  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1114  formate dehydrogenase  40.33 
 
 		 811 aa  588  1e-166  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2863  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.26 
 
 		 824 aa  586  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.202456  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2698  formate dehydrogenase alpha subunit  39.37 
 
 		 820 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0102  formate dehydrogenase alpha subunit  40.87 
 
 		 794 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0097  formate dehydrogenase alpha subunit  40.75 
 
 		 794 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0036  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.97 
 
 		 804 aa  583  1.0000000000000001e-165  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0129417  normal  0.222699 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0084  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.86 
 
 		 803 aa  580  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0038  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.55 
 
 		 803 aa  580  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4085  formate dehydrogenase alpha subunit  40.86 
 
 		 804 aa  581  1e-164  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0662  formate dehydrogenase, alpha subunit  40 
 
 		 812 aa  579  1e-164  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.457174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1274  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.92 
 
 		 816 aa  580  1e-164  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0730  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.46 
 
 		 822 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4382  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  38.72 
 
 		 822 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2396  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  38.46 
 
 		 822 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3984  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.72 
 
 		 822 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>