More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1114 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01432  formate dehydrogenase-N, alpha subunit, nitrate-inducible  41.66 
 
 		 1015 aa  640    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03779  formate dehydrogenase-O, major subunit  41.34 
 
 		 1016 aa  640    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2173  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.78 
 
 		 803 aa  640    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.309024  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4090  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.34 
 
 		 1016 aa  639    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2008  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.17 
 
 		 824 aa  646    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.715291  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0777  formate dehydrogenase, major subunit, selenocysteine-containing  48.67 
 
 		 1010 aa  771    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1700  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  41.66 
 
 		 1015 aa  640    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.3444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2183  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.66 
 
 		 1015 aa  640    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.668487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1570  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.01 
 
 		 1014 aa  682    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4280  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  41.34 
 
 		 1016 aa  640    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3374  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.47 
 
 		 1061 aa  744    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1575  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.61 
 
 		 842 aa  745    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1059  formate dehydrogenase alpha subunit  48.19 
 
 		 1010 aa  763    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.080154 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0643  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.26 
 
 		 1012 aa  709    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0165738 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0717  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  43.68 
 
 		 798 aa  657    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0813  formate dehydrogenase alpha subunit  43.49 
 
 		 1014 aa  655    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3513  formate dehydrogenase alpha subunit  42.65 
 
 		 808 aa  670    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0971  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.83 
 
 		 1011 aa  671    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.893461  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3754  formate dehydrogenase alpha subunit  41.3 
 
 		 828 aa  643    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3810  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.83 
 
 		 1028 aa  636    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1114  formate dehydrogenase  100 
 
 		 811 aa  1689    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4119  aerobic formate dehydrogenase subunit alpha  41.84 
 
 		 1015 aa  639    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2267  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.61 
 
 		 802 aa  775    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1557  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  41.66 
 
 		 1015 aa  640    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.468579  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2591  Formate dehydrogenase  50.68 
 
 		 780 aa  847    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3388  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.49 
 
 		 1010 aa  770    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2533  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.95 
 
 		 1010 aa  676    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1217  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.75 
 
 		 1008 aa  642    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0663541 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1682  molydopterin dinucleotide-binding region  44.51 
 
 		 829 aa  676    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.373792 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1955  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.97 
 
 		 1009 aa  795    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4123  molybdopterin oxidoreductase alpha subunit  41.34 
 
 		 1016 aa  640    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1580  formate dehydrogenase  55.67 
 
 		 808 aa  937    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1334  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.35 
 
 		 840 aa  664    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0283  formate dehydrogenase, alpha subunit  64.37 
 
 		 803 aa  1102    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.105016  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0084  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.59 
 
 		 803 aa  638    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0799  formate dehydrogenase  47.74 
 
 		 851 aa  768    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4122  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  41.34 
 
 		 1016 aa  640    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2365  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.15 
 
 		 1005 aa  642    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.1698 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0036  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.3 
 
 		 804 aa  699    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0129417  normal  0.222699 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1274  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.28 
 
 		 816 aa  724    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3510  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.32 
 
 		 1015 aa  676    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.722583  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0038  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.84 
 
 		 803 aa  639    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21840  uncharacterized anaerobic dehydrogenase  45.23 
 
 		 835 aa  719    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0800968 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1655  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  41.66 
 
 		 803 aa  638    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3770  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  41.84 
 
 		 1015 aa  639    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2638  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.96 
 
 		 1059 aa  756    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.409853 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0501  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.76 
 
 		 1012 aa  647    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.662776 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0761  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.87 
 
 		 1003 aa  679    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.109779  normal  0.059567 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1210  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.13 
 
 		 1066 aa  634  1e-180  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4085  formate dehydrogenase alpha subunit  41.46 
 
 		 804 aa  634  1e-180  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3894  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.83 
 
 		 1028 aa  634  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0226  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.28 
 
 		 1005 aa  629  1e-179  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.174026  normal  0.0776388 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2863  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.8 
 
 		 824 aa  630  1e-179  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.202456  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11280  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.47 
 
 		 1058 aa  629  1e-179  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.786 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3325  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.03 
 
 		 1023 aa  622  1e-177  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.723924 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2519  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.58 
 
 		 1016 aa  619  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0102  formate dehydrogenase alpha subunit  42.25 
 
 		 794 aa  620  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0099  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  41.46 
 
 		 1004 aa  619  1e-176  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2054  formate dehydrogenase alpha subunit  40.34 
 
 		 803 aa  621  1e-176  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0101  selenium-containing formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit  42.2 
 
 		 1004 aa  618  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5531  formate dehydrogenase subunit alpha  41.62 
 
 		 825 aa  615  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.34 
 
 		 1004 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0105  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.22 
 
 		 794 aa  616  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0097  formate dehydrogenase alpha subunit  42.01 
 
 		 794 aa  618  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63605  formate dehydrogenase-O, major subunit  41.74 
 
 		 1026 aa  617  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1427  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.34 
 
 		 1016 aa  613  9.999999999999999e-175  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.50627  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0612  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.27 
 
 		 1118 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0862  molydopterin dinucleotide-binding region  39.66 
 
 		 861 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0520127 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1818  formate dehydrogenase alpha subunit  41.1 
 
 		 820 aa  609  1e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.266188 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0730  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.79 
 
 		 822 aa  609  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2396  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  39.79 
 
 		 822 aa  609  1e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2259  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  39.79 
 
 		 1023 aa  610  1e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181302  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2553  formate dehydrogenase alpha subunit  39.21 
 
 		 821 aa  609  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0438  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.88 
 
 		 796 aa  612  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3377  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.45 
 
 		 822 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365346  normal  0.791414 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2089  formate dehydrogenase alpha subunit  40.93 
 
 		 1005 aa  610  1e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000081067 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0860  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.98 
 
 		 1039 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2100  formate dehydrogenase alpha subunit  39.93 
 
 		 822 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3879  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.33 
 
 		 810 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.319379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0707  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  39.81 
 
 		 1023 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03810  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.34 
 
 		 1018 aa  603  1.0000000000000001e-171  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0646  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.11 
 
 		 1013 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166325 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3544  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.21 
 
 		 810 aa  605  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4382  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  40.09 
 
 		 822 aa  605  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3984  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.09 
 
 		 822 aa  605  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6560  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.17 
 
 		 809 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22445  normal  0.0150185 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4597  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.86 
 
 		 810 aa  604  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.654701  normal  0.94372 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0344  molybdopterin dinucleotide-binding region  38.94 
 
 		 905 aa  600  1e-170  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0662  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.94 
 
 		 812 aa  600  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.457174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0555  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.64 
 
 		 1012 aa  600  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2724  formate dehydrogenase  38.84 
 
 		 847 aa  600  1e-170  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.820534  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1092  formate dehydrogenase, alpha subunit  40 
 
 		 811 aa  600  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.525887 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5830  formate dehydrogenase  39.18 
 
 		 853 aa  596  1e-169  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.555184 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1825  formate dehydrogenase  41.51 
 
 		 808 aa  598  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0544  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.26 
 
 		 809 aa  595  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0932731 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0872  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.24 
 
 		 1096 aa  593  1e-168  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0523  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.43 
 
 		 821 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0532  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.43 
 
 		 809 aa  595  1e-168  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.170319  normal  0.968416 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2829  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.35 
 
 		 820 aa  594  1e-168  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.500302  normal  0.743867 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0876  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.6 
 
 		 1096 aa  594  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>