More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6560 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01432  formate dehydrogenase-N, alpha subunit, nitrate-inducible  61.31 
 
 		 1015 aa  1072    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03779  formate dehydrogenase-O, major subunit  64.48 
 
 		 1016 aa  1123    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2173  formate dehydrogenase, alpha subunit  61.31 
 
 		 803 aa  1072    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.309024  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4090  formate dehydrogenase, alpha subunit  64.48 
 
 		 1016 aa  1124    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0084  formate dehydrogenase, alpha subunit  65.76 
 
 		 803 aa  1136    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0283  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.75 
 
 		 803 aa  659    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.105016  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0777  formate dehydrogenase, major subunit, selenocysteine-containing  47.19 
 
 		 1010 aa  733    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1210  formate dehydrogenase, alpha subunit  64.07 
 
 		 1066 aa  1122    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0438  formate dehydrogenase, alpha subunit  55.06 
 
 		 796 aa  950    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1335  formate dehydrogenase, alpha subunit  62.75 
 
 		 1015 aa  1072    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0099  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  55.13 
 
 		 1004 aa  952    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0101  selenium-containing formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit  54.14 
 
 		 1004 aa  926    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1557  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  61.31 
 
 		 1015 aa  1071    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.468579  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1427  formate dehydrogenase, alpha subunit  61.31 
 
 		 1016 aa  1053    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.50627  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1818  formate dehydrogenase alpha subunit  72.15 
 
 		 820 aa  1259    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.266188 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2054  formate dehydrogenase alpha subunit  61.31 
 
 		 803 aa  1067    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0730  formate dehydrogenase, alpha subunit  83.09 
 
 		 822 aa  1452    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2698  formate dehydrogenase alpha subunit  68.64 
 
 		 820 aa  1187    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2100  formate dehydrogenase alpha subunit  83.7 
 
 		 822 aa  1454    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1059  formate dehydrogenase alpha subunit  46.09 
 
 		 1010 aa  717    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.080154 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0717  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  43.85 
 
 		 798 aa  647    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0813  formate dehydrogenase alpha subunit  43.05 
 
 		 1014 aa  654    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3513  formate dehydrogenase alpha subunit  42.6 
 
 		 808 aa  651    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1899  formate dehydrogenase alpha subunit  81.38 
 
 		 478 aa  842    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.275577  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1750  formate dehydrogenase alpha subunit  60.94 
 
 		 1016 aa  1053    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182445 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0105  formate dehydrogenase, alpha subunit  54.76 
 
 		 794 aa  950    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0707  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  83.46 
 
 		 1023 aa  1461    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2638  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.74 
 
 		 1059 aa  718    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.409853 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03810  formate dehydrogenase, alpha subunit  60.2 
 
 		 1018 aa  1035    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3754  formate dehydrogenase alpha subunit  62.53 
 
 		 828 aa  1111    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2533  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.41 
 
 		 1010 aa  645    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3388  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.03 
 
 		 1010 aa  709    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0662  formate dehydrogenase, alpha subunit  61.23 
 
 		 812 aa  1047    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.457174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1570  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.53 
 
 		 1014 aa  661    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3261  formate dehydrogenase, alpha subunit  69.68 
 
 		 1022 aa  1225    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3490  formate dehydrogenase, alpha subunit  69.43 
 
 		 808 aa  1215    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.657613  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2553  formate dehydrogenase alpha subunit  96.04 
 
 		 821 aa  1637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4119  aerobic formate dehydrogenase subunit alpha  64.73 
 
 		 1015 aa  1138    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4597  formate dehydrogenase, alpha subunit  83.21 
 
 		 810 aa  1447    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.654701  normal  0.94372 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3879  formate dehydrogenase, alpha subunit  84.07 
 
 		 810 aa  1462    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.319379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1217  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.92 
 
 		 1008 aa  646    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0663541 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2519  formate dehydrogenase, alpha subunit  61.56 
 
 		 1016 aa  1054    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1655  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  61.43 
 
 		 803 aa  1070    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6560  formate dehydrogenase, alpha subunit  100 
 
 		 809 aa  1691    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22445  normal  0.0150185 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4382  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  84.69 
 
 		 822 aa  1468    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1955  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.21 
 
 		 1009 aa  709    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1092  formate dehydrogenase, alpha subunit  60.69 
 
 		 811 aa  1041    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.525887 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0102  formate dehydrogenase alpha subunit  54.26 
 
 		 794 aa  926    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4518  formate dehydrogenase, alpha subunit  82.96 
 
 		 810 aa  1441    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3770  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  64.73 
 
 		 1015 aa  1138    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2183  formate dehydrogenase, alpha subunit  61.56 
 
 		 1015 aa  1077    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.668487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0097  formate dehydrogenase alpha subunit  54.14 
 
 		 794 aa  925    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3544  formate dehydrogenase, alpha subunit  84.69 
 
 		 810 aa  1469    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1580  formate dehydrogenase  42.46 
 
 		 808 aa  651    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4123  molybdopterin oxidoreductase alpha subunit  64.48 
 
 		 1016 aa  1123    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3374  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.54 
 
 		 1061 aa  664    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3325  formate dehydrogenase, alpha subunit  62.3 
 
 		 1023 aa  1066    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.723924 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5531  formate dehydrogenase subunit alpha  71.01 
 
 		 825 aa  1243    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2008  formate dehydrogenase, alpha subunit  66.71 
 
 		 824 aa  1165    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.715291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2662  formate dehydrogenase, alpha subunit  63.24 
 
 		 1015 aa  1078    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.613089  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3377  formate dehydrogenase, alpha subunit  84.07 
 
 		 822 aa  1462    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365346  normal  0.791414 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63605  formate dehydrogenase-O, major subunit  71.13 
 
 		 1026 aa  1246    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3984  formate dehydrogenase, alpha subunit  84.69 
 
 		 822 aa  1468    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3045  formate dehydrogenase, alpha subunit  60.77 
 
 		 1015 aa  1053    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2259  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  83.09 
 
 		 1023 aa  1457    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181302  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4122  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  64.48 
 
 		 1016 aa  1123    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0036  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.62 
 
 		 804 aa  689    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0129417  normal  0.222699 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1274  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.57 
 
 		 816 aa  691    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2396  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  83.09 
 
 		 822 aa  1452    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3810  formate dehydrogenase, alpha subunit  62.53 
 
 		 1028 aa  1108    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0544  formate dehydrogenase, alpha subunit  70.16 
 
 		 809 aa  1222    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0932731 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4280  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  64.73 
 
 		 1016 aa  1125    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3510  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.81 
 
 		 1015 aa  690    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.722583  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2089  formate dehydrogenase alpha subunit  55.75 
 
 		 1005 aa  959    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000081067 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1286  formate dehydrogenase, alpha subunit  62.13 
 
 		 1015 aa  1069    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0532  formate dehydrogenase, alpha subunit  69.42 
 
 		 809 aa  1207    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.170319  normal  0.968416 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0038  formate dehydrogenase, alpha subunit  64.73 
 
 		 803 aa  1135    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2267  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.21 
 
 		 802 aa  709    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2829  formate dehydrogenase, alpha subunit  58.89 
 
 		 820 aa  1023    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.500302  normal  0.743867 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4085  formate dehydrogenase alpha subunit  64.11 
 
 		 804 aa  1117    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1700  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  61.31 
 
 		 1015 aa  1071    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.3444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0523  formate dehydrogenase, alpha subunit  70.53 
 
 		 821 aa  1225    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1575  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.09 
 
 		 842 aa  715    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3894  formate dehydrogenase, alpha subunit  62.41 
 
 		 1028 aa  1103    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0501  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.74 
 
 		 1012 aa  644    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.662776 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0761  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.5 
 
 		 1003 aa  654    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.109779  normal  0.059567 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2365  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.48 
 
 		 1005 aa  637    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.1698 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  55.01 
 
 		 1004 aa  951    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0643  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.74 
 
 		 1012 aa  703    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0165738 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1692  formate dehydrogenase-O, major subunit  81.38 
 
 		 478 aa  842    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2863  formate dehydrogenase, alpha subunit  62.19 
 
 		 824 aa  1074    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.202456  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0971  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.68 
 
 		 1011 aa  634  1e-180  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.893461  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0799  formate dehydrogenase  40.76 
 
 		 851 aa  633  1e-180  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0226  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.27 
 
 		 1005 aa  627  1e-178  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.174026  normal  0.0776388 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2591  Formate dehydrogenase  39.8 
 
 		 780 aa  628  1e-178  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0646  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.07 
 
 		 1013 aa  627  1e-178  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166325 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1898  formate dehydrogenase-O, major subunit  85.63 
 
 		 339 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.364587  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1691  formate dehydrogenase, nitrate-inducible, major subunit  85.63 
 
 		 339 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21840  uncharacterized anaerobic dehydrogenase  39.95 
 
 		 835 aa  602  1.0000000000000001e-171  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0800968 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1114  formate dehydrogenase  39.17 
 
 		 811 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>