More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3510 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01432  formate dehydrogenase-N, alpha subunit, nitrate-inducible  44.92 
 
 		 1015 aa  878    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03779  formate dehydrogenase-O, major subunit  44.99 
 
 		 1016 aa  878    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4271  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.21 
 
 		 1016 aa  762    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.12828  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2173  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.45 
 
 		 803 aa  733    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.309024  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2008  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.97 
 
 		 824 aa  775    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.715291  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4090  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.99 
 
 		 1016 aa  876    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0187  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.61 
 
 		 993 aa  765    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125328  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0777  formate dehydrogenase, major subunit, selenocysteine-containing  50.05 
 
 		 1010 aa  1013    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1210  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.82 
 
 		 1066 aa  909    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2591  Formate dehydrogenase  44.57 
 
 		 780 aa  697    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0038  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.42 
 
 		 803 aa  739    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2267  formate dehydrogenase, alpha subunit  51.42 
 
 		 802 aa  854    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0101  selenium-containing formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit  45.3 
 
 		 1004 aa  854    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1335  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.98 
 
 		 1015 aa  820    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3325  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.91 
 
 		 1023 aa  804    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.723924 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0523  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.51 
 
 		 821 aa  686    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1818  formate dehydrogenase alpha subunit  45.2 
 
 		 820 aa  716    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.266188 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0084  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.37 
 
 		 803 aa  739    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4122  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  44.99 
 
 		 1016 aa  878    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1580  formate dehydrogenase  45.81 
 
 		 808 aa  707    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0730  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.14 
 
 		 822 aa  710    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2698  formate dehydrogenase alpha subunit  44.46 
 
 		 820 aa  686    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2100  formate dehydrogenase alpha subunit  44.42 
 
 		 822 aa  694    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1059  formate dehydrogenase alpha subunit  49.08 
 
 		 1010 aa  1010    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.080154 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0717  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  56.37 
 
 		 798 aa  956    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0813  formate dehydrogenase alpha subunit  50.78 
 
 		 1014 aa  1052    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2396  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  45.14 
 
 		 822 aa  710    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3513  formate dehydrogenase alpha subunit  54.51 
 
 		 808 aa  927    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.21 
 
 		 1004 aa  847    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0876  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.67 
 
 		 1096 aa  741    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3374  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.94 
 
 		 1061 aa  1151    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0707  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  42.98 
 
 		 1023 aa  832    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2662  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.07 
 
 		 1015 aa  827    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.613089  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1286  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.77 
 
 		 1015 aa  832    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3754  formate dehydrogenase alpha subunit  46.88 
 
 		 828 aa  739    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3810  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.24 
 
 		 1028 aa  872    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1575  formate dehydrogenase, alpha subunit  55.7 
 
 		 842 aa  958    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4085  formate dehydrogenase alpha subunit  46.57 
 
 		 804 aa  726    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1092  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.03 
 
 		 811 aa  647    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.525887 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1789  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.36 
 
 		 1020 aa  758    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0662  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.72 
 
 		 812 aa  656    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.457174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0646  formate dehydrogenase, alpha subunit  53.05 
 
 		 1013 aa  1085    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166325 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2533  formate dehydrogenase, alpha subunit  53.24 
 
 		 1010 aa  1099    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0165  formate dehydrogenase alpha subunit  42.16 
 
 		 993 aa  782    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.410725  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0544  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.31 
 
 		 809 aa  676    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0932731 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2553  formate dehydrogenase alpha subunit  44.28 
 
 		 821 aa  699    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4119  aerobic formate dehydrogenase subunit alpha  46.07 
 
 		 1015 aa  888    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1868  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.36 
 
 		 1020 aa  758    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0105  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.2 
 
 		 794 aa  708    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2519  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.97 
 
 		 1016 aa  846    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0555  formate dehydrogenase, alpha subunit  53.48 
 
 		 1012 aa  1059    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3879  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.54 
 
 		 810 aa  684    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.319379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1700  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  45.11 
 
 		 1015 aa  881    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.3444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4382  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  44.66 
 
 		 822 aa  700    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3894  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.24 
 
 		 1028 aa  871    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1427  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.82 
 
 		 1016 aa  838    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.50627  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3261  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.76 
 
 		 1022 aa  847    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3388  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.98 
 
 		 1010 aa  1015    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0102  formate dehydrogenase alpha subunit  46.57 
 
 		 794 aa  719    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0872  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.8 
 
 		 1096 aa  748    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3770  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  46.07 
 
 		 1015 aa  888    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0097  formate dehydrogenase alpha subunit  46.69 
 
 		 794 aa  720    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6560  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.81 
 
 		 809 aa  690    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22445  normal  0.0150185 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0532  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.33 
 
 		 809 aa  664    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.170319  normal  0.968416 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2638  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.85 
 
 		 1059 aa  1145    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.409853 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0099  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  44.11 
 
 		 1004 aa  845    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4280  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  44.8 
 
 		 1016 aa  877    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1750  formate dehydrogenase alpha subunit  43.85 
 
 		 1016 aa  825    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182445 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0799  formate dehydrogenase  44.82 
 
 		 851 aa  717    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1955  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.95 
 
 		 1009 aa  1030    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3377  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.62 
 
 		 822 aa  695    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365346  normal  0.791414 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63605  formate dehydrogenase-O, major subunit  45.34 
 
 		 1026 aa  852    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3984  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.66 
 
 		 822 aa  700    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2259  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  43.08 
 
 		 1023 aa  835    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181302  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2054  formate dehydrogenase alpha subunit  46 
 
 		 803 aa  713    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0438  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.47 
 
 		 796 aa  693    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0643  formate dehydrogenase, alpha subunit  66.67 
 
 		 1012 aa  1441    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0165738 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0036  formate dehydrogenase, alpha subunit  79.48 
 
 		 804 aa  1395    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0129417  normal  0.222699 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5531  formate dehydrogenase subunit alpha  46.89 
 
 		 825 aa  718    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1274  formate dehydrogenase, alpha subunit  62.01 
 
 		 816 aa  1075    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1655  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  46.32 
 
 		 803 aa  731    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3510  formate dehydrogenase, alpha subunit  100 
 
 		 1015 aa  2112    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.722583  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2089  formate dehydrogenase alpha subunit  45 
 
 		 1005 aa  861    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000081067 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4518  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.35 
 
 		 810 aa  656    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03810  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.47 
 
 		 1018 aa  831    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1334  formate dehydrogenase, alpha subunit  54.87 
 
 		 840 aa  931    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1114  formate dehydrogenase  44.32 
 
 		 811 aa  676    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2829  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.93 
 
 		 820 aa  669    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.500302  normal  0.743867 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3490  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.3 
 
 		 808 aa  679    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.657613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2863  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.27 
 
 		 824 aa  693    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.202456  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2183  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.11 
 
 		 1015 aa  883    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.668487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3544  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.76 
 
 		 810 aa  688    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4597  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.12 
 
 		 810 aa  689    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.654701  normal  0.94372 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0827  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.78 
 
 		 1050 aa  728    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.798346  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0501  formate dehydrogenase, alpha subunit  54.03 
 
 		 1012 aa  1130    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.662776 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0761  formate dehydrogenase, alpha subunit  53.19 
 
 		 1003 aa  1091    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.109779  normal  0.059567 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2365  formate dehydrogenase, alpha subunit  55.77 
 
 		 1005 aa  1154    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.1698 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0021  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.37 
 
 		 1084 aa  715    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.12847 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1557  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  45.01 
 
 		 1015 aa  880    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.468579  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4123  molybdopterin oxidoreductase alpha subunit  44.99 
 
 		 1016 aa  878    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>