More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0438 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01432  formate dehydrogenase-N, alpha subunit, nitrate-inducible  61.24 
 
 		 1015 aa  1045    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03779  formate dehydrogenase-O, major subunit  60 
 
 		 1016 aa  1029    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2173  formate dehydrogenase, alpha subunit  61.24 
 
 		 803 aa  1043    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.309024  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4090  formate dehydrogenase, alpha subunit  60 
 
 		 1016 aa  1030    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2259  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  55.49 
 
 		 1023 aa  960    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181302  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0777  formate dehydrogenase, major subunit, selenocysteine-containing  46.87 
 
 		 1010 aa  731    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1210  formate dehydrogenase, alpha subunit  57.55 
 
 		 1066 aa  996    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1750  formate dehydrogenase alpha subunit  59.25 
 
 		 1016 aa  1019    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182445 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5531  formate dehydrogenase subunit alpha  57.74 
 
 		 825 aa  971    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1092  formate dehydrogenase, alpha subunit  53.99 
 
 		 811 aa  924    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.525887 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0101  selenium-containing formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit  73.3 
 
 		 1004 aa  1273    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0105  formate dehydrogenase, alpha subunit  80.78 
 
 		 794 aa  1388    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1955  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.63 
 
 		 1009 aa  719    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1818  formate dehydrogenase alpha subunit  56.19 
 
 		 820 aa  954    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.266188 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6560  formate dehydrogenase, alpha subunit  55.06 
 
 		 809 aa  950    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22445  normal  0.0150185 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4119  aerobic formate dehydrogenase subunit alpha  61.32 
 
 		 1015 aa  1057    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0730  formate dehydrogenase, alpha subunit  55.49 
 
 		 822 aa  958    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2698  formate dehydrogenase alpha subunit  54.83 
 
 		 820 aa  939    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2100  formate dehydrogenase alpha subunit  54.87 
 
 		 822 aa  941    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1059  formate dehydrogenase alpha subunit  47.12 
 
 		 1010 aa  729    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.080154 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4280  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  60.12 
 
 		 1016 aa  1031    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0717  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  45.32 
 
 		 798 aa  676    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3513  formate dehydrogenase alpha subunit  43.7 
 
 		 808 aa  649    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3261  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.9 
 
 		 1022 aa  905    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2396  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  55.49 
 
 		 822 aa  958    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0707  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  55.24 
 
 		 1023 aa  953    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3894  formate dehydrogenase, alpha subunit  55.79 
 
 		 1028 aa  964    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3754  formate dehydrogenase alpha subunit  56.4 
 
 		 828 aa  977    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2863  formate dehydrogenase, alpha subunit  54.56 
 
 		 824 aa  915    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.202456  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0523  formate dehydrogenase, alpha subunit  57.23 
 
 		 821 aa  962    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3544  formate dehydrogenase, alpha subunit  55.49 
 
 		 810 aa  952    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4597  formate dehydrogenase, alpha subunit  55.12 
 
 		 810 aa  951    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.654701  normal  0.94372 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0226  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.34 
 
 		 1005 aa  676    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.174026  normal  0.0776388 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2054  formate dehydrogenase alpha subunit  60.37 
 
 		 803 aa  1027    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2591  Formate dehydrogenase  42.55 
 
 		 780 aa  636    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1570  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.71 
 
 		 1014 aa  643    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2553  formate dehydrogenase alpha subunit  55.43 
 
 		 821 aa  954    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0438  formate dehydrogenase, alpha subunit  100 
 
 		 796 aa  1668    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2183  formate dehydrogenase, alpha subunit  61.49 
 
 		 1015 aa  1051    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.668487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4122  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  60 
 
 		 1016 aa  1029    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2533  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.19 
 
 		 1010 aa  659    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  80.65 
 
 		 1004 aa  1390    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4518  formate dehydrogenase, alpha subunit  53.88 
 
 		 810 aa  924    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4382  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  55.36 
 
 		 822 aa  950    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0283  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.44 
 
 		 803 aa  674    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.105016  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2519  formate dehydrogenase, alpha subunit  58.51 
 
 		 1016 aa  1004    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1700  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  61.24 
 
 		 1015 aa  1044    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.3444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0102  formate dehydrogenase alpha subunit  73.68 
 
 		 794 aa  1275    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4085  formate dehydrogenase alpha subunit  60.12 
 
 		 804 aa  1030    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0038  formate dehydrogenase, alpha subunit  61.32 
 
 		 803 aa  1054    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1575  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.63 
 
 		 842 aa  671    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0097  formate dehydrogenase alpha subunit  73.55 
 
 		 794 aa  1273    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3374  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.76 
 
 		 1061 aa  667    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1580  formate dehydrogenase  43.62 
 
 		 808 aa  637    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2267  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.63 
 
 		 802 aa  717    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1655  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  61.37 
 
 		 803 aa  1045    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0662  formate dehydrogenase, alpha subunit  53.82 
 
 		 812 aa  905    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.457174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03810  formate dehydrogenase, alpha subunit  58.76 
 
 		 1018 aa  1007    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1427  formate dehydrogenase, alpha subunit  59.01 
 
 		 1016 aa  1009    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.50627  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3377  formate dehydrogenase, alpha subunit  55.12 
 
 		 822 aa  950    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365346  normal  0.791414 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63605  formate dehydrogenase-O, major subunit  57.86 
 
 		 1026 aa  973    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3984  formate dehydrogenase, alpha subunit  55.36 
 
 		 822 aa  950    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2662  formate dehydrogenase, alpha subunit  61.19 
 
 		 1015 aa  1052    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.613089  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3879  formate dehydrogenase, alpha subunit  55.12 
 
 		 810 aa  950    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.319379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1335  formate dehydrogenase, alpha subunit  61.32 
 
 		 1015 aa  1046    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3770  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  61.32 
 
 		 1015 aa  1057    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0036  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.67 
 
 		 804 aa  700    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0129417  normal  0.222699 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1274  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.81 
 
 		 816 aa  699    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0084  formate dehydrogenase, alpha subunit  60.07 
 
 		 803 aa  1038    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3045  formate dehydrogenase, alpha subunit  59.95 
 
 		 1015 aa  1033    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3510  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.34 
 
 		 1015 aa  693    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.722583  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2089  formate dehydrogenase alpha subunit  68.05 
 
 		 1005 aa  1188    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000081067 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2008  formate dehydrogenase, alpha subunit  55.8 
 
 		 824 aa  958    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.715291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0532  formate dehydrogenase, alpha subunit  56.98 
 
 		 809 aa  960    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.170319  normal  0.968416 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3810  formate dehydrogenase, alpha subunit  55.91 
 
 		 1028 aa  966    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0643  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.77 
 
 		 1012 aa  698    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0165738 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1334  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.99 
 
 		 840 aa  645    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2829  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.47 
 
 		 820 aa  887    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.500302  normal  0.743867 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3325  formate dehydrogenase, alpha subunit  55.4 
 
 		 1023 aa  948    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.723924 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2638  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.9 
 
 		 1059 aa  674    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.409853 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1286  formate dehydrogenase, alpha subunit  60.2 
 
 		 1015 aa  1035    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1557  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  61.24 
 
 		 1015 aa  1044    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.468579  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3490  formate dehydrogenase, alpha subunit  54.88 
 
 		 808 aa  933    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.657613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0761  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.35 
 
 		 1003 aa  650    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.109779  normal  0.059567 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2365  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.09 
 
 		 1005 aa  679    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.1698 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0544  formate dehydrogenase, alpha subunit  56.86 
 
 		 809 aa  960    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0932731 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0099  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  80.53 
 
 		 1004 aa  1389    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1217  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.02 
 
 		 1008 aa  684    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0663541 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0971  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.7 
 
 		 1011 aa  664    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.893461  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4123  molybdopterin oxidoreductase alpha subunit  60 
 
 		 1016 aa  1029    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3388  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.2 
 
 		 1010 aa  713    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0501  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.77 
 
 		 1012 aa  632  1e-180  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.662776 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0813  formate dehydrogenase alpha subunit  42.68 
 
 		 1014 aa  625  1e-178  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0646  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.74 
 
 		 1013 aa  625  1e-178  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166325 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0799  formate dehydrogenase  41.63 
 
 		 851 aa  620  1e-176  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21840  uncharacterized anaerobic dehydrogenase  41.87 
 
 		 835 aa  615  1e-175  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0800968 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1114  formate dehydrogenase  40.88 
 
 		 811 aa  612  1e-173  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11280  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.52 
 
 		 1058 aa  602  1.0000000000000001e-171  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.786 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0555  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.33 
 
 		 1012 aa  601  1e-170  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1682  molydopterin dinucleotide-binding region  42.49 
 
 		 829 aa  597  1e-169  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.373792 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>