More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_1750 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01432  formate dehydrogenase-N, alpha subunit, nitrate-inducible  70.67 
 
 
1015 aa  1569    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03779  formate dehydrogenase-O, major subunit  68.01 
 
 
1016 aa  1510    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2173  formate dehydrogenase, alpha subunit  69.24 
 
 
803 aa  1219    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.309024  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  59.8 
 
 
1004 aa  1307    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4090  formate dehydrogenase, alpha subunit  68.01 
 
 
1016 aa  1511    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0544  formate dehydrogenase, alpha subunit  60.82 
 
 
809 aa  1039    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0932731 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1789  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.57 
 
 
1020 aa  697    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0187  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.2 
 
 
993 aa  677    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125328  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0777  formate dehydrogenase, major subunit, selenocysteine-containing  43.29 
 
 
1010 aa  832    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1210  formate dehydrogenase, alpha subunit  62.65 
 
 
1066 aa  1386    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5531  formate dehydrogenase subunit alpha  62.79 
 
 
825 aa  1084    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11280  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.26 
 
 
1058 aa  737    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.786 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0101  selenium-containing formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit  58.82 
 
 
1004 aa  1276    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2396  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  61.92 
 
 
822 aa  1098    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0099  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  59.9 
 
 
1004 aa  1308    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4119  aerobic formate dehydrogenase subunit alpha  70.15 
 
 
1015 aa  1557    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1818  formate dehydrogenase alpha subunit  62.64 
 
 
820 aa  1103    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.266188 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1700  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  70.87 
 
 
1015 aa  1572    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.3444  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1286  formate dehydrogenase, alpha subunit  77.36 
 
 
1015 aa  1701    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4085  formate dehydrogenase alpha subunit  67.12 
 
 
804 aa  1185    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0730  formate dehydrogenase, alpha subunit  61.92 
 
 
822 aa  1098    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3544  formate dehydrogenase, alpha subunit  61.36 
 
 
810 aa  1071    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287091  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4280  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  68.11 
 
 
1016 aa  1512    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2698  formate dehydrogenase alpha subunit  60.49 
 
 
820 aa  1050    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2100  formate dehydrogenase alpha subunit  61.19 
 
 
822 aa  1084    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6560  formate dehydrogenase, alpha subunit  60.94 
 
 
809 aa  1053    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22445  normal  0.0150185 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1059  formate dehydrogenase alpha subunit  43.86 
 
 
1010 aa  834    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.080154 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0717  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  43.28 
 
 
798 aa  655    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0813  formate dehydrogenase alpha subunit  42.35 
 
 
1014 aa  776    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3513  formate dehydrogenase alpha subunit  44.38 
 
 
808 aa  676    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0038  formate dehydrogenase, alpha subunit  68.49 
 
 
803 aa  1207    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2008  formate dehydrogenase, alpha subunit  61.02 
 
 
824 aa  1066    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.715291  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4122  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  68.01 
 
 
1016 aa  1510    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0707  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  62.56 
 
 
1023 aa  1373    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4271  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.37 
 
 
1016 aa  690    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.12828  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2662  formate dehydrogenase, alpha subunit  77.76 
 
 
1015 aa  1698    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.613089  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1580  formate dehydrogenase  42.1 
 
 
808 aa  643    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3754  formate dehydrogenase alpha subunit  61.12 
 
 
828 aa  1072    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2267  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.04 
 
 
802 aa  701    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1092  formate dehydrogenase, alpha subunit  55.04 
 
 
811 aa  959    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.525887 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2259  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  62.07 
 
 
1023 aa  1368    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181302  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2638  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.63 
 
 
1059 aa  828    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.409853 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3325  formate dehydrogenase, alpha subunit  59.33 
 
 
1023 aa  1283    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.723924 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3261  formate dehydrogenase, alpha subunit  60.06 
 
 
1022 aa  1305    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1692  formate dehydrogenase-O, major subunit  62.13 
 
 
478 aa  637    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2553  formate dehydrogenase alpha subunit  61.27 
 
 
821 aa  1075    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1427  formate dehydrogenase, alpha subunit  74.14 
 
 
1016 aa  1632    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.50627  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3770  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  70.15 
 
 
1015 aa  1557    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4123  molybdopterin oxidoreductase alpha subunit  68.01 
 
 
1016 aa  1510    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0876  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.14 
 
 
1096 aa  640    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0827  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.28 
 
 
1050 aa  639    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.798346  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1335  formate dehydrogenase, alpha subunit  77.46 
 
 
1015 aa  1689    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3374  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.12 
 
 
1061 aa  829    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1557  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  70.77 
 
 
1015 aa  1571    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.468579  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4382  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  61.8 
 
 
822 aa  1091    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4518  formate dehydrogenase, alpha subunit  60.62 
 
 
810 aa  1048    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101955  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1868  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.57 
 
 
1020 aa  697    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2519  formate dehydrogenase, alpha subunit  74.34 
 
 
1016 aa  1634    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3894  formate dehydrogenase, alpha subunit  60.64 
 
 
1028 aa  1317    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1575  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.52 
 
 
842 aa  674    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0102  formate dehydrogenase alpha subunit  57.09 
 
 
794 aa  981    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1217  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.5 
 
 
1008 aa  810    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0663541 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0105  formate dehydrogenase, alpha subunit  58.71 
 
 
794 aa  1012    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3490  formate dehydrogenase, alpha subunit  58.98 
 
 
808 aa  1019    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.657613  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3810  formate dehydrogenase, alpha subunit  60.84 
 
 
1028 aa  1321    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0097  formate dehydrogenase alpha subunit  56.97 
 
 
794 aa  979    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0165  formate dehydrogenase alpha subunit  39.86 
 
 
993 aa  699    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.410725  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0438  formate dehydrogenase, alpha subunit  59.25 
 
 
796 aa  1019    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2183  formate dehydrogenase, alpha subunit  70.77 
 
 
1015 aa  1571    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.668487  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2054  formate dehydrogenase alpha subunit  67.75 
 
 
803 aa  1197    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0021  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.19 
 
 
1084 aa  644    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.12847 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0643  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.11 
 
 
1012 aa  864    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0165738 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0971  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.73 
 
 
1011 aa  817    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.893461  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1955  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.57 
 
 
1009 aa  839    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0872  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.57 
 
 
1096 aa  652    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3377  formate dehydrogenase, alpha subunit  60.95 
 
 
822 aa  1084    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365346  normal  0.791414 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63605  formate dehydrogenase-O, major subunit  62.57 
 
 
1026 aa  1355    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3879  formate dehydrogenase, alpha subunit  60.74 
 
 
810 aa  1066    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.319379  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3984  formate dehydrogenase, alpha subunit  61.8 
 
 
822 aa  1091    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1899  formate dehydrogenase alpha subunit  62.13 
 
 
478 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.275577  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2863  formate dehydrogenase, alpha subunit  58.17 
 
 
824 aa  1009    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.202456  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0036  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.57 
 
 
804 aa  683    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0129417  normal  0.222699 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1274  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.26 
 
 
816 aa  695    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1750  formate dehydrogenase alpha subunit  100 
 
 
1016 aa  2124    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182445 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3510  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.85 
 
 
1015 aa  825    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.722583  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2089  formate dehydrogenase alpha subunit  57.73 
 
 
1005 aa  1256    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000081067 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0084  formate dehydrogenase, alpha subunit  67 
 
 
803 aa  1185    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1655  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  69.49 
 
 
803 aa  1220    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4597  formate dehydrogenase, alpha subunit  61.36 
 
 
810 aa  1076    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.654701  normal  0.94372 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0646  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.98 
 
 
1013 aa  766    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166325 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2829  formate dehydrogenase, alpha subunit  57.42 
 
 
820 aa  999    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.500302  normal  0.743867 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3388  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.92 
 
 
1010 aa  837    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03810  formate dehydrogenase, alpha subunit  73.84 
 
 
1018 aa  1608    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0532  formate dehydrogenase, alpha subunit  60.32 
 
 
809 aa  1028    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.170319  normal  0.968416 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0662  formate dehydrogenase, alpha subunit  56.7 
 
 
812 aa  964    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.457174  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0523  formate dehydrogenase, alpha subunit  60.66 
 
 
821 aa  1051    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0555  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.87 
 
 
1012 aa  751    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2533  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.75 
 
 
1010 aa  802    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0501  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.98 
 
 
1012 aa  783    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.662776 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0761  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.83 
 
 
1003 aa  798    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.109779  normal  0.059567 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>