More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AnaeK_0872 on replicon NC_011145
Organism: Anaeromyxobacter sp. K



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01432  formate dehydrogenase-N, alpha subunit, nitrate-inducible  39.65 
 
 		 1015 aa  699    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03779  formate dehydrogenase-O, major subunit  39.2 
 
 		 1016 aa  698    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0283  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.74 
 
 		 803 aa  636    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.105016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4090  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.2 
 
 		 1016 aa  696    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0187  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.6 
 
 		 993 aa  643    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125328  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0777  formate dehydrogenase, major subunit, selenocysteine-containing  41.59 
 
 		 1010 aa  772    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1217  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.89 
 
 		 1008 aa  719    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0663541 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1210  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.94 
 
 		 1066 aa  736    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1955  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.88 
 
 		 1009 aa  757    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11280  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.64 
 
 		 1058 aa  671    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.786 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0101  selenium-containing formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit  37.83 
 
 		 1004 aa  653    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2183  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.55 
 
 		 1015 aa  697    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.668487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0872  formate dehydrogenase, alpha subunit  100 
 
 		 1096 aa  2261    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4122  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  39.2 
 
 		 1016 aa  698    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3770  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  38.86 
 
 		 1015 aa  687    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2638  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.88 
 
 		 1059 aa  797    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.409853 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_176  molybdopterin oxidoreductase, formate dehydrogenase alpha subunit  37.26 
 
 		 993 aa  635    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000885934  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1059  formate dehydrogenase alpha subunit  40.8 
 
 		 1010 aa  757    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.080154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3728  formate dehydrogenase, alpha subunit  62.96 
 
 		 1063 aa  1317    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0214561  normal  0.0673651 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0813  formate dehydrogenase alpha subunit  38.01 
 
 		 1014 aa  688    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4280  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  39.11 
 
 		 1016 aa  698    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3045  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.45 
 
 		 1015 aa  662    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0165  formate dehydrogenase alpha subunit  37.09 
 
 		 993 aa  646    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.410725  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0707  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  39.54 
 
 		 1023 aa  695    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0824  formate dehydrogenase  96.18 
 
 		 864 aa  1719    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.334882  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4271  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.98 
 
 		 1016 aa  692    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.12828  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0612  formate dehydrogenase, alpha subunit  52.04 
 
 		 1118 aa  1082    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0827  formate dehydrogenase, alpha subunit  47.26 
 
 		 1050 aa  932    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.798346  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4119  aerobic formate dehydrogenase subunit alpha  38.86 
 
 		 1015 aa  687    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1602  Formate dehydrogenase  57.46 
 
 		 956 aa  1001    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5276  formate dehydrogenase, alpha subunit  58.47 
 
 		 1095 aa  1245    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3261  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.65 
 
 		 1022 aa  656    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0099  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  38.28 
 
 		 1004 aa  650    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0860  formate dehydrogenase, alpha subunit  56.97 
 
 		 1039 aa  1153    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3575  molybdopterin dinucleotide-binding region  56.83 
 
 		 883 aa  942    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132394  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0226  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.01 
 
 		 1005 aa  712    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.174026  normal  0.0776388 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0876  formate dehydrogenase, alpha subunit  98.72 
 
 		 1096 aa  2235    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2519  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.93 
 
 		 1016 aa  680    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1789  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.37 
 
 		 1020 aa  666    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2291  formate dehydrogenase  56.63 
 
 		 870 aa  972    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5600  formate dehydrogenase  56.44 
 
 		 861 aa  950    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.758687  normal  0.77171 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1750  formate dehydrogenase alpha subunit  37.57 
 
 		 1016 aa  652    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182445 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2181  molydopterin dinucleotide-binding region  67.38 
 
 		 862 aa  1202    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5220  formate dehydrogenase  56.35 
 
 		 865 aa  952    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.18 
 
 		 1004 aa  649    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2724  formate dehydrogenase  63.93 
 
 		 847 aa  1089    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.820534  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3325  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.21 
 
 		 1023 aa  677    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.723924 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3388  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.6 
 
 		 1010 aa  770    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03810  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.99 
 
 		 1018 aa  667    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5830  formate dehydrogenase  54.26 
 
 		 853 aa  926    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.555184 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1427  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.15 
 
 		 1016 aa  687    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.50627  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3894  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.56 
 
 		 1028 aa  721    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1570  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.16 
 
 		 1014 aa  700    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04200  uncharacterized anaerobic dehydrogenase  57.28 
 
 		 920 aa  983    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0456011 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2259  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  39.73 
 
 		 1023 aa  699    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181302  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1868  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.37 
 
 		 1020 aa  667    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0799  formate dehydrogenase  41.58 
 
 		 851 aa  645    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2662  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.57 
 
 		 1015 aa  669    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.613089  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0344  molybdopterin dinucleotide-binding region  59.45 
 
 		 905 aa  1063    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.632041  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4123  molybdopterin oxidoreductase alpha subunit  39.2 
 
 		 1016 aa  698    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63605  formate dehydrogenase-O, major subunit  38.55 
 
 		 1026 aa  694    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0021  formate dehydrogenase, alpha subunit  61.22 
 
 		 1084 aa  1317    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.12847 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0862  molydopterin dinucleotide-binding region  79.91 
 
 		 861 aa  1430    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0520127 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1286  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.94 
 
 		 1015 aa  666    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3374  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.67 
 
 		 1061 aa  777    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1335  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.1 
 
 		 1015 aa  663    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3510  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.8 
 
 		 1015 aa  748    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.722583  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2089  formate dehydrogenase alpha subunit  37.93 
 
 		 1005 aa  667    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000081067 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0971  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.69 
 
 		 1011 aa  711    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.893461  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2008  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.51 
 
 		 824 aa  639    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.715291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09600  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  55.9 
 
 		 889 aa  947    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1557  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  39.65 
 
 		 1015 aa  699    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.468579  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2533  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.26 
 
 		 1010 aa  743    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0555  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.1 
 
 		 1012 aa  677    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3810  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.48 
 
 		 1028 aa  722    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5308  formate dehydrogenase  56.2 
 
 		 861 aa  945    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.418096  normal  0.849616 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0501  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.88 
 
 		 1012 aa  717    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.662776 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0761  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.55 
 
 		 1003 aa  734    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.109779  normal  0.059567 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2365  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.73 
 
 		 1005 aa  698    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.1698 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19190  formate dehydrogenase, alpha subunit  60.02 
 
 		 1100 aa  1269    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.525812  normal  0.681395 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1700  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  39.55 
 
 		 1015 aa  698    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.3444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0646  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.16 
 
 		 1013 aa  685    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166325 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0643  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.55 
 
 		 1012 aa  721    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0165738 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1575  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.18 
 
 		 842 aa  635  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3754  formate dehydrogenase alpha subunit  40.71 
 
 		 828 aa  619  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1580  formate dehydrogenase  41.38 
 
 		 808 aa  618  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1274  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.53 
 
 		 816 aa  612  1e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3513  formate dehydrogenase alpha subunit  41.45 
 
 		 808 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0036  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.2 
 
 		 804 aa  607  9.999999999999999e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0129417  normal  0.222699 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2863  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.14 
 
 		 824 aa  608  9.999999999999999e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.202456  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2267  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.45 
 
 		 802 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1092  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.42 
 
 		 811 aa  599  1e-170  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.525887 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0523  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.51 
 
 		 821 aa  596  1e-169  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0544  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.03 
 
 		 809 aa  593  1e-168  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0932731 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1114  formate dehydrogenase  39.24 
 
 		 811 aa  593  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1818  formate dehydrogenase alpha subunit  38.9 
 
 		 820 aa  592  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.266188 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0730  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.25 
 
 		 822 aa  591  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2396  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  40.25 
 
 		 822 aa  591  1e-167  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0532  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.63 
 
 		 809 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.170319  normal  0.968416 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4597  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.51 
 
 		 810 aa  587  1e-166  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.654701  normal  0.94372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>