More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_176 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01432  formate dehydrogenase-N, alpha subunit, nitrate-inducible  38.57 
 
 		 1015 aa  700    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03779  formate dehydrogenase-O, major subunit  38.28 
 
 		 1016 aa  686    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4090  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.28 
 
 		 1016 aa  684    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2259  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  38.92 
 
 		 1023 aa  714    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181302  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0187  formate dehydrogenase, alpha subunit  94.16 
 
 		 993 aa  1937    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.125328  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0777  formate dehydrogenase, major subunit, selenocysteine-containing  43.87 
 
 		 1010 aa  836    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1210  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.31 
 
 		 1066 aa  734    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_176  molybdopterin oxidoreductase, formate dehydrogenase alpha subunit  100 
 
 		 993 aa  2052    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000885934  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2533  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.19 
 
 		 1010 aa  763    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3325  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.26 
 
 		 1023 aa  688    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.723924 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0101  selenium-containing formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit  38.91 
 
 		 1004 aa  665    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0643  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.67 
 
 		 1012 aa  776    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0165738 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11280  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.53 
 
 		 1058 aa  638    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.786 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19190  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.46 
 
 		 1100 aa  635    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.525812  normal  0.681395 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0165  formate dehydrogenase alpha subunit  92.75 
 
 		 993 aa  1935    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.410725  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3374  formate dehydrogenase, alpha subunit  42 
 
 		 1061 aa  825    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1059  formate dehydrogenase alpha subunit  43.96 
 
 		 1010 aa  848    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.080154 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1557  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  38.57 
 
 		 1015 aa  700    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.468579  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0813  formate dehydrogenase alpha subunit  40.27 
 
 		 1014 aa  746    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3810  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.63 
 
 		 1028 aa  743    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0860  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.79 
 
 		 1039 aa  674    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0876  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.17 
 
 		 1096 aa  645    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0707  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  39.11 
 
 		 1023 aa  721    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1750  formate dehydrogenase alpha subunit  38.74 
 
 		 1016 aa  674    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00182445 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1868  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.68 
 
 		 1020 aa  672    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1955  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.54 
 
 		 1009 aa  840    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3388  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.47 
 
 		 1010 aa  860    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4123  molybdopterin oxidoreductase alpha subunit  38.28 
 
 		 1016 aa  686    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0646  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.35 
 
 		 1013 aa  723    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166325 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0971  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.02 
 
 		 1011 aa  751    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.893461  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1286  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.74 
 
 		 1015 aa  665    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0555  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.26 
 
 		 1012 aa  709    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4119  aerobic formate dehydrogenase subunit alpha  37.39 
 
 		 1015 aa  675    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3894  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.73 
 
 		 1028 aa  746    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1335  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.01 
 
 		 1015 aa  673    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3261  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.9 
 
 		 1022 aa  684    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0872  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.26 
 
 		 1096 aa  645    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2662  formate dehydrogenase, alpha subunit  37.78 
 
 		 1015 aa  667    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.613089  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1427  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.81 
 
 		 1016 aa  688    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.50627  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2519  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.16 
 
 		 1016 aa  684    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4271  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.39 
 
 		 1016 aa  654    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.12828  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2183  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.76 
 
 		 1015 aa  700    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.668487  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2638  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.04 
 
 		 1059 aa  829    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.409853 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4280  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  38.18 
 
 		 1016 aa  686    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63605  formate dehydrogenase-O, major subunit  38.14 
 
 		 1026 aa  688    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1570  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.33 
 
 		 1014 aa  723    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3770  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  37.39 
 
 		 1015 aa  675    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3045  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.04 
 
 		 1015 aa  665    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0226  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.85 
 
 		 1005 aa  785    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.174026  normal  0.0776388 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3510  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.61 
 
 		 1015 aa  776    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.722583  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2089  formate dehydrogenase alpha subunit  37.14 
 
 		 1005 aa  645    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000081067 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1700  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  38.66 
 
 		 1015 aa  701    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.3444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4122  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  38.28 
 
 		 1016 aa  686    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1789  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.68 
 
 		 1020 aa  672    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0612  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.49 
 
 		 1118 aa  637    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2267  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.96 
 
 		 802 aa  660    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03810  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.22 
 
 		 1018 aa  681    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0501  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.72 
 
 		 1012 aa  739    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.662776 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0761  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.5 
 
 		 1003 aa  761    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.109779  normal  0.059567 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2365  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.59 
 
 		 1005 aa  763    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.1698 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1217  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.25 
 
 		 1008 aa  762    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0663541 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1575  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.19 
 
 		 842 aa  634  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.05 
 
 		 1004 aa  632  1e-180  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0099  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  36.05 
 
 		 1004 aa  632  1e-179  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1334  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.14 
 
 		 840 aa  619  1e-176  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0827  formate dehydrogenase, alpha subunit  36.22 
 
 		 1050 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.798346  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2008  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.27 
 
 		 824 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.715291  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5276  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.47 
 
 		 1095 aa  610  1e-173  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0021  formate dehydrogenase, alpha subunit  34.09 
 
 		 1084 aa  608  9.999999999999999e-173  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.12847 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3754  formate dehydrogenase alpha subunit  41.07 
 
 		 828 aa  608  9.999999999999999e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1580  formate dehydrogenase  41.33 
 
 		 808 aa  603  1.0000000000000001e-171  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2396  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  39.14 
 
 		 822 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0730  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.14 
 
 		 822 aa  593  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3377  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.14 
 
 		 822 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365346  normal  0.791414 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1274  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.34 
 
 		 816 aa  593  1e-168  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3728  formate dehydrogenase, alpha subunit  35.16 
 
 		 1063 aa  595  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0214561  normal  0.0673651 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1818  formate dehydrogenase alpha subunit  39.59 
 
 		 820 aa  591  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.266188 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0799  formate dehydrogenase  38.93 
 
 		 851 aa  589  1e-167  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2698  formate dehydrogenase alpha subunit  39.42 
 
 		 820 aa  587  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0717  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  41.06 
 
 		 798 aa  588  1e-166  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2553  formate dehydrogenase alpha subunit  38.97 
 
 		 821 aa  588  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0523  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.07 
 
 		 821 aa  588  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0036  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.44 
 
 		 804 aa  586  1e-166  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0129417  normal  0.222699 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6560  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.27 
 
 		 809 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22445  normal  0.0150185 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4597  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.34 
 
 		 810 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.654701  normal  0.94372 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0283  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.28 
 
 		 803 aa  583  1.0000000000000001e-165  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.105016  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2100  formate dehydrogenase alpha subunit  38.54 
 
 		 822 aa  582  1e-164  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3513  formate dehydrogenase alpha subunit  39.31 
 
 		 808 aa  581  1e-164  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4382  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  38.56 
 
 		 822 aa  582  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2591  Formate dehydrogenase  38.48 
 
 		 780 aa  580  1e-164  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3984  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.56 
 
 		 822 aa  582  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3879  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.86 
 
 		 810 aa  581  1e-164  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.319379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0544  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.17 
 
 		 809 aa  582  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0932731 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2173  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.85 
 
 		 803 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.309024  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2863  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.11 
 
 		 824 aa  574  1.0000000000000001e-162  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.202456  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1655  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  38.73 
 
 		 803 aa  571  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5531  formate dehydrogenase subunit alpha  39.09 
 
 		 825 aa  569  1e-161  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4518  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.64 
 
 		 810 aa  572  1e-161  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0532  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.51 
 
 		 809 aa  570  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.170319  normal  0.968416 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3544  formate dehydrogenase, alpha subunit  38.4 
 
 		 810 aa  572  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287091  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>