More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2591 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_01432  formate dehydrogenase-N, alpha subunit, nitrate-inducible  43.39 
 
 
1015 aa  671    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03779  formate dehydrogenase-O, major subunit  41.77 
 
 
1016 aa  644    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2173  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.39 
 
 
803 aa  670    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.309024  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4090  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.77 
 
 
1016 aa  642    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0226  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.75 
 
 
1005 aa  681    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.174026  normal  0.0776388 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0777  formate dehydrogenase, major subunit, selenocysteine-containing  50.25 
 
 
1010 aa  825    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1210  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.29 
 
 
1066 aa  671    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1286  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.5 
 
 
1015 aa  635    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1580  formate dehydrogenase  55.88 
 
 
808 aa  927    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0101  selenium-containing formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit  43.18 
 
 
1004 aa  650    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1334  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.4 
 
 
840 aa  718    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3325  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.27 
 
 
1023 aa  649    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.723924 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4280  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  41.77 
 
 
1016 aa  644    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1818  formate dehydrogenase alpha subunit  40.71 
 
 
820 aa  640    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.266188 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2054  formate dehydrogenase alpha subunit  43.14 
 
 
803 aa  657    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2533  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.16 
 
 
1010 aa  676    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3261  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.52 
 
 
1022 aa  642    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0730  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.93 
 
 
822 aa  648    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2698  formate dehydrogenase alpha subunit  40.1 
 
 
820 aa  635    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0271863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2100  formate dehydrogenase alpha subunit  40.56 
 
 
822 aa  643    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1059  formate dehydrogenase alpha subunit  50.12 
 
 
1010 aa  827    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.080154 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1217  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.12 
 
 
1008 aa  689    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0663541 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0717  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  45.86 
 
 
798 aa  702    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0813  formate dehydrogenase alpha subunit  42.74 
 
 
1014 aa  674    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3513  formate dehydrogenase alpha subunit  43.14 
 
 
808 aa  666    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0038  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.57 
 
 
803 aa  646    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0105  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.23 
 
 
794 aa  645    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0707  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  40.61 
 
 
1023 aa  644    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1955  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.69 
 
 
1009 aa  804    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1335  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.24 
 
 
1015 aa  639    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3754  formate dehydrogenase alpha subunit  41.54 
 
 
828 aa  672    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1570  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.55 
 
 
1014 aa  677    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4119  aerobic formate dehydrogenase subunit alpha  41.57 
 
 
1015 aa  647    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3374  formate dehydrogenase, alpha subunit  46.17 
 
 
1061 aa  741    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21840  uncharacterized anaerobic dehydrogenase  43.21 
 
 
835 aa  669    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0800968 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0662  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.71 
 
 
812 aa  639    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.457174  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0643  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.41 
 
 
1012 aa  695    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0165738 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3045  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.75 
 
 
1015 aa  639    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0283  formate dehydrogenase, alpha subunit  54.41 
 
 
803 aa  903    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.105016  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3894  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.18 
 
 
1028 aa  660    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1427  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.78 
 
 
1016 aa  640    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.50627  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1700  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  43.39 
 
 
1015 aa  670    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.3444  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0438  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.55 
 
 
796 aa  636    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4382  formate dehydrogenase, alpha subunit, anaerobic  40.32 
 
 
822 aa  641    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03810  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.36 
 
 
1018 aa  639    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3879  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.07 
 
 
810 aa  639    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.319379  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0102  formate dehydrogenase alpha subunit  43.43 
 
 
794 aa  650    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2638  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.56 
 
 
1059 aa  722    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.409853 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4122  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  41.77 
 
 
1016 aa  644    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0097  formate dehydrogenase alpha subunit  43.3 
 
 
794 aa  649    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2519  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.29 
 
 
1016 aa  639    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0084  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.27 
 
 
803 aa  656    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4123  molybdopterin oxidoreductase alpha subunit  41.77 
 
 
1016 aa  644    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3544  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.69 
 
 
810 aa  641    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.287091  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2863  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.22 
 
 
824 aa  657    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.202456  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1655  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  43.39 
 
 
803 aa  669    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3388  formate dehydrogenase, alpha subunit  49.57 
 
 
1010 aa  805    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0799  formate dehydrogenase  47.16 
 
 
851 aa  764    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4085  formate dehydrogenase alpha subunit  42.14 
 
 
804 aa  652    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1682  molydopterin dinucleotide-binding region  45.56 
 
 
829 aa  660    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.373792 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3377  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.2 
 
 
822 aa  641    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365346  normal  0.791414 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63605  formate dehydrogenase-O, major subunit  41.74 
 
 
1026 aa  645    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3984  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.32 
 
 
822 aa  641    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2267  formate dehydrogenase, alpha subunit  48.82 
 
 
802 aa  790    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0099  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  43.18 
 
 
1004 aa  645    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2396  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  40.93 
 
 
822 aa  648    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0104  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.18 
 
 
1004 aa  646    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0036  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.31 
 
 
804 aa  701    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0129417  normal  0.222699 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1274  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.17 
 
 
816 aa  723    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0971  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.34 
 
 
1011 aa  704    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.893461  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4597  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.56 
 
 
810 aa  646    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.654701  normal  0.94372 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2591  Formate dehydrogenase  100 
 
 
780 aa  1633    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3510  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.57 
 
 
1015 aa  697    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.722583  normal  0.530799 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2089  formate dehydrogenase alpha subunit  42.14 
 
 
1005 aa  636    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000081067 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2183  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.39 
 
 
1015 aa  670    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.668487  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1557  formate dehydrogenase, nitrate inducible, alpha subunit, selenocysteine-containing  43.39 
 
 
1015 aa  670    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.468579  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1114  formate dehydrogenase  50.68 
 
 
811 aa  847    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2259  formate dehydrogenase-O, major subunit, selenocysteine-containing  40.93 
 
 
1023 aa  650    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.181302  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5531  formate dehydrogenase subunit alpha  41.74 
 
 
825 aa  644    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3810  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.3 
 
 
1028 aa  664    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3770  formate dehydrogenase, alpha subunit, selenocysteine-containing  41.57 
 
 
1015 aa  647    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2008  formate dehydrogenase, alpha subunit  43.57 
 
 
824 aa  687    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.715291  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1575  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.8 
 
 
842 aa  724    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2662  formate dehydrogenase, alpha subunit  42.12 
 
 
1015 aa  640    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.613089  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0501  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.98 
 
 
1012 aa  654    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.662776 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0761  formate dehydrogenase, alpha subunit  45.54 
 
 
1003 aa  694    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.109779  normal  0.059567 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2365  formate dehydrogenase, alpha subunit  44.32 
 
 
1005 aa  681    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.1698 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1750  formate dehydrogenase alpha subunit  40.34 
 
 
1016 aa  635  1e-180  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00182445 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2829  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.82 
 
 
820 aa  634  1e-180  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.500302  normal  0.743867 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2553  formate dehydrogenase alpha subunit  39.78 
 
 
821 aa  630  1e-179  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0523  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.05 
 
 
821 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6560  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.8 
 
 
809 aa  628  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22445  normal  0.0150185 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1092  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.55 
 
 
811 aa  628  1e-178  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.525887 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11280  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.33 
 
 
1058 aa  624  1e-177  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.786 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4518  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.17 
 
 
810 aa  623  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101955  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0544  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.93 
 
 
809 aa  625  1e-177  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0932731 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0532  formate dehydrogenase, alpha subunit  39.56 
 
 
809 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.170319  normal  0.968416 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0555  formate dehydrogenase, alpha subunit  41.64 
 
 
1012 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0646  formate dehydrogenase, alpha subunit  40.62 
 
 
1013 aa  602  1.0000000000000001e-171  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166325 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2724  formate dehydrogenase  40.51 
 
 
847 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.820534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>